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| * | USA300TCH1516_ALE | 622,464 | 0 | G | A | 5.4% | 491.4 / 3.1 | 182 | S1009S (TCG→TCA) | sdrE | Serine‑aspartate repeat‑containing protein E |
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Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
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3:203139/1‑141 (MQ=17) tAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactc > 1:581669/1‑141 (MQ=255) cagtgattcagactcagatagcgattcagactcagatagcGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactc > 2:1285610/5‑141 (MQ=255) caGCGATTGTGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGAGAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCgactcagactc < 4:575941/140‑1 (MQ=255) gCGATGCGGACGCAGAAAGCGCCTAAGACTCAGATATCGACGCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGAAAGCGACTCGGACTCAGACAGCGACCCAGAGTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGactcagactcag < 4:417747/141‑1 (MQ=14) gATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACtcagactcagac < 1:515326/141‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |