| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1622333 | 1678 (36.190) | 16 (0.360) | 11/280 | 1.7 | 0.91% | coding (1002/1188 nt) | ydeE | putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 1622355 | 1882 (42.910) | coding (1024/1188 nt) | ydeE | putative transporter | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 2035 total aligned reads displayed.
ATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAG > NC_000913/1622205‑1622504 | ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 2:585768‑M2/1‑150 (MQ=255) ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:598936‑M2/1‑150 (MQ=255) ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:353158‑M2/1‑150 (MQ=255) ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTAACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATGTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 2:61182‑M2/1‑150 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 2:333729‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 2:303626‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 2:439939‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 1:696717‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 1:300144‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 2:83081‑M2/1‑149 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATATTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 2:245780‑M2/1‑149 (MQ=255) ttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgct > 1:435310‑M2/1‑148 (MQ=255) tCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgctgg < 2:671915‑M2/150‑6 (MQ=255) cAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTgg < 2:713135/150‑1 (MQ=255) aCAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGCATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTg > 1:139531/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGc > 1:269034/1‑150 (MQ=255) gCCTGATATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGCCCTCCTTTCTTCGCCGGGCGCGTCTCTGTTGCTTGCCCCTCTTGCGCCGCCCGCCCTGCACGCCCGCTCTTTTTCCGCCCCGTCTTTCGGCTGGCTTGGTGCcg > 2:21912/1‑150 (MQ=255) ccTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGc < 1:328626/147‑1 (MQ=255) 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ggTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTag > 2:642141/1‑151 (MQ=255) gTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTag < 2:283429/150‑1 (MQ=255) gTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTag < 2:601782/150‑1 (MQ=255) gTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTag < 2:157179/150‑1 (MQ=255) tATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATCTGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTagtg > 1:204321/1‑151 (MQ=255) 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atatTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATtg > 1:100141/1‑150 (MQ=255) atTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATtgctg < 2:209136/151‑1 (MQ=255) ccAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGc < 2:513306/151‑1 (MQ=255) ccAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGc < 2:385434/151‑1 (MQ=255) ccAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAg < 1:96564/150‑1 (MQ=255) 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cccAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTTAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGAc < 1:175086/150‑1 (MQ=255) cccAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGAc < 2:630403/150‑1 (MQ=255) cccAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGAc < 1:491880/150‑1 (MQ=255) cccAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGAc < 2:704066/150‑1 (MQ=255) cAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGt > 1:523144/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:372087/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:734987/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 1:662907/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:505361/1‑151 (MQ=255) tttAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTggggg < 2:326333/151‑1 (MQ=255) ttAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGc < 2:195050/151‑1 (MQ=255) | ATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAG > NC_000913/1622205‑1622504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |