Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 614,199 | 0 | T | C | 7.3% | 499.7 / 4.6 | 175 | D837D (GAT→GAC) | sdrC | Serine‑aspartate repeat‑containing protein C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/79); new base C (2/13); total (83/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |