| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 1993 = | NA (NA) | 160 (0.020) | 21/148 | NT | 8.3% | intergenic (+226/+100) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2021 = | 1924 (0.190) | intergenic (+254/+72) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 4637 total aligned reads displayed.
ATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTA > NC_012417/1931‑2111 | ttccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgac > 1:4200365‑M2/91‑91 (MQ=255)ttccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgac > 2:4294366‑M2/91‑91 (MQ=255)ttccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgac < 1:3148859‑M2/1‑1 (MQ=255)ttccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgac > 2:2478541‑M2/91‑91 (MQ=255) tccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCa < 1:2647762‑M2/2‑1 (MQ=255) tccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCa > 1:226562‑M2/90‑91 (MQ=255) tccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCa < 1:4754633‑M2/2‑1 (MQ=255) tccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCa > 1:1645012‑M2/90‑91 (MQ=255) tccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCa < 1:4028182‑M2/2‑1 (MQ=255) ccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAt > 2:3277991‑M2/89‑91 (MQ=255) ccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAt > 2:2313063‑M2/89‑91 (MQ=255) ccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAt > 1:2729662‑M2/89‑91 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt > 1:3542351‑M2/88‑91 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt < 1:3244600‑M2/4‑1 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt < 2:3370283‑M2/4‑1 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt > 1:2816212‑M2/88‑91 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt > 1:1002011‑M2/88‑91 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt < 2:2086809‑M2/4‑1 (MQ=255) caattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCAtt < 1:1429213‑M2/4‑1 (MQ=255) aattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTc > 1:3461755‑M2/87‑91 (MQ=255) attgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCg < 1:727674‑M2/6‑1 (MQ=255) attgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCg > 2:1282973‑M2/86‑91 (MQ=255) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑a < 2:3084922/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑a < 1:3032084/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑a < 2:4851170/91‑1 (MQ=34) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑a < 1:4980851/91‑1 (MQ=34) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGACCCATTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑aa < 2:1746353/91‑2 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac > 1:4587039‑M2/1‑90 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac < 1:5777521‑M2/91‑2 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac < 1:5585081‑M2/91‑2 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac > 1:610960‑M2/1‑90 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac < 2:1401048‑M2/91‑2 (MQ=255) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Ac > 2:1519770‑M2/1‑90 (MQ=255) cGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Aca > 2:1176506‑M2/1‑89 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaa < 1:449645‑M2/91‑4 (MQ=255) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCATAACTAAACTTGCAGACGAAGGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaa > 1:1952353‑M2/1‑88 (MQ=255) gagaAAACTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaa > 1:4671811‑M2/1‑88 (MQ=255) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACGTGCAGACGAATGTCGGCTTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaagt > 2:3492733‑M2/1‑86 (MQ=255) ccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgcagacgaatgtcgGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGt < 1:3728‑M2/37‑1 (MQ=255) aaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaagtt > 2:5422634‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaagttt < 2:393558‑M2/91‑8 (MQ=255) gTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGTTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑Acaag < 1:4863985‑M2/76‑5 (MQ=255) gtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGTCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATaaa > 2:5289591‑M2/37‑91 (MQ=255) gcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 2:5168667‑M2/25‑91 (MQ=255) gcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 2:5048909‑M2/25‑91 (MQ=255) CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:2433773‑M2/1‑91 (MQ=255) CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 2:5520521‑M2/1‑91 (MQ=255) CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:2348188‑M2/1‑91 (MQ=255) CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 2:4188165‑M2/1‑91 (MQ=255) CATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGa < 1:3628626‑M2/85‑1 (MQ=255) ATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:3710598‑M2/91‑1 (MQ=255) ATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:902975‑M2/91‑1 (MQ=255) ATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 1:4122894‑M2/91‑1 (MQ=255) tAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 1:2526049/91‑1 (MQ=33) tAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg > 2:2380058/1‑91 (MQ=33) tAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGGAAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 2:1061498/91‑1 (MQ=16) aGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGt < 1:1324406/91‑1 (MQ=34) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATCAATAGTAt > 2:5637976/1‑91 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt < 2:778053/91‑1 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:2050318/1‑91 (MQ=37) tcacgCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc > 1:5107699/5‑91 (MQ=255) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 2:2197537/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 2:3837896/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 2:4957585/91‑1 (MQ=38) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt < 1:1753230/91‑1 (MQ=39) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt < 1:3359917/91‑1 (MQ=39) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGATGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa < 2:2736911/91‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:5300796/1‑91 (MQ=40) aGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa < 2:4065848/91‑1 (MQ=255) aGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa > 2:1636280/1‑91 (MQ=255) aGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa < 1:3942496/91‑1 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCACTAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa > 2:1841437/1‑91 (MQ=255) tATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGCGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGt < 1:4297319/91‑1 (MQ=255) aTTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTa < 2:669299/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCGACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATGTAAAGTaa > 2:3619453/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 2:2984135/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:538448/1‑91 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc < 2:4713834/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:837388/91‑1 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 2:4377034/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 2:4619672/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:550613/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:937137/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:3818470/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 2:2589917/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTTGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 2:2858823/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:1124578/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:5201946/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa > 1:4391354/1‑91 (MQ=255) cGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa > 1:2153486/1‑91 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt > 2:1966101/1‑91 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt > 1:5662051/1‑91 (MQ=255) aCCATTCG‑‑‑ACACGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt < 2:5855131/91‑1 (MQ=255) aCCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt < 1:1841622/91‑1 (MQ=255) aCCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt > 2:5739246/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:1515595/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 2:4484366/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:120533/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:2912939/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 2:3172817/91‑1 (MQ=255) | ATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTA > NC_012417/1931‑2111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |