New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
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3:453369/1‑141 (MQ=255) taaataaaTATTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACATTAAATTGttt > 1:111930/1‑141 (MQ=255) aataaataTTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTAc < 2:424991/141‑1 (MQ=255) ataaataTTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACa > 2:1076269/1‑141 (MQ=255) taaataTTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTATATTGATGCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATGTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACaa < 3:318857/141‑1 (MQ=255) aaataTTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACAAc < 2:92041/141‑1 (MQ=255) aataTTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACAACt < 4:234721/141‑1 (MQ=255) ttatCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTCAACAGAACAATTTGTATTTTACAATCATTAATTAAATAAGAAAGCAAGACAGTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACAACTGTca < 3:317028/141‑1 (MQ=255) atCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACAACTGTcaac > 3:126610/1‑141 (MQ=255) | GCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGA‑AAGCTTAAATAAATATTATCAAGTTAATAAACAATTAATTTTTAGATGGATTCATC‑AAAAATCGTAAAAAGCACAATTTGTATTTTACAAACATTAATTAAAAAAGAAAGCAAGACATTCGTGCAATCGGTTACCTTAAATTGTTTACAACTGTCAAC > USA300TCH1516_ALE/2543278‑2543558 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |