| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,213,105 | G→A | 5.6% | F105F (TTC→TTT) | thiE ← | Thiamine‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,213,105 | 0 | G | A | 5.6% | 204.2 / 3.5 | 71 | F105F (TTC→TTT) | thiE | Thiamine‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/28); new base A (2/2); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.60e-01 | |||||||||||
CTACTGGTATATGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAATTCT > USA300TCH1516_ALE/2212972‑2213243 | cTACTGGTATATGCGCGTCATGCTTGGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCCACACCTATACAAGCTACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTACTACTCAGTCCAATAATTTTCTCCCTGACATAtt > 2:138684/1‑141 (MQ=255) tACTGGTATATGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATtg < 1:138073/141‑1 (MQ=255) gattGGTATTTGCGAGTCATGATTCTACGGCTTAGTATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAATTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATtg < 2:560456/138‑1 (MQ=255) atGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTAtctc > 2:98794/1‑141 (MQ=255) tGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGCAATATTGTGCTATctct > 1:28587/1‑141 (MQ=255) tGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATctct > 1:189880/1‑141 (MQ=255) cgcgTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAACTCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTCTCAGTGAAATATTGTGCTATCTCttt > 1:100766/1‑141 (MQ=255) tcTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATTAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCg < 2:91508/140‑1 (MQ=255) gcgtCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCg < 1:310603/138‑1 (MQ=255) gCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTATGCTATCTCTTTGACTTTct > 2:631539/1‑140 (MQ=255) cTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGc > 1:209540/1‑141 (MQ=255) cgtcGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATCATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCatcatc < 2:469977/138‑1 (MQ=255) cGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCGAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCatcatc > 1:174183/1‑141 (MQ=255) cGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCatcatc > 1:100846/1‑141 (MQ=255) gTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGa > 2:463792/1‑141 (MQ=255) gTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGa > 1:559520/1‑141 (MQ=255) gTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGa < 1:342073/141‑1 (MQ=255) ggATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCg < 1:137281/141‑1 (MQ=255) gATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGa > 1:294622/1‑141 (MQ=255) tCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATAcc < 1:564900/141‑1 (MQ=255) tCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATAcc < 1:557384/141‑1 (MQ=255) accAACACCTATATAATCGACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATAcc < 2:99704/140‑1 (MQ=255) cTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGCCATGTATACCACCCGCGt > 2:392873/1‑141 (MQ=255) tatataATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGtt < 1:385664/141‑1 (MQ=255) aTCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCAGCGTTAATTTc > 1:13041/1‑141 (MQ=255) cAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTTACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCtt > 1:15794/1‑141 (MQ=255) cAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTAAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCtt > 2:401752/1‑141 (MQ=255) cAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTAAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCtt > 2:218445/1‑141 (MQ=255) aCATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCtttt < 1:98794/141‑1 (MQ=255) cATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTg > 1:154945/1‑141 (MQ=255) cATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTg > 1:454537/1‑141 (MQ=255) aTGAGTTAAATCAGATTTCGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGc < 1:248594/141‑1 (MQ=255) gggatAAACCAGATATTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTATATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCa < 1:462744/137‑1 (MQ=255) aGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCaa > 1:63894/1‑141 (MQ=255) aGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCaa > 1:325627/1‑141 (MQ=255) gTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCCAAATGACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTTACCGACATGTATACCATCAGCGTTAATTTCTTTTGCCAAg > 2:232547/1‑141 (MQ=255) aaTCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATa > 1:447902/1‑141 (MQ=255) cAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATAcat < 1:380603/141‑1 (MQ=255) cAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATAcat > 1:509315/1‑141 (MQ=255) aGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATAcatc < 1:455819/141‑1 (MQ=255) gATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGAACGACAGATATACCATCCACGTTCATTTCTTTTGCCAAGGATAcctca > 2:453532/1‑141 (MQ=255) tGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCAtt > 1:512279/1‑141 (MQ=255) cTCACCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCTTCATCTTGTCTGATATGTATACCATCTGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGAt < 1:594097/141‑1 (MQ=255) cATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGCATACATCATCATTAACGATaa > 2:221183/1‑141 (MQ=255) tCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATataa > 1:518736/1‑141 (MQ=255) tCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATTAAAGGcaca > 2:447366/1‑141 (MQ=255) tCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGcaca < 2:497966/141‑1 (MQ=255) aCTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCACGGATACATCATCATTAACGATACAACGCACATCATATtg > 2:255000/1‑141 (MQ=255) cTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATCAAAGGCACATCATATtga > 1:210665/1‑141 (MQ=255) cTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATtga > 1:511848/1‑141 (MQ=255) cTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATtga < 2:277912/141‑1 (MQ=255) tAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTCACGATAAAAGGCACATCCTATtgat > 1:576867/1‑141 (MQ=255) tAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATtgat < 1:463792/141‑1 (MQ=255) aGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATtgatga > 1:364966/1‑141 (MQ=255) aGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCGTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATtgatga > 1:324571/1‑141 (MQ=255) aataatTTTATCAGTAAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACagag < 1:401752/141‑1 (MQ=255) aataatTTTATCAGTAAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACagag < 1:218445/141‑1 (MQ=255) ataatTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAgaga > 2:419912/1‑141 (MQ=255) ataatTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAgaga > 1:421765/1‑141 (MQ=255) aatTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAAGGATAAAAGGCACATGATATTGATGACAgagagg > 1:197751/1‑139 (MQ=255) aatTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTTATGACagcaatg > 1:614145/1‑136 (MQ=255) tttGTCACTGAAATAGTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTg < 2:189880/141‑1 (MQ=255) tttATCAGTGAAAGATTGTGCTATCGCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTg < 2:28587/141‑1 (MQ=255) ttctgcgTGAAATGTTGTGCTATCTCTGTGATCGTCGGATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAAGTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGt < 2:100766/135‑1 (MQ=255) ttATCAGTGAAATAGTGCGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGt < 1:48643/141‑1 (MQ=255) tATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTa > 2:347370/1‑141 (MQ=255) aTCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGAGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTaa < 2:246725/141‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAAt < 1:414678/141‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAAt < 2:509315/141‑1 (MQ=255) aGTGAGATATTGTGCTATCGCTTTGAGTTTCGCATCTTCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAATTc < 2:282127/141‑1 (MQ=255) gTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAATTCt > 1:28305/1‑141 (MQ=255) | CTACTGGTATATGCGCGTCATGCTTCGACGGCGTAGGATAGATTGGTCCAACACCTATATAATCAACATGAGTTAAATCAGATTTTGCATACTCATCTAAATCACTAATACTAAGTCCAATAATTTTATCAGTGAAATATTGTGCTATCTCTTTGACTTTCGCATCATCTTGACCGACATGTATACCATCCGCGTTAATTTCTTTTGCCAAGGATACATCATCATTAACGATAAAAGGCACATCATATTGATGACAGAGATGCTGTAATTCT > USA300TCH1516_ALE/2212972‑2213243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |