| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 895785 = | 56 (0.850) | 11 (0.190) | 7/224 | NT | 17.8% | coding (806/822 nt) | metQ_2 | Methionine‑binding lipoprotein MetQ |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 909740 | 53 (0.930) | intergenic (‑663/‑371) | USA300HOU_RS04500/csbD_1 | hypothetical protein/Stress response protein CsbD | |||||
AGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAA > USA300TCH1516_ALE/895646‑895922 | aGTGCGAAAGATAATCCTTAGGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGt < 1:69886/140‑1 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgcagagtctataaatgcctttctttcgatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatt > 2:361370‑M1/139‑140 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatt < 2:210943‑M1/2‑1 (MQ=255) ttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatt > 2:178454‑M1/139‑140 (MQ=255) tgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatta < 1:781846‑M1/3‑1 (MQ=255) tGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTa > 1:85357/1‑140 (MQ=255) ttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaattatt > 1:548156‑M1/136‑140 (MQ=255) cGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTAtt > 2:620611/1‑140 (MQ=255) aaaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTcc > 2:249915/1‑140 (MQ=255) aaaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTcc > 2:165057/1‑140 (MQ=255) aaaTAATCCGTATGCAAACCTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAATATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTg < 2:629623/138‑1 (MQ=255) aGATAATCCTTATTCAAACTTAAGTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTg < 2:214249/140‑1 (MQ=255) aGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTg < 1:695727/140‑1 (MQ=255) aagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGc > 2:87938‑M1/131‑140 (MQ=255) tAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTa < 2:760086/140‑1 (MQ=255) gggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtattaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataagaatgttgtgagtgcccttaaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTa > 1:763873‑M1/129‑140 (MQ=255) aaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTcctgctaacttttt < 1:178182‑M1/19‑7 (MQ=255) aaaCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAAt < 1:199231/140‑1 (MQ=255) aCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATta < 1:346822/140‑1 (MQ=255) aCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAACATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATta < 1:26323/140‑1 (MQ=255) tAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaat < 2:436428/140‑1 (MQ=255) atgcagatAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaataaa < 2:265375/133‑1 (MQ=255) tgccgTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa > 2:561796/5‑140 (MQ=255) tGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAAATGAAGTATTAAAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa > 2:488491/1‑140 (MQ=255) gaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTGTTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATACAAAt < 2:475296‑M1/35‑1 (MQ=255) cTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAAt > 2:306682/1‑140 (MQ=255) aaaGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCGGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAccat > 1:300009/1‑138 (MQ=255) aaaGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATGCCAATTAAAAAAACATActgt > 1:213777/1‑137 (MQ=255) gaatGAGATCAATATGTTAAGAGAATTCAAGTGTTAATTGAAGTATTATGATCTAAAGATATTCAATTCTTCATTAATCAAAAATACAATCGTTCAGTTATTCCTGCTAAATAAGACCAATTAAATAAAAATACCCtttc < 2:330828/140‑2 (MQ=255) gACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGCTATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTTCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaataa > 1:530273/1‑140 (MQ=255) gACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaataa > 1:196031/1‑140 (MQ=255) gACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGAGATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaataa < 2:272906/140‑1 (MQ=255) aTCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacac > 2:252966/1‑139 (MQ=255) aTCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacaa > 2:492426/1‑140 (MQ=255) tAAGAAAATCAAAGCAGTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAggg < 2:242309/140‑1 (MQ=255) tatcttgacaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtt > 2:410993‑M1/75‑140 (MQ=255) tCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAtttt > 1:631360/1‑140 (MQ=255) aGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTtgtg > 1:397928/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) agaaatACAATCTAAAGATATTAAAGACTTCATTAATGAAAAAGACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCACTGGAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATa < 2:392520/135‑1 (MQ=255) tACAATCTAAAGATATTAAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaaaaaa < 2:344102/140‑1 (MQ=255) tACAATCTAAAGATATGCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAAGACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATaaaaaa < 2:346286/140‑1 (MQ=255) aaTCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAggg > 2:216347/1‑140 (MQ=255) aaacaaaGATATTCAAGACTTCATTAAAAAAAAATACAATGGTGCAGTTAGTCCTGCTAAATAATACCAAATAAATAAAAATACCCATTAATAACAACGATTAAGGAGTTATTTATGTAGTATTGAAAAAAAAAAAGGGc < 2:251299/136‑1 (MQ=255) aTCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGc < 1:209171/140‑1 (MQ=255) cgcaaGATATTCAAGACATCATTAATGAAAAATACAATCGTGCTGTTATTCCTGCTCAATAATACCAATTAAATAAAAATCCCCTTTAAGAACAACGAGTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac < 2:798352/137‑1 (MQ=255) cTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTCTTGAAAATAAAAAAGGGcac > 1:1916/1‑140 (MQ=255) cTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac > 1:561824/1‑140 (MQ=255) cTAAAGATATTCAAAACTTTAATAATAAAAAATACAATTGTGCAGTTATTCCTAATAAATAATACAAATTAAATAAAAATACCTTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcac < 2:633759/140‑1 (MQ=255) caatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaa > 1:490008‑M1/44‑140 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAg > 1:188910/1‑140 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAg < 1:642853/140‑1 (MQ=255) gATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAAAAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAGGGGCACAAAAg > 1:396054/1‑140 (MQ=255) aatatTCAAAAATTCATTAATAAAAAAAAAAAAAGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACACTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAg < 2:311658/139‑1 (MQ=255) ttCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTGATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGc > 1:74300/1‑140 (MQ=255) ttCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGc > 1:784257/1‑140 (MQ=255) tCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCa > 1:473371/1‑140 (MQ=255) cAAGACTACATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAAGAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAg < 2:446836/140‑1 (MQ=255) cccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGTGGTTATTTTTCTGGTATTGAAAATAAAAAACGGCAGAAAACGGGGAGTctat < 2:183914‑M1/111‑1 (MQ=255) cccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGATATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTatat < 1:794683‑M1/111‑1 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATTGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTatat < 1:249915/140‑1 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTatat < 1:165057/140‑1 (MQ=255) ttCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 2:196031/140‑1 (MQ=255) ttCATTAATGAAAAAGACAATGGTGCAGGTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:43521/140‑1 (MQ=255) tCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACACCGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACACAAGGGGCAGTATATGc > 1:152543/1‑140 (MQ=255) tCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGc > 1:104085/1‑140 (MQ=255) gaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaaa < 1:274481‑M1/116‑1 (MQ=255) gaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaaa < 1:552007‑M1/116‑1 (MQ=255) gaacttccttgataatctggataaTTACTCATGAAGAGGATGATCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaaa < 1:154187‑M1/116‑1 (MQ=255) aaTGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAGAGAGTTGATAAAAGGGGCAGTATATGCAAAtt > 2:523602/1‑140 (MQ=255) tccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATc < 1:686452‑M1/121‑1 (MQ=255) aaaaTACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAAttgtgga > 1:594503/1‑135 (MQ=255) tGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAACAGGTGCATTATATGCAACTTATCGAATTTTAAAc > 1:545057/1‑140 (MQ=255) cAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACaaaaa > 2:237392/1‑140 (MQ=255) cAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGATTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACaaaaa > 2:615997/1‑140 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTCTTTGCAAATTATCGAATTTTAAACaaaaaa > 2:71051/1‑140 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACaaaaaa < 1:762810/140‑1 (MQ=255) | AGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAA > USA300TCH1516_ALE/895646‑895922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |