| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,471,274 | C→A | G19V (GGC→GTC) | tufA ← | translation elongation factor EF‑Tu 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,471,274 | 0 | C | A | 98.7% | 281.4 / NA | 75 | G19V (GGC→GTC) | tufA | translation elongation factor EF‑Tu 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (31/43); total (32/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACGTGAGAAGTGTTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAAT > NC_000913/3471126‑3471420 | aaCGTGAAATGTGTTGATGGGAAAACCCGGACCTTTTTCTTCCGGCGCGTTTTGGATCTGTGCGATTGCTCGAGCAGCAGCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACg < 1:139550/151‑1 (MQ=14) agaAGTTTTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGt < 1:313849/150‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATGGTGATCCCAGGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGTTATGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTAcg < 1:219952/151‑2 (MQ=255) aaGTGTTGATGGTGATCCCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTAc < 1:731266/150‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTAc < 2:438558/150‑1 (MQ=255) gtgtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCaa > 1:474168/1‑151 (MQ=255) gtgtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCaa > 1:381905/1‑151 (MQ=255) gtgtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCaa > 1:179108/1‑151 (MQ=255) gtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACg > 1:584106/1‑151 (MQ=255) gtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACg > 2:383104/1‑151 (MQ=255) gtTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACg > 1:699534/1‑151 (MQ=255) ttGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACg < 2:502645/150‑1 (MQ=255) gATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTa > 2:439224/1‑151 (MQ=255) tGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTaa > 2:55941/1‑150 (MQ=255) tGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTaa > 2:4560/1‑150 (MQ=255) ggTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTATGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACg > 1:530309/1‑151 (MQ=255) ttGATACCCCGAGCTTTTTCTCCCGGCGCTTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACg < 1:373992/149‑1 (MQ=255) gTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACg < 1:369817/150‑1 (MQ=255) gAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGCCAACGTGGCCGATAGTACCAAAGTTAACGTGCGGTTTTGt > 1:561054/1‑151 (MQ=255) aGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTa > 2:629044/1‑151 (MQ=255) cTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTAc < 1:599004/150‑1 (MQ=255) cTTTTTCTCCCGGCGCGTTCTCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTa < 1:384748/149‑1 (MQ=255) ttcCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGGGCAGAACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAAt < 1:452505/151‑1 (MQ=255) gTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTa > 1:270624/1‑151 (MQ=255) ttATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAg > 1:88177/1‑151 (MQ=255) aTCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGac < 1:350784/151‑1 (MQ=255) gATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACg > 1:58863/1‑151 (MQ=255) aTCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACgg > 1:714822/1‑151 (MQ=255) gTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCtata > 1:286410/1‑151 (MQ=255) tCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTatat < 1:553453/151‑1 (MQ=255) tCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTatat < 2:670896/151‑1 (MQ=255) aaTGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTc < 2:44049/150‑1 (MQ=255) aaTGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTc < 2:663878/150‑1 (MQ=255) cACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTAc < 1:478851/151‑1 (MQ=255) cACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTAc < 2:257896/151‑1 (MQ=255) aCGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACt < 1:4560/151‑1 (MQ=255) gAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtat > 1:397092/1‑151 (MQ=255) agcagcACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtata > 1:621268/1‑151 (MQ=255) agcagcACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtat < 2:283256/150‑1 (MQ=255) agcagcACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtat < 2:727617/150‑1 (MQ=255) agcagcACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtat < 1:26293/150‑1 (MQ=255) agcagcACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACtat < 1:123270/150‑1 (MQ=255) cagcaCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAg < 1:436110/150‑1 (MQ=255) ccccgccgTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGGTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACCCGGCTATATTCCTGACTATAGTGc < 1:326286/148‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTg < 2:545020/149‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:485937/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:15730/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:74433/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:623208/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:251116/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 1:626141/150‑1 (MQ=255) caCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGc < 2:715622/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGctc < 1:373112/151‑1 (MQ=255) ccgTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTcc > 2:227233/1‑150 (MQ=255) tAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCt < 2:259869/150‑1 (MQ=255) ggTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCa > 2:187009/1‑151 (MQ=255) gTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTc < 1:253026/149‑1 (MQ=255) gTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTc < 2:184713/149‑1 (MQ=255) ttttAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAgg < 2:669376/151‑1 (MQ=255) ttttAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAgg < 2:65280/151‑1 (MQ=255) aGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGgagag > 1:201641/1‑151 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGgagag < 1:579365/149‑1 (MQ=255) gTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCa > 2:534430/1‑150 (MQ=255) gTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCa > 1:257403/1‑150 (MQ=255) gTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAAccc < 2:663710/150‑1 (MQ=255) gagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg > 1:601083/1‑151 (MQ=255) gagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg > 1:631752/1‑151 (MQ=255) gagTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg > 2:76767/1‑151 (MQ=255) gtagtTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAgg > 1:651584/1‑149 (MQ=255) tagtTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGc < 1:519904/149‑1 (MQ=255) tagtTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCtt > 2:497397/1‑151 (MQ=255) gtTTTACCGTGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTAt > 2:182784/1‑151 (MQ=255) tGGTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACgg > 2:574356/1‑151 (MQ=255) ggTCAACGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACggg > 2:66817/1‑151 (MQ=255) aCGTGGACGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTGCGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTG‑‑CTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAAt < 2:396147/151‑1 (MQ=255) | AACGTGAGAAGTGTTGATGGTGATACCACGAGCTTTTTCTTCCGGCGCGTTATCGATCTGGTCGAATGCACGAGCAGCACCGCCGTAGGTTTTAGCCAGTACGGTGGTGATTGCAGCGGTCAGAGTAGTTTTACCGTGGTCAACGTGGCCGATAGTACCAACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGGCTATATTCCTTACTATAGTGCTCTCCCCTTCAGGAGAGAGCACGGGACTTTGGTATTAACCCTTAGGCTTATTTACCACGGGCTTCAAT > NC_000913/3471126‑3471420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |