New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 925901 = | 129 (0.990) | 42 (0.330) +C |
29/296 | 7.2 | 27.1% | noncoding (71/88 nt) | serW | tRNA‑Ser |
? | NC_000913 | = 1097399 | 99 (0.760) | intergenic (+570/+166) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAAT > NC_000913/925752‑926050 | aGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGAtt < 4:873502/151‑1 (MQ=255) gTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTc < 2:383414/151‑1 (MQ=255) cACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGGGGGGGGGGTTCGa > 2:597844/1‑150 (MQ=255) actgccgttaatcctgCTTCGGAATTCACCGGTAACATACTCCACACGCGAGCCATGTTCGCTGCCGAACAGTAAAATAAAATGCGAAAAAAAGGGTCGCATTTTCGTACGAGCTCTGCTTTAAAAATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAAc < 3:381314/136‑1 (MQ=16) gCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAAccc < 2:1153392/150‑1 (MQ=255) cGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCg < 4:1127508/151‑1 (MQ=255) gTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGGGAGGGGGGGGGTTGAAacccccc > 4:91891/1‑149 (MQ=38) aCAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGAt < 4:1267615/150‑1 (MQ=255) aCAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGAt < 2:506506/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGTTCGAAcccccccta > 4:520811/1‑146 (MQ=255) cAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGGGAGGGGGGGGTTCGAAaccccccaac > 2:185904/1‑146 (MQ=255) aGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGc < 2:1316665/151‑1 (MQ=255) tAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCCATACGTTGCCGt > 2:453254/1‑150 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGTTTGAACCCCCGATACGTTGCCGtat > 2:1187766/1‑151 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGTTCGAACCCCCCATACGTTGCCGtat > 4:172421/1‑151 (MQ=255) aGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGGTTGGACCCCCCACACGTTGCCgggt > 4:1048366/1‑148 (MQ=37) aaaTTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATac < 3:29510/151‑1 (MQ=255) aTTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATacac < 2:1122390/151‑1 (MQ=255) 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cATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAAGGGGGGGGTTGAAACCCCGCTACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCg > 3:33929/1‑151 (MQ=21) aTACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGAGTTGAAACCCCCCAACGTTGCCGTATACACA‑CCTTCCCGGCgg > 4:1014333/1‑150 (MQ=21) aCTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTg < 4:419733/150‑1 (MQ=255) aCTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGGGAGGGGGGGGGTTGAAACCCCCATACGTTGCCGTATAAACA‑CTTTCCAggggggc > 2:826875/1‑146 (MQ=21) ccACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGTTTGAACCCCCGATACGGTTCCGTATAAACA‑CTTTTCCGGCGTGCTcc > 4:1137106/1‑151 (MQ=21) 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tcttctTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAg < 1:25712/151‑1 (MQ=255) cttcttTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGGTCGAACCCCCCATACGTTTCCGTATACACA‑ATTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCCCTCCGACACCCCACCAAAATGTTTTTCTACCAAACCTCATGGGGGGCAACGGGGGGCTACTATAgg > 4:1039814/1‑151 (MQ=18) ttcttTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAggg < 1:552032/151‑1 (MQ=255) tcttTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGTTCGCACCCCCGATACGTTTCCGTATAAACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCCGCCACCCGGACACCCCACCCAATTTTTTTTCTACCAAACCCCATGGGTGGCAACGGGGGGCCACTATAgggg > 3:86431/1‑150 (MQ=17) tcttTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAggg < 2:711503/150‑1 (MQ=255) ttAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGa < 2:1400797/148‑1 (MQ=255) ttAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGa < 4:185907/148‑1 (MQ=255) aaaTATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTgg < 2:1322656/151‑1 (MQ=255) aaTATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGa < 4:169846/151‑1 (MQ=255) atatGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAg < 4:698761/151‑1 (MQ=255) atGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAGCCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACTCCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTa < 2:650024/151‑1 (MQ=255) atGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGt < 4:602001/150‑1 (MQ=255) ggC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTaa > 2:1018618/1‑150 (MQ=255) c‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAAc < 2:1093997/151‑1 (MQ=255) c‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAAc < 4:1269761/151‑1 (MQ=255) ggTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACg < 2:902358/151‑1 (MQ=255) gTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACgg > 4:696273/1‑151 (MQ=255) aGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTc > 2:219941/1‑150 (MQ=255) ggggggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaag > 3:66612/1‑151 (MQ=255) ggggggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaag < 2:1014338/151‑1 (MQ=255) gggggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCaaga < 2:172419/151‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAagaaga < 2:923468/151‑1 (MQ=255) | AGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTCACAGGTAACATACTCCACCCGCCCACCATGTTCACTGCCGTACAGACAGATAAAATGCGAAAAAAAAGCTCGCACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGATTCGAACCCCCGATACGTTGCCGTATACACA‑CTTTCCAGGCGTGCTCCTTCAGCCACTCGGACACCTCACCAAATTGTTTTGCTACCAAACCTCATGGGTGGCAACGGGGCGCTACTATAGGGAGTTGGAGTAAAACGGTCAAGAAGAAT > NC_000913/925752‑926050 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |