| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 722,992 | A→G | 5.9% | I44V (ATA→GTA) | feuB → | Iron‑uptake system permease protein FeuB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 722,992 | 0 | A | G | 5.9% | 1582.0 / 58.2 | 458 | I44V (ATA→GTA) | feuB | Iron‑uptake system permease protein FeuB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (219/211); new base G (17/10); total (237/221) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
TCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAATTG > USA300TCH1516_ALE/722902‑723082 | cTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATtata < 2:824303/91‑1 (MQ=255) cTATATTATAGGTTTAAGTATGATAATACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATtata < 2:6491866/91‑1 (MQ=255) atatTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATaga > 2:6264045/1‑91 (MQ=255) tattatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTGCATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTagag < 1:6158190/91‑1 (MQ=255) tattatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATagtg < 2:4775275/91‑3 (MQ=255) attatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAgg < 2:2586422/91‑1 (MQ=255) ttatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGc < 2:5900358/91‑1 (MQ=255) tataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTAGAGGCt < 2:3209046/91‑1 (MQ=255) tataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCt < 1:468383/91‑1 (MQ=255) ataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTa < 1:6553527/91‑1 (MQ=255) ataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTa > 2:4221272/1‑91 (MQ=255) ataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTa > 1:3852155/1‑91 (MQ=255) taGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTAGAGGCttg < 1:3730240/91‑3 (MQ=39) taGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAt > 2:1909322/1‑91 (MQ=255) ggTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAttt < 1:3621390/91‑1 (MQ=255) ggTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAttt > 2:3088568/1‑91 (MQ=255) ggTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAttt > 1:1825040/1‑91 (MQ=255) ttAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTa < 2:5210836/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAt > 2:5588979/1‑91 (MQ=255) aaGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAt < 1:5316338/91‑1 (MQ=255) aGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAtt < 2:2612877/91‑1 (MQ=255) aGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAtt > 1:4612553/1‑91 (MQ=255) aGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAtt < 1:2460717/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATta < 1:5466212/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATta < 2:2552798/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATta < 2:90558/91‑1 (MQ=255) tATGATACTACTTATCACACTATTTATTTATACGTTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACGATTATAGTGGCTATTTTTAATtat < 2:4636673/91‑1 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 1:3463240/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 2:4315534/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 1:2550443/1‑91 (MQ=255) gATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAAt > 1:4260764/1‑91 (MQ=255) tactacTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATcc > 1:1642398/1‑91 (MQ=255) actactAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCt < 2:5987954/91‑1 (MQ=255) actactAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCt > 2:6060619/1‑91 (MQ=255) ctactaATCACACTATTTATTTCTACATTACTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTAGAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTa < 2:6920858/91‑1 (MQ=255) ctactaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTa < 2:447669/91‑1 (MQ=255) ctactaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTa < 2:2129182/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc < 2:3619403/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc > 2:1200673/1‑91 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc < 1:6329007/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc > 1:5964384/1‑91 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc < 1:4979186/91‑1 (MQ=255) aaTCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAAt > 1:977727/1‑91 (MQ=255) aTCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATc > 2:1707023/1‑91 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa > 2:6705217/1‑91 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa < 1:5909441/91‑1 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa > 2:2417385/1‑91 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa > 2:5139607/1‑91 (MQ=255) cacTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa < 2:2269385/89‑1 (MQ=255) cacTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACa > 2:1054791/1‑91 (MQ=255) cTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGc < 1:2953815/91‑1 (MQ=255) tttatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCaaa > 1:2223220/1‑91 (MQ=255) tttatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCaaa > 1:5218140/1‑91 (MQ=255) tatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAc < 1:3150699/91‑1 (MQ=255) tatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAc < 2:1491331/91‑1 (MQ=255) atttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCa > 1:1722784/1‑80 (MQ=255) atttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAca > 1:6728560/1‑91 (MQ=255) atttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAca > 1:5110025/1‑91 (MQ=255) tttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcat > 1:3564823/1‑91 (MQ=255) ttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatc > 2:1339952/1‑91 (MQ=255) ttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatc > 2:3438064/1‑91 (MQ=255) tCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatca > 2:2969290/1‑91 (MQ=255) cTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatcat > 1:749920/1‑91 (MQ=255) tACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACatcatc > 1:6796929/1‑91 (MQ=255) aCATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACAtcatca > 1:5664368/1‑91 (MQ=255) aTTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAAt > 1:6225831/1‑91 (MQ=255) ttAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATg > 2:386618/1‑91 (MQ=255) ttAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATg > 2:6815360/1‑91 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGGGGCTATTTTTACTTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 1:5827293/91‑1 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 1:4803997/91‑1 (MQ=255) aGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGAtt > 2:4847467/1‑91 (MQ=255) ggTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTa < 1:6380176/91‑1 (MQ=255) ggTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTa < 1:4173626/91‑1 (MQ=255) gTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAg < 2:1620118/91‑1 (MQ=255) gTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAg < 1:2143519/91‑1 (MQ=255) tGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAgg > 2:5350807/1‑91 (MQ=255) tGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAgg > 1:2093311/1‑91 (MQ=255) gACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGa < 1:4486786/91‑1 (MQ=255) gCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTc < 2:3736824/91‑1 (MQ=255) ccAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTcc < 1:1356737/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCa < 1:5723739/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCa < 2:270599/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCa < 1:3385662/91‑1 (MQ=255) aaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAg > 1:4755/1‑91 (MQ=255) aaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGa < 1:1033806/91‑1 (MQ=255) aTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGaa < 2:763487/91‑1 (MQ=255) aTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGaa < 2:4064525/91‑1 (MQ=255) aTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGaa < 2:1574044/91‑1 (MQ=255) aGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAAtata > 1:2016606/1‑91 (MQ=255) gCCTCTATAATTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag > 2:2823810/1‑91 (MQ=255) gCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag > 1:1169205/1‑91 (MQ=255) ccTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagc > 2:5438770/1‑91 (MQ=255) ctctACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagca < 1:3762798/91‑1 (MQ=255) ctataaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATTCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagcagc > 2:5767019/5‑91 (MQ=255) tACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAgcagca < 2:3371552/91‑1 (MQ=255) aCAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGcagcag < 1:273026/91‑1 (MQ=255) aCAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGcagcag < 1:39554/91‑1 (MQ=255) cAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGt < 1:4020356/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTa > 2:6511639/1‑91 (MQ=255) tataGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAAtt > 2:3902412/1‑91 (MQ=255) | TCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAATTG > USA300TCH1516_ALE/722902‑723082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |