| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 16959 | NA (NA) | 11 (0.050) | 6/232 | NT | 6.8% | coding (103/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase |
| ? | CP000731 | = 17055 | 167 (0.660) | coding (7/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0021 | IS431 mec transposase | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
ACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACCACATATCATC > CP000731/16915‑17195 | aCGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATA < 3:446628‑M2/141‑1 (MQ=255)aCGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATA < 4:265866‑M2/141‑1 (MQ=255)aCGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATA < 1:390347‑M2/141‑1 (MQ=255) tctTAATATTTCAGATATATCACGATAGGTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaaga > 4:393823‑M2/1‑102 (MQ=255) ctTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaagcgaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatct < 1:1068969‑M2/141‑41 (MQ=255) tAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctac < 1:353961‑M2/141‑43 (MQ=255) tatTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgt < 3:17157‑M2/141‑46 (MQ=255) tttCAGATATATCACGATAACTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACAGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgttg < 1:93272‑M2/141‑48 (MQ=255) tAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctc > 1:886099/1‑141 (MQ=31) tAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctc < 2:584250/141‑1 (MQ=31) aGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcc < 2:879585/141‑1 (MQ=32) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAcctcct > 1:1045968/1‑141 (MQ=32) cAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAAc > 2:123082/1‑141 (MQ=35) cAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAAc < 4:453325/141‑1 (MQ=35) aaTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACt > 1:133120/1‑141 (MQ=35) aaTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACt < 1:1077446/141‑1 (MQ=35) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCGTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 4:424814/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 1:255039/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTg < 2:632314/141‑1 (MQ=37) tGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAACTTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGt < 2:975320/141‑1 (MQ=38) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTa > 3:366780/1‑141 (MQ=40) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTacc < 3:46353/141‑1 (MQ=255) ttAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccac > 2:909033/1‑141 (MQ=255) tAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTaccacc < 2:1069360/141‑1 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCt < 1:170233/141‑1 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTaaaa > 2:888884/1‑141 (MQ=255) tagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAag > 3:418026/1‑141 (MQ=255) agccgttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACCGAAGACGCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagt > 3:214956/8‑141 (MQ=255) agCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagt > 3:98934/1‑141 (MQ=255) gCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagta < 1:622984/141‑1 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATACCATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTACAATTATATTATAAATTTGACTTTGCTACAGAACCTCCTAACTGTCTTACCACCTTAAAagtcg < 4:208122/141‑3 (MQ=17) cAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAagtagt < 1:376034/141‑1 (MQ=255) gttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGtt > 3:210498/4‑141 (MQ=255) gCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAg < 2:861857/141‑1 (MQ=255) cTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGa < 1:260544/141‑1 (MQ=255) cTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAACTAGTTGCAGa > 4:340486/1‑141 (MQ=255) tACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTCAACTTTGCAACTTTACCTCCTATCTGTTTTACCACCTTAATTGTAGTTGCAGAc > 2:263532/1‑141 (MQ=17) aCAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACg > 1:95560/1‑141 (MQ=255) cAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGc > 2:1001835/1‑141 (MQ=18) cAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCTTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGc > 2:416594/1‑141 (MQ=255) aGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCa > 2:782170/1‑141 (MQ=255) gTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCAc < 1:546971/141‑1 (MQ=255) tGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACt < 4:83067/141‑1 (MQ=255) tGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACt < 2:556385/141‑1 (MQ=255) tGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACt < 2:133120/141‑1 (MQ=255) gATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACtt < 2:462565/141‑1 (MQ=255) tAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAttaagggaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaagctaat > 2:563615‑M2/1‑34 (MQ=255) aaCATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCt < 4:162924/141‑1 (MQ=255) cATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTaa > 3:108153/1‑141 (MQ=255) cATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTaa > 2:608959/1‑141 (MQ=255) aTCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTaaa > 1:662966/1‑141 (MQ=255) aTCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTaaa > 1:475424/1‑141 (MQ=255) ccTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATc > 3:355858/1‑141 (MQ=255) ccTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATc > 1:194564/1‑141 (MQ=255) ccTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATc > 3:79512/1‑141 (MQ=255) ttGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACTACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGt > 2:820231/1‑141 (MQ=21) ttGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACTTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGt < 1:550282/141‑1 (MQ=255) gTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTca < 1:564379/141‑1 (MQ=255) ttAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCACACAGCCGACCCCTTTTTGTCATAATTATAATATAAGTACACCATTCCAACCGAACATCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcag < 1:918713/141‑1 (MQ=25) tAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcagc < 3:265516/141‑1 (MQ=255) tAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcagc > 3:323166/1‑141 (MQ=255) aaaTTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcagca < 2:478573/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcagcag > 2:677816/1‑141 (MQ=255) aaTTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTcagcag > 1:324979/1‑141 (MQ=255) ttGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAgtg > 2:367220/1‑141 (MQ=255) tataTCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacacatggcgtattgatga < 2:569400‑M2/141‑129 (MQ=255) tataTCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTaa > 3:249517/1‑141 (MQ=255) atatCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggacgaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcttattgatgag < 1:582365‑M2/141‑130 (MQ=255) atatCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgag < 2:937371‑M2/141‑130 (MQ=255) atatCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgag < 2:646384‑M2/141‑130 (MQ=255) atatCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaattgggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgag > 1:830352‑M2/1‑12 (MQ=255) tatCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgaga < 4:311483‑M2/141‑131 (MQ=255) atCTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagaa < 2:669778‑M2/141‑132 (MQ=255) atCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACca < 3:325095/141‑1 (MQ=255) atCGGAAATAtgaagagaacgtggtgtaaagcttcatcattcaacgaactaccgttgggttcaagaatatgccccaatgttatatcaaatgtggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtatttaggagac < 4:323366‑M2/141‑132 (MQ=255) cTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgt < 1:509980‑M2/141‑134 (MQ=255) cTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgt > 1:395575‑M2/1‑8 (MQ=255) cTGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattctatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgt < 2:176415‑M2/141‑134 (MQ=255) tGAAATAttaaggggacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctgccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgta > 2:158788‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtt > 1:1030457‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgta > 1:725062‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgta < 3:63753‑M2/141‑135 (MQ=255) tGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaag > 2:471806‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAAATAttaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttcggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgta > 3:275144‑M2/1‑7 (MQ=255) tGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACCACat > 1:691418/1‑141 (MQ=255) gAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACCACata > 2:53349/1‑141 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgcactaacgttaggatcaacaatatagtccatttttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 1:757458‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaataatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:345098‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:218825‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 1:127493‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:258871‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 1:462565‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 1:841072‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:93366‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc > 4:280953‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgaattgatgagacgtatatc < 2:761468‑M2/141‑139 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaaaaaaaaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:32180‑M2/1‑3 (MQ=255) atattaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttagattcaagaatatgccccaatttaataacaaatttggaagaaaaagcaaaaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc > 2:275049‑M2/1‑3 (MQ=255) aTAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACCACATatca < 2:980083/141‑1 (MQ=255) attaagagaacgtggtgtaaacgttcatcattcaacgatctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaaatttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatcaa < 3:262707‑M2/141‑141 (MQ=255) | ACGGTAGATCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCTCTTAATATTTCAGATATATCACGATAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCCTAACTGTATTACCACCTTAAAAGTAGTTGCAGACGCACTTCCTAAATCGTCAGCAGTGTTTAACCACATATCATC > CP000731/16915‑17195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |