| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,373,429:2 | +T | 11.9% | coding (347/1335 nt) | pbuG ← | Guanine/hypoxanthine permease PbuG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,373,429 | 2 | . | T | 11.9% | 226.6 / 27.1 | 67 | coding (347/1335 nt) | pbuG | Guanine/hypoxanthine permease PbuG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/27); new base T (4/4); total (36/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
ATAATACCCGAACTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCG > USA300TCH1516_ALE/2373291‑2373567 | ataataCCCGAACTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAc‑‑c > 2:46297/1‑140 (MQ=255) cccGAACTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGaa > 1:133885/1‑140 (MQ=255) ccGAACTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGGAt > 1:427614/1‑140 (MQ=255) gAACTGTGTAAACCAACAAATGTAATGAATAAGCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATaa < 2:751935/140‑1 (MQ=255) cTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAAc > 2:228304/1‑140 (MQ=255) ttGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGACTTGCCTTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCCAAGAATATAC‑‑CTGAGAATCACACGc > 2:668401/1‑140 (MQ=255) gTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATGGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCt > 1:456638/1‑140 (MQ=255) gTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGc < 2:18445/140‑1 (MQ=255) gTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGccc > 1:365044/1‑139 (MQ=255) gTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCGGCTGAACCAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATCGCATTAATCATACCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGACTCTAC‑‑CTGACCACCAAACGCCt > 2:250192/1‑140 (MQ=255) ccTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTaa < 1:627624/140‑1 (MQ=255) cTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTaaa < 2:108847/140‑1 (MQ=255) cTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTaaa > 1:717643/1‑140 (MQ=255) cTAAAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTaaa < 1:259115/140‑1 (MQ=255) cAATTGTAAGGAATAATCCTGTACGTGATGAAACAGACATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCa < 2:369340/140‑1 (MQ=255) aTGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGACTTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGCATAGAACGCCTGTTAACCCAAcc > 2:179788/1‑139 (MQ=255) aaTGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTg > 1:758515/1‑140 (MQ=255) aaTGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGcc < 2:31829/140‑1 (MQ=255) gAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAg < 1:300247/140‑1 (MQ=255) ataatCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTg > 2:238945/1‑120 (MQ=255) ataatCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTg < 1:238945/120‑1 (MQ=255) tataCCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCa > 1:557679/1‑140 (MQ=255) gAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTACCAAGCAATACCCATGGCTAacac > 2:212717/1‑140 (MQ=255) aaCAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACacaa > 1:77226/1‑140 (MQ=255) aCAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGAGGGTTAATATCGCCAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTCACCAAGGAATACCCATGGTTAAcaca > 2:202972/1‑140 (MQ=255) aCAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCAAGGTTAacacc > 1:361425/1‑139 (MQ=255) aCAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACacaac < 1:749306/140‑1 (MQ=255) aGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAg > 2:644722/1‑140 (MQ=255) ccATCTTCATTTGATAAGGAAGTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCGGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTa < 1:225432/140‑1 (MQ=255) cagcTTCATTTGCTAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTTGCGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTaa < 2:693444/137‑1 (MQ=255) ttCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAAt < 1:349577/140‑1 (MQ=255) ttCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGc > 1:494480/1‑140 (MQ=255) tGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCattctt < 1:402545/140‑6 (MQ=255) aTAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCattctttg < 2:558380/140‑8 (MQ=255) aTAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATg < 1:594310/140‑1 (MQ=255) aTAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATg < 2:748178/140‑1 (MQ=255) ggAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCAtt < 1:697318/140‑1 (MQ=255) cgAATCGCATTAATAATAACTTCCCCAAACCCTGTGGCGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCAtt < 1:167825/139‑1 (MQ=255) gAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGCGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCAttt > 2:23982/1‑140 (MQ=255) gAATGGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCAttt < 2:639095/140‑1 (MQ=255) cATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCACGGCCTAACTACTGTCAACAGAACAGTAAATGCAACGCATGCATTTCATccc > 1:148055/1‑140 (MQ=255) aataaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATAcc < 1:727755/140‑1 (MQ=255) aaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGGATGCACGTAATCCCCTACCTCGTg > 2:258579/1‑140 (MQ=255) aaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTGAACACAACAGTAAATGCACAGAAACCGATTAACCCCATACCTGGTg > 2:316752/1‑140 (MQ=255) ttCCCCAAACCCACCGACGGTCAACATCCCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTa < 2:365044/140‑1 (MQ=255) tCCTTAAACCCTGGGACGGGTAATATAGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGGTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTaa < 2:690542/140‑1 (MQ=255) cccTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAAc < 2:71758/140‑1 (MQ=255) cTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAAc > 2:342277/1‑140 (MQ=255) tAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCa > 2:229818/1‑140 (MQ=255) aCCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGCGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAAtt > 1:614678/1‑140 (MQ=255) aCCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAAtt > 1:78559/1‑140 (MQ=255) ccatgtgACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTg < 1:392465/137‑1 (MQ=255) ccTGAGACTGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAGTAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATCCTCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTgg < 2:487351/140‑1 (MQ=255) tgtgACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACCGTGAACGAAAAAAATGCATCAAATCCCATACCTGGTGCCAACGCAACTGGaa > 2:778336/1‑139 (MQ=255) gtgACGGTTAATATCGCAAAGAATCTAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCACCTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTCACTGCAACGCATGCATGTAAACCCACACCTGCTGCCCACCCAGTCGGata > 1:487254/1‑140 (MQ=255) tgACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAATCAATCCAAAGAATGCAGTCGATGCCATCCCAGGTGCTAACGCAGTTGGaaac > 2:637505/1‑137 (MQ=255) cgACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGatat < 1:228304/139‑1 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATAttt > 1:473428/1‑140 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACACATGGTTAACACAACAGTAAATGCAACGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTCGATAttt > 2:453874/1‑140 (MQ=255) cGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTa > 2:373404/1‑140 (MQ=255) ttAATATCGCAAAGAATATACCTCTGAGAAGAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAg < 2:758515/140‑1 (MQ=255) tAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTa > 1:317123/1‑140 (MQ=255) aaTATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTAt < 2:150917/140‑1 (MQ=255) atcgtcaaGCATATAC‑‑CTGATAATACAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAg < 2:222607/134‑1 (MQ=255) cGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTCATAGcc > 2:276255/1‑140 (MQ=255) aaGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTCAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTACTAACACAATTGGATATTTAGCTATTAGCCTCAt > 2:84501/1‑140 (MQ=255) aGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATg < 2:217700/140‑1 (MQ=255) aC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCg > 1:18771/1‑140 (MQ=255) | ATAATACCCGAACTTTGTAAACCTACAAATGTAATGAATAATCCTATACCTGCTGAAACAGCCATCTTCATTTGATAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATAC‑‑CTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACCCATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCATACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCG > USA300TCH1516_ALE/2373291‑2373567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |