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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 548 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGAGAACGAGTTTCTTTTTGTCTTGATACTATATAGAAATAAATAGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGAc < 2:159605/141‑1 (MQ=255) ttttgtGAAAGTAGTGTTAACTAGTTTCTTCTTGTATTGATACTAAATAGAAATATTGTGATTTACTATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGATGTTATACTTGGTGTTGGGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaa < 2:64987/141‑1 (MQ=255) taatttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTTTTGTATTATTACTATATAGAAATAACTCGATTGTATATAGATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTATCCGTGTAGTTCTGCGTGAAAGGAAAATTTGAAAAGaaa < 2:7711/138‑1 (MQ=255) tttttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATAAAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaa < 1:58846/141‑1 (MQ=255) ttttAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaaaa < 1:256984/141‑1 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 2:367525‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 1:17568‑M1/1‑4 (MQ=255) aaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaatt > 2:321371‑M1/1‑3 (MQ=255) aaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttataacctgctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaatt > 1:150983‑M1/1‑3 (MQ=255) aaCGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCa < 2:38412/141‑1 (MQ=255) cGAGTGTGAACGAgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaattaa < 2:208809‑M2/141‑129 (MQ=255) | ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |