| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,833,850 | A→T | 6.0% | L179L (CTT→CTA) | hisI ← | Phosphoribosyl‑AMP cyclohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,833,850 | 0 | A | T | 6.0% | 474.9 / 16.3 | 150 | L179L (CTT→CTA) | hisI | Phosphoribosyl‑AMP cyclohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/67); new base T (5/4); total (79/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.07e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TATAAGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCTATACCTTC > USA300TCH1516_ALE/2833710‑2833990 | tataAGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCa < 1:1014655/141‑1 (MQ=255) taAGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAg > 1:692221/1‑141 (MQ=255) aaGCCTTGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAACGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAgc < 1:591332/141‑1 (MQ=255) aaGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAgc > 3:210162/1‑141 (MQ=255) aGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAgcg > 1:1046255/1‑141 (MQ=255) aGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAgcg > 1:504170/1‑141 (MQ=255) gCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAgcgc > 3:395641/1‑141 (MQ=255) gCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAgcgc < 1:204702/141‑1 (MQ=255) ccATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgca < 4:18244/141‑1 (MQ=255) aTGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATCCTTGCTCTACCACTGTTCGATACTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatg < 4:29672/141‑1 (MQ=255) tGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatgc > 4:78365/1‑141 (MQ=255) tGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatgc > 2:888050/1‑141 (MQ=255) tGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatgc < 1:480871/141‑1 (MQ=255) gATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTGTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatgca > 2:580428/1‑141 (MQ=255) aTCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCgcatgcat < 2:1043241/141‑1 (MQ=255) tCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAGCGCATGCATc < 1:1047948/141‑1 (MQ=255) tCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATc < 4:29284/141‑1 (MQ=255) ccTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGGCGTTCTCCTTTAGATTGATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCa > 3:44413/1‑141 (MQ=255) cTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCaa > 1:35842/1‑141 (MQ=255) cTTTTCCTTATAAATAAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCaa > 3:451164/1‑141 (MQ=255) ttttCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAg < 3:5784/141‑1 (MQ=255) tttCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGa < 2:434146/141‑1 (MQ=255) tataTCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACaaata > 3:295986/1‑141 (MQ=255) tataTCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCAAAAAAAAAGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACaaata < 2:1080171/141‑1 (MQ=255) tatCTTAGTCCATACTTGATTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGAAAAAAAAAAAAAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACaaataaa < 2:471916/141‑1 (MQ=255) tCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATg > 2:494369/1‑141 (MQ=255) ttAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGAt < 1:711004/141‑1 (MQ=255) aGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATaa > 2:121279/1‑141 (MQ=255) aGTCCATACTTGCTTTACAGCTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATaa < 3:229991/141‑1 (MQ=255) gTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATaaa < 1:912550/141‑1 (MQ=255) tCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAg < 1:699143/141‑1 (MQ=255) tACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCa < 4:457102/141‑1 (MQ=255) cTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACATTATAAGTTCTTGCTAATATGATGTCTTTGTCCTAATCCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATc < 1:757357/141‑1 (MQ=255) cTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTCGGCGTTCACCTGTAAAGATATCGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCCCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAACGCATGCATCAAGACACATAAATGATaaaatgcagg > 2:1030527/1‑134 (MQ=255) gCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGc > 3:249810/1‑141 (MQ=255) ttACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTAc > 2:208116/1‑141 (MQ=255) aCCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACtt < 1:159963/141‑1 (MQ=255) aCCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACtt > 1:521389/1‑141 (MQ=255) ccACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTc > 4:368953/1‑141 (MQ=255) ccACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTc > 4:368963/1‑141 (MQ=255) cACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTcc > 2:586879/1‑140 (MQ=255) cACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCa < 1:1003320/141‑1 (MQ=255) cACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCa > 1:591316/1‑141 (MQ=255) cGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCTAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACaa < 3:368953/141‑1 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aaGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAAtt < 4:320045/141‑1 (MQ=255) tgTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTg < 2:466122/140‑1 (MQ=255) aGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTg < 1:869868/141‑1 (MQ=255) aGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTg < 1:45669/141‑1 (MQ=255) ttGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCa < 2:301460/141‑1 (MQ=255) cgcTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAAtt > 2:72327/1‑141 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ccGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGt > 1:229263/1‑141 (MQ=255) ccGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGt > 2:62935/1‑141 (MQ=255) gCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGCCAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTAt > 1:933735/1‑141 (MQ=255) gCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTTTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTAt > 2:187006/1‑141 (MQ=255) gCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTAt > 3:247346/1‑141 (MQ=255) gCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTAt > 4:193695/1‑141 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aaaaaTCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCCCCTTTAAGTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCt < 1:1030527/141‑1 (MQ=255) aaaaaTCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCt > 2:71566/1‑141 (MQ=255) aaaaTCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTGCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCtt < 1:157990/141‑1 (MQ=255) aTCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTc > 2:193355/1‑141 (MQ=255) tCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCt > 2:61978/1‑141 (MQ=255) cGACGCCAAGCGCACGCATCAAGACAAATAAACAATAAAGTTCAACTGCTACTACACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCtc > 2:763467/1‑140 (MQ=255) gACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCtat > 2:444602/1‑141 (MQ=255) gACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCtat < 2:145372/141‑1 (MQ=255) gACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCtat < 3:410565/141‑1 (MQ=255) aCGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTCAATTACGAGTTCAAAAGTTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCtatt > 4:425488/1‑140 (MQ=255) cGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCTATAc > 2:291113/1‑141 (MQ=255) | TATAAGCCATGATCCTTTTCCTTATATCTTAGTCCATACTTGCTTTACCACTGTTCGATATTTTGTCGTTCACCTTTAAAGTTATTGCGCTTATGATGTCTACGCGCTAATTCCGCCTCAATTTCTGAAAAATCGACGCCAAGCGCATGCATCAAGACAAATAAATGATAAAGTTCATCTGCTACTTCACTTACAAATGCTTTTTTGTCACCTTTAATTGCTTCAATTACGACTTCAAAAGCTTCTTCACCGTATTTTTTTGTAATCTTTTCTATACCTTC > USA300TCH1516_ALE/2833710‑2833990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |