| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,211,248 | A→T | 5.4% | intergenic (+241/+572) | USA300HOU_RS11275 → / ← yidC | hypothetical protein/Membrane protein insertase YidC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,211,248 | 0 | A | T | 5.4% | 861.5 / 14.2 | 259 | intergenic (+241/+572) | USA300HOU_RS11275/yidC | hypothetical protein/Membrane protein insertase YidC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (125/114); new base T (6/11); total (133/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGC > USA300TCH1516_ALE/2211158‑2211338 | gCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACt > 1:5786167/1‑91 (MQ=255) gCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACt > 1:2074532/1‑91 (MQ=255) cTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACtt < 2:4753293/91‑1 (MQ=255) tgtgatgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTGTAGAGGGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTg < 2:3385955/89‑1 (MQ=17) atgatgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGa < 1:529508/91‑1 (MQ=255) gatgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATg > 2:5586103/1‑91 (MQ=16) gatgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATg < 1:278947/91‑1 (MQ=255) tgtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTa > 1:1041685/1‑91 (MQ=255) tgtgGCATTGAGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTa < 1:5822344/91‑1 (MQ=255) gtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTGTGGTCAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAg < 2:1654057/91‑1 (MQ=255) gtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAg > 1:4799654/1‑91 (MQ=255) gtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAg < 1:2226938/91‑1 (MQ=255) ggCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCCCGATGCGCCTTGATgtggtg > 2:488210/1‑91 (MQ=255) ggCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTg < 1:1602298/91‑1 (MQ=255) ggCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTg > 1:2563052/1‑91 (MQ=255) cATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGGTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCt < 1:2007990/91‑1 (MQ=255) aTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTa < 1:3356948/91‑1 (MQ=255) aTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTa < 1:5223755/91‑1 (MQ=255) aTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGATGCTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGCCTTGATGTAGTGCTa > 2:1478908/1‑91 (MQ=255) gCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTCGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTatga > 1:4933617/1‑91 (MQ=255) ggtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTatgatg > 1:2724976/1‑91 (MQ=255) ggtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTatgatg > 1:5551122/1‑91 (MQ=255) ggtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTatgatg > 1:1901853/1‑91 (MQ=255) gtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGAtgt > 1:5093164/1‑91 (MQ=255) gtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGAtgt < 1:389305/91‑1 (MQ=255) gcgttatggtgttgtAGTGAGGGTTGGGGGTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTAGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGAtgt < 2:2870455/89‑1 (MQ=14) ggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTg > 1:2476403/1‑91 (MQ=255) gtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGc < 1:1016255/91‑1 (MQ=255) tgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCg > 1:535071/1‑91 (MQ=255) tataGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtg > 1:4814436/1‑91 (MQ=255) tgtcAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgtta < 1:5642363/88‑1 (MQ=255) aGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgtta < 1:5485764/91‑1 (MQ=255) tgggggTTT‑GCGGTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatg < 2:2112185/87‑1 (MQ=11) gACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttat > 2:2028296/1‑91 (MQ=255) aCAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatg > 1:1095491/1‑91 (MQ=255) cAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatgg > 1:980750/1‑91 (MQ=255) ggTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtg > 2:5202430/1‑91 (MQ=255) ggTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtg > 1:1490941/1‑91 (MQ=255) ggTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtg > 1:3105777/1‑91 (MQ=255) tttGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTCGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgtt > 2:1877750/1‑91 (MQ=255) tttGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgtt > 1:3610176/1‑91 (MQ=255) tttGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgtt > 1:4567671/1‑91 (MQ=255) ttGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgtta < 1:4074264/91‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGc < 2:4260508/74‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGc > 1:4260508/1‑74 (MQ=255) ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTtata > 2:3653565/1‑91 (MQ=255) ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTtata < 2:1571472/91‑1 (MQ=255) gCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAg > 1:3720519/1‑91 (MQ=255) gCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAg > 1:5408557/1‑91 (MQ=255) gCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATGGCGGTGTTATGGTGTtgtat > 2:2654998/1‑90 (MQ=255) gTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGAc > 1:2916275/1‑91 (MQ=255) gATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCgg > 2:5357921/1‑91 (MQ=255) gATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGCTATGGTGTTATAGACCgg > 2:2939816/1‑91 (MQ=255) tGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGtt < 1:1671015/91‑1 (MQ=255) tGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGtt < 2:4567671/91‑1 (MQ=255) aTGTTCCTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgat > 2:5734215/1‑91 (MQ=255) aTGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgat > 2:1336850/1‑91 (MQ=255) gctACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgt > 2:5073427/3‑91 (MQ=12) ttACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgtt < 2:537706/91‑1 (MQ=255) cTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgttgat > 1:2163776/1‑91 (MQ=255) tttGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgttgatg > 2:3735448/1‑91 (MQ=255) tttGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttggtgttgatg > 2:2558764/1‑91 (MQ=255) tgatgtgatgGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGcc < 1:4643389/91‑1 (MQ=255) tGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgttat < 1:1331608/69‑1 (MQ=35) tGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGcc < 2:2586001/91‑1 (MQ=255) gATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGcc > 2:628146/1‑90 (MQ=255) gATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGcc < 1:628146/90‑1 (MQ=255) gATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCa < 2:410578/91‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATg < 2:1022832/91‑1 (MQ=255) gtgCTGGTACCACGATGCGACTTGGTGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGt < 2:390315/91‑1 (MQ=255) gtgCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGt < 1:3255575/91‑1 (MQ=255) gtgCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGt < 1:320830/91‑1 (MQ=255) gCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTgg < 2:5262043/41‑1 (MQ=38) cTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGttgt > 2:1427531/1‑89 (MQ=255) cTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGttgc > 2:2803189/1‑89 (MQ=255) cTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTAc > 1:5021494/1‑91 (MQ=255) gTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACttt < 1:488210/91‑1 (MQ=255) tACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTg < 2:1734922/91‑1 (MQ=255) tACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTg > 1:3409978/1‑91 (MQ=255) aCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAg < 1:4041149/59‑1 (MQ=35) aCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGa < 1:1787929/91‑1 (MQ=255) aCCACGATGCGACTTGATGCAGTGCAATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGATATAGACCGGTATGATGTTGATGCCACGTTACTTTGa > 1:25802/1‑91 (MQ=14) ccACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAt > 1:769633/1‑91 (MQ=255) cACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCa < 1:422577/78‑1 (MQ=255) aCGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtgt > 2:132603/1‑91 (MQ=255) aCGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtgt < 1:1851825/91‑1 (MQ=255) cGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgtta < 1:3076347/52‑1 (MQ=38) cGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATCGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtgtg < 1:4487113/91‑1 (MQ=255) cGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtgtg < 1:1213220/91‑1 (MQ=255) tGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGt < 2:807626/76‑1 (MQ=255) tGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACt < 2:3340880/80‑1 (MQ=255) tGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTg < 1:3735448/91‑1 (MQ=255) gCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTgg < 2:5223457/91‑1 (MQ=37) gCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTgg < 2:496478/91‑1 (MQ=255) gCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTgg < 1:5577988/91‑1 (MQ=255) cGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGt > 1:4130928/1‑91 (MQ=255) cGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGt < 1:1585918/91‑1 (MQ=255) gACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTg < 1:3289866/91‑1 (MQ=255) gACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTACGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTg < 1:5175777/91‑1 (MQ=255) aCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGc > 1:194524/1‑91 (MQ=255) | GTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGC > USA300TCH1516_ALE/2211158‑2211338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |