| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 802131 = | 110 (0.880) | 6 (0.050) | 5/236 | NT | 5.7% | intergenic (+372/+252) | USA300HOU_RS03915/USA300HOU_RS03920 | Putative 5'(3')‑deoxyribonucleotidase/Putative lipid kinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 802180 = | 97 (0.850) | intergenic (+421/+203) | USA300HOU_RS03915/USA300HOU_RS03920 | Putative 5'(3')‑deoxyribonucleotidase/Putative lipid kinase | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
AGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTT > USA300TCH1516_ALE/801993‑802271 | aGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATaaa < 4:235302/141‑1 (MQ=255) gtgtAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAAt < 2:833014/141‑1 (MQ=255) caccttatattcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaa < 3:412994‑M1/1‑1 (MQ=255) tgtAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATc > 3:438404/1‑141 (MQ=255) tgtAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATc > 2:846122/1‑141 (MQ=255) tacaCTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCg > 4:259007/4‑141 (MQ=255) ccttatattcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtcttttttaaattctataaaaaa > 3:151126‑M1/139‑141 (MQ=255) ccttatattcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaaaa > 2:938578‑M1/139‑141 (MQ=255) cttatattcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaAAAt < 4:197519‑M1/4‑1 (MQ=255) cttatattcgtttctattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaAAAt > 2:540071‑M1/138‑141 (MQ=255) tatattcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaAAATCg < 4:344788‑M1/6‑1 (MQ=255) aCTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGAt > 1:759038/1‑141 (MQ=255) aCTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGAt < 4:444674/141‑1 (MQ=255) aTGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAAt > 3:41947/1‑141 (MQ=255) tcgtttttattagctttaagctattaccctgtttcaaaaacagacatataattttggcgcatgccactaaaatgattgatgttgtattttaaatcatagtggtttatgcgtctttttcaaattctataaaAAATCGGATGa < 3:333043‑M1/11‑1 (MQ=255) tGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAAtg < 2:433056/141‑1 (MQ=255) gCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAAtgt > 2:354063/1‑141 (MQ=255) cATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAAtgtg < 4:328026/141‑1 (MQ=255) cATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAAtgtg < 4:403821/141‑1 (MQ=255) aTTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATgtgt < 3:37060/141‑1 (MQ=255) ttCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGtt > 2:328970/1‑141 (MQ=255) ttCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGtt < 4:448977/141‑1 (MQ=255) cATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTaa > 2:629244/1‑141 (MQ=255) tatTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATc < 1:331686/141‑1 (MQ=255) atTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCt > 2:575446/1‑141 (MQ=255) atTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCt > 3:197519/1‑141 (MQ=255) ttAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATgg < 1:255654/141‑1 (MQ=255) aGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAg > 4:199617/1‑141 (MQ=255) aGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAg > 2:173139/1‑141 (MQ=255) gTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTATTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGa > 4:181019/1‑141 (MQ=255) gTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGTATTAATGTGTTAATCTATGTCAGa > 4:362151/1‑141 (MQ=255) acacATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGAtt > 3:72245/1‑141 (MQ=255) cacaTTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTa < 2:940193/141‑1 (MQ=255) cacaTTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTa > 1:135885/1‑141 (MQ=255) cacaTTAGCTGTGACTAATGATAAAGAAGCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTa < 1:62849/141‑1 (MQ=255) caTTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTaca > 2:178720/1‑141 (MQ=255) gtgACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTATCTTCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCa > 4:407630/1‑141 (MQ=255) gtgACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATcc < 2:787127/141‑1 (MQ=255) gtgACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATcc < 1:433735/141‑1 (MQ=255) gtgACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATcc > 4:312117/1‑141 (MQ=255) tgACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCg < 3:55088/141‑1 (MQ=255) gACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGa < 3:278706/141‑1 (MQ=255) gACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGa > 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aGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGaa > 4:292502/1‑141 (MQ=255) aGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGaa > 4:54188/1‑141 (MQ=255) aGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGaa > 1:450544/1‑141 (MQ=255) aGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGaa > 1:62428/1‑141 (MQ=255) gAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAAt < 1:654671/141‑1 (MQ=255) aaTCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAAtt < 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> 4:268807/1‑141 (MQ=255) cGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATg < 1:35962/141‑1 (MQ=255) gTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGa < 1:421754/141‑1 (MQ=255) tCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATTTGTTAATCTATGACAGATTACACGTCTTCCAATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATATACCACTATGAtt > 4:166853/1‑141 (MQ=255) cTTTATCATTTCCGTCCCACTCTCAAAAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGAttt < 2:122886/141‑1 (MQ=255) cATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATa > 3:170763/1‑141 (MQ=255) ttCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATacaa > 4:272300/1‑141 (MQ=255) ttCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATacaa < 3:252042/141‑1 (MQ=255) cGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACat > 3:330612/1‑141 (MQ=255) cGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACat < 1:324263/141‑1 (MQ=255) cccGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACatcaa < 2:617944/141‑1 (MQ=255) ccGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACatcaat > 2:41903/1‑141 (MQ=255) ccGCTCTCAATAAAAGTTAGATTA‑‑‑TCTTTTTAGTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTGGAAAAAGACGAATAAACCACTATTCTTTAAAATACAACataaaa > 4:106193/1‑140 (MQ=255) tcAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCAtttt > 2:952423/1‑141 (MQ=255) cAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTa > 1:681653/1‑141 (MQ=255) aaaTGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTgg > 1:476033/1‑141 (MQ=255) aTGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCa < 1:948923/141‑1 (MQ=255) gTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGAc < 1:817417/91‑1 (MQ=255) 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tCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTCATCTATGGCAGATTACACGTCTTCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAAt < 1:235823/141‑1 (MQ=255) tCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAAt > 4:50361/1‑141 (MQ=255) tCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAAt > 2:804131/1‑141 (MQ=255) cTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAAtt < 2:621317/141‑1 (MQ=255) cTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAAtt > 2:683372/1‑141 (MQ=255) ttattatAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATCCAACATCAATCATTTTAGTGGCTTGCGCCAAAATAatat > 2:367505/1‑141 (MQ=255) ttattatAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTatat < 2:583690/141‑1 (MQ=255) ataAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTg > 1:298643/1‑141 (MQ=255) ataAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTg > 1:159712/1‑141 (MQ=255) AAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAATATCAATCATTTTAGTGGCATGCTCTAAAATTATATTTTTGtt < 2:497399‑M1/141‑1 (MQ=255) AAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGtt < 1:566662‑M1/141‑1 (MQ=255) AAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGtt < 3:308645‑M1/141‑1 (MQ=255) | AGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTTTA‑‑‑TCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTT > USA300TCH1516_ALE/801993‑802271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |