| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,458,972 | T→C | 5.5% | D159G (GAT→GGT) | murG ← | UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,458,972 | 0 | T | C | 5.5% | 227.3 / 3.1 | 72 | D159G (GAT→GGT) | murG | UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/43); new base C (2/2); total (27/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
ATGCTATTTAATTTTTTACTTCCTAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGTATATTTAATGAT > USA300TCH1516_ALE/1458834‑1459109 | atGCTATTTAATTTTTTACTTCCTAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATc < 1:445578/140‑1 (MQ=255)atGCTATTTAATTTTTTACCTCCGAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATc < 1:768289/140‑1 (MQ=255) gCTATTTAATTTTTTACTTCCTAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAg < 2:773119/140‑1 (MQ=255) ttttACTTCCTAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGCTACGCAAGATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTa > 1:185656/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAg < 2:502592/140‑1 (MQ=255) cTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTCTAGGTAGGTCGTTTAg > 1:771114/1‑140 (MQ=255) ttCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGc > 1:555945/1‑140 (MQ=255) cATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTttctt < 1:315067/140‑1 (MQ=255) gtAACGAGTAGAAATTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGCTAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTGTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTTGTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTttcttc < 2:15351/139‑1 (MQ=255) aTAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTTTTTTACATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTttcttc < 2:357980/140‑1 (MQ=255) tAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCa < 1:323683/140‑1 (MQ=255) tAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTGTTTGAATCGTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCa < 1:588276/140‑1 (MQ=255) cGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAAACATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATATTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAAt > 1:534792/1‑140 (MQ=255) aGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAAtgt < 2:333918/140‑1 (MQ=255) gTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAAtgtt < 1:189901/140‑1 (MQ=255) aaaCTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGta < 1:535122/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTTATTTTCATTAAACCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCACTCAAATCAGCTCTCTCTTTAGGTACGTGGTTTAGCGTTTCTTCAACACTTGtatc > 2:223840/1‑139 (MQ=255) cTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGtatat < 1:585653/140‑1 (MQ=255) tATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTc < 1:445535/140‑1 (MQ=255) ttttCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCtt < 1:610677/140‑1 (MQ=255) ttCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCATCTTTCTCTTTAGGTAAGTATTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTgg < 1:443012/140‑1 (MQ=255) ttCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTgg > 2:345918/1‑140 (MQ=255) ttCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTgg < 1:543187/140‑1 (MQ=255) tCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTCGTATATATTTTCTTGGc > 1:131276/1‑140 (MQ=255) aaGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAAttt < 2:95326/140‑1 (MQ=255) tAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAACCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTa > 2:418442/1‑140 (MQ=255) tAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAACCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTa > 2:418441/1‑140 (MQ=255) aTTGATAACCATTATGTGCATTACGATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATc < 2:783225/140‑1 (MQ=255) aTTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCACTAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTCGGCAAATTTAAGTGCTATc > 2:741131/1‑140 (MQ=255) aTTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATc < 2:759417/140‑1 (MQ=255) gATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTATATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTa < 2:662567/140‑1 (MQ=255) cATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCt > 2:701998/1‑140 (MQ=255) cATTATGTGCATTACCATTTTTTAAAGCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTTGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCt < 1:301953/140‑1 (MQ=255) ttATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTaa > 1:538881/1‑140 (MQ=255) ttATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTaa > 1:124116/1‑140 (MQ=255) aTGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATc > 1:516686/1‑140 (MQ=255) tgtgCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTTATcc > 2:294247/1‑140 (MQ=255) gCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTGGTTTGGCCAATCGTCCAATGTTGTTTGTGTTTGCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTgg < 1:187787/140‑1 (MQ=255) gCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTgg < 1:417362/140‑1 (MQ=255) gCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTgg < 1:726192/140‑1 (MQ=255) cATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGgt < 2:497342/140‑1 (MQ=255) cATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGgt < 2:198979/140‑1 (MQ=255) tACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTGCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGtt > 1:697880/1‑140 (MQ=255) tACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGATTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTCATTGGCAAATGTAAGTGCTATCTTATTCGCTGATCCTgttgtt > 1:275266/1‑140 (MQ=255) cATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAACATCAGATTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGAGTTTATTCATATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATATAAGTGTTGTCTTTATCGCTAATCCTGGTGTTAAg < 2:534792/140‑1 (MQ=255) cATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAg < 1:354490/140‑1 (MQ=255) cATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAg < 1:25511/140‑1 (MQ=255) cATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAg > 2:457610/1‑140 (MQ=255) aTTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGATACCATAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGt < 2:363725/140‑1 (MQ=255) ttttttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTc < 1:749696/140‑1 (MQ=255) ttttttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGCATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTc > 2:664799/1‑140 (MQ=255) ttttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAg < 2:473382/140‑1 (MQ=255) tttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGa < 1:382564/140‑1 (MQ=255) tttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAACCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGa < 1:418442/140‑1 (MQ=255) tttAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAACCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGa < 1:418441/140‑1 (MQ=255) tAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGAtt < 1:161207/140‑1 (MQ=255) tAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGAtt < 1:82239/140‑1 (MQ=255) tcttctCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTTTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATg > 2:296017/1‑140 (MQ=255) ctcGAATTGTTGCTGCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATa < 2:277559/140‑1 (MQ=255) ctcGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATa < 1:701998/140‑1 (MQ=255) ctcGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATa < 1:60689/140‑1 (MQ=255) ttgttgCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTATGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAGATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGtt < 2:632245/140‑1 (MQ=255) ttgCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGt > 2:478677/1‑140 (MQ=255) ttgCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGt > 1:334003/1‑140 (MQ=255) cAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTACGTAGTTTAGCGATTCTTCAAATGTTGTATATATTTTATTGGCAAATTTAAGTGCTGTCTTATTCTCTAATCTTGGTGTTAAGACCGTTTCAAGACTAAGATATGGTATCttt > 2:289764/1‑140 (MQ=255) aaTCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGTATATTTAATGAt > 2:613271/1‑140 (MQ=255) | ATGCTATTTAATTTTTTACTTCCTAAGCTTCCACCCATAACGAGTAAAACTTTTTTATTTTCATTAAAGCCTGTTAATTGATAACCATTATGTGCATTACCATTTTTTAAATCTTCTCGAATTGTTGCTCCAATAAAATCAGCTTTCTCTTTAGGTAAGTAGTTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGTATATTTAATGAT > USA300TCH1516_ALE/1458834‑1459109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |