New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAA > CP000731/2107‑2387 | cAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAAt > 2:297335/1‑141 (MQ=255) cAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAAt > 1:81339/1‑141 (MQ=255) aTTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTAGATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAAttt > 2:116942/1‑141 (MQ=255) tAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTAt < 1:367241/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=31) tATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAAc < 1:23661/141‑1 (MQ=31) aTGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCACTCCACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCACCGTCAATAAAACa < 1:292078/141‑1 (MQ=12) gCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAAt > 1:273951/1‑141 (MQ=32) aaaaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGGTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGGGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGa > 1:178041/1‑141 (MQ=17) aaaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTACGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGaa < 2:309299/141‑1 (MQ=17) aaaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGaa > 2:65933/1‑141 (MQ=32) aaaaTTTATTTATGTTGTTAAGAACACTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGTGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGATGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAAt < 2:56667/141‑1 (MQ=11) aaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAAt < 2:145134/141‑1 (MQ=32) aaaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAAt < 2:114394/141‑1 (MQ=32) tttATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATaaaa > 2:11577/1‑141 (MQ=33) | CAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAA > CP000731/2107‑2387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |