| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,598,297 | T→G | intergenic (‑310/+320) | yneO ← / ← lsrK | pseudogene, AidA homolog/autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,598,297 | 0 | T | G | 100.0% | 24.5 / NA | 8 | intergenic (‑310/+320) | yneO/lsrK | pseudogene, AidA homolog/autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (5/3); total (5/3) | |||||||||||
ACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATAAAATAAGG > NC_000913/1598152‑1598442 | aCTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTta > 2:318682/1‑151 (MQ=255) ttGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAAc < 2:22044/151‑1 (MQ=255) tCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAACTGtttctttc < 2:270748/151‑1 (MQ=255) gtTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAAtt > 2:22464/1‑151 (MQ=255) cTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCAc < 1:145067/150‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTg > 2:302940/1‑151 (MQ=255) gAGTTATTGTGGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATaaaa > 1:306983/1‑151 (MQ=255) aTTGTGGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATAAAATAAgg > 1:241106/1‑151 (MQ=255) | ACTTATTAAATTGTCAGAGGTCTGTATTGAGTGTTAGTTGGAGGTGGGAAGGTGTCAATTTGGCTAATTTGCTAATGCTTTCGAATTGATAGATTAAAAATTGCATAGTTCTTATTTTATTTAAATATGAACTATGAGTTATTGTTGCTTAATAAGAAAACTGTTTCTTTCAATAGGAAAATTATCATCATCATATTTAACAAAGAATAGCACTAATTGCTAAAAATCGAAGTTTATTAAACCCCTTTTGCATCCATTAGTGTCTTTAGGAATATTCGCTATAAAATAAGG > NC_000913/1598152‑1598442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |