| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,448,493 | 0 | C | T | 8.8% | 681.2 / 43.0 | 228 | intergenic (‑252/+25) | yxeP_4/hutI | putative hydrolase YxeP/Imidazolonepropionase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/93); new base T (12/8); total (125/103) | |||||||||||
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Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
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ttAAACTAATGTTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCa > 2:1447761/1‑128 (MQ=255) ttAAACCAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCAt < 3:563305/141‑1 (MQ=255) aaCCAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTgtcaata > 4:512727/1‑135 (MQ=255) aCCAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCATCCCa > 1:869574/1‑141 (MQ=255) ccAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCATCCCaa < 2:865487/141‑1 (MQ=255) | TGATAGACAGTTGTTTAATAATATCGTAACACTGTTGTCAAACTATTCTAACTTTTATAATTGAGACTCTATACAAAAACGTGTTCTCGAATATACTTG‑TTTTTACAAACCACAAAAAGCTCTAAACATTAGTTTAAACCAATGCTTAGAGCTTTCTAATTATTTTATGCTTTAAAAGATACTGTGTTATCTACGATGACCTTACCGTCTTTAATAACTTTTTCTGCGTGATTGATACCAAAATGATATGGAATATATTCATGATTTGGTGCATCCCAA > USA300TCH1516_ALE/2448354‑2448632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |