| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 68659 = | 104 (0.470) | 3 (0.020) | 3/210 | NT | 3.1% | coding (775/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 68655 | 97 (0.510) | coding (771/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AGGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGA > USA300TCH1516_ALE/68522‑68786 | aGGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAATGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAc < 1:645480/134‑1 (MQ=255) gggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACa < 1:579870‑M2/134‑2 (MQ=255) gggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATAACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACa > 1:805328‑M2/1‑133 (MQ=255) gggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATAACAATAAAAACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACa < 1:2713941‑M2/134‑2 (MQ=255) ggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑AGTAGAAAAGTACATTAAAAACaa < 1:848778‑M2/134‑3 (MQ=255) ggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTCTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaa < 2:814303‑M2/134‑3 (MQ=255) gAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGTTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaat > 1:1901882‑M2/1‑131 (MQ=255) gAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaat > 1:2547841‑M2/1‑131 (MQ=255) gAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaat > 1:1019889‑M2/1‑131 (MQ=255) acacCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataa < 2:1746765‑M2/134‑6 (MQ=255) cacCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataat > 2:1088743‑M2/1‑128 (MQ=255) ccgcccgataACTGCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATAAATAATGAGATTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataa > 2:1863718‑M2/5‑126 (MQ=255) tGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataata < 1:1387931‑M2/134‑11 (MQ=255) gCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTCTTTACAGCAATAATGAGCATAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCCAAAAGTACCTTACAAACcataataataa < 2:2174149‑M2/134‑12 (MQ=255) ccGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataat > 1:551812‑M2/1‑122 (MQ=255) ccGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TCTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataat > 2:2555216‑M2/1‑122 (MQ=255) cGATAACGCCCTTATTGAAAGTTTCCATTCCTCGTTAAATTCTGAAACTTTTTACAACAATAAAGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataata > 1:1042213‑M2/1‑121 (MQ=255) aCGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTGCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTCCATCAATAATGAGCTTAATCACTATAATAACATTGTAAAAGATAT‑TGTCGAAAAGTTCATTAAAAAC‑‑‑aataataaaaataataat > 1:1889139/1‑134 (MQ=17) aCGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTATAATAGATAT‑TGTCGAAAAGAACATTAAAAAAaaaaataataataattgt < 1:2075877‑M2/134‑19 (MQ=255) aCGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATAAAATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataataataat < 1:2783623‑M2/134‑19 (MQ=255) ctctgATAGAAAGTTTACATTTCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTAGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑aataataataataataataat < 2:1265862/130‑1 (MQ=255) cacggATAGAAAGTTTACATTCCTCTGTAAAGTCTTAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑aataataataataataataat < 2:1852805/130‑1 (MQ=17) tAGAAATTTTCCATTCCTTGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCGCATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAAtt < 1:1318797/134‑1 (MQ=255) tAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAAtt < 2:813251/134‑1 (MQ=255) aGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTc < 1:1508801/134‑1 (MQ=255) atatttttCATTCTTCGATAAAAACTGAAACTTATTACAACAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTcaa < 1:597010/130‑1 (MQ=18) aaGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCTAATTcaac > 2:939554/1‑134 (MQ=255) aaGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTcaac > 2:1179044/1‑134 (MQ=255) aaGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTcaac > 1:871624/1‑134 (MQ=255) aaGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACAACACTAAGGAGTTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTcaac < 2:2783958/134‑1 (MQ=255) cATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTCACATCAATAATGAGCTTAATCACTATAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACaaaa > 1:2353142/1‑134 (MQ=18) ttCCTTGCTAAAGTCGTAAACTTTTTACATCAATAATGATCTAAAACATTCCCATTA‑AAAGAAACTGAACTGAGGTGTAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAg < 2:2045671/134‑1 (MQ=255) ttCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAACTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTAAATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAAATCAACAAAAACtcg > 2:425486/1‑132 (MQ=255) cTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCt > 1:291621/1‑134 (MQ=255) tcTAAATTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACt < 1:2823607/133‑1 (MQ=255) tAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAAGCTACTTa > 2:2577294/1‑134 (MQ=255) tAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTAAATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTa > 1:323371/1‑134 (MQ=255) gTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGCCCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAACAATAATCGACTTCACCAAAAACTAGGCTACTTATacc > 2:567346/1‑134 (MQ=21) tCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATTATTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCTAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATcccc < 1:1912295/134‑1 (MQ=255) ctcaaaCTATTTACATAAATAAGTAACTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCTAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCt < 2:1745086/131‑1 (MQ=25) tGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCAAAAAGTACATTAACAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTg < 1:2035843/134‑1 (MQ=255) gAAACTTTTTACATCAATAATGTTCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGt < 1:1702722/134‑1 (MQ=255) gAAACTTTTTACATCAACAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTACTAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGt > 2:2062639/1‑134 (MQ=255) aCTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTaaa > 1:1655246/1‑134 (MQ=255) aCTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTaaa > 1:1430863/1‑134 (MQ=255) aCTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAATACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTaaa > 1:2134620/1‑134 (MQ=255) cTTTTTATATCATTCATGATTTTATTCACTCTAATAATATTGTAATAGATAT‑TGACGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATACTAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTaaaa < 1:1376173/134‑1 (MQ=21) ttttACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATa < 2:723196/134‑1 (MQ=255) tgtACATCAATAATGAGCTTAATCAGTCTAATTACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATAc < 2:1998923/132‑1 (MQ=255) tACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACag < 1:1528349/134‑1 (MQ=255) aCATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACaga > 1:688180/1‑134 (MQ=255) aCATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTAAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCATGTAAAATAAaga > 1:687540/1‑134 (MQ=255) aTCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAATTGTTGCGTCGAAAC‑‑‑AAAAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAgaga < 1:2850017/134‑1 (MQ=21) aTCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAgaga < 1:352908/134‑1 (MQ=255) aTCAATAATGAGATTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTATATTAAAAACaataataataataataatcgaattcaacaaaaactaggctacttatcccctgtaaaatacagagaatt > 1:1944840‑M2/1‑66 (MQ=255) tCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGaa < 1:819785/134‑1 (MQ=255) tCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGaa < 1:2788790/134‑1 (MQ=255) aataatGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAAtt < 2:323538/134‑1 (MQ=255) aGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAT‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGcc < 1:2454274/134‑1 (MQ=255) gCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTACACTACTTATCCCCTGTAAAATACACAGAATTAATAGCCt > 2:661161/1‑134 (MQ=255) gCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTAAACAAAAACTAGGCTACTGATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCt > 1:2231769/1‑134 (MQ=255) ttAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAg < 1:7219/134‑1 (MQ=255) aaTCACTCTAACCACCACGTCATACACAG‑TGTCTAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑ACTAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGCATTAATACCCTAGaa > 2:632442/1‑134 (MQ=18) tCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGACGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATACTCGAATTCAACAATAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTATAACa < 2:323848/134‑1 (MQ=255) aCTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATg < 1:763232/134‑1 (MQ=255) ctctAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATgg > 2:675583/1‑134 (MQ=255) tctAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgt < 2:1621160/134‑1 (MQ=255) tctAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgt < 2:2432682/134‑1 (MQ=255) ctAGTCACATTGTAATATATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAT‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGgtg < 1:1547260/134‑1 (MQ=255) acaTTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATCATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATATCCTAGAACATGGTGTTTtta > 1:1950538/1‑134 (MQ=255) tAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑TATAATAATAATAATAATAATTGAATTTAAGAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGGACATGGTGTTTTTATTAAGt < 1:2876079/134‑1 (MQ=21) aaTAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGATAAATAATGACCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGtt > 2:1287054/1‑134 (MQ=255) aTAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAAAAAAAACTAGGCGACAGAACCCCGGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:997390/134‑1 (MQ=21) tAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGTTGTTTTTATTAAGTTcc < 2:1653103/134‑1 (MQ=255) tAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTcc > 2:2423441/1‑134 (MQ=255) gATAT‑TTTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATTATTCTATTAATCTAATTTTTCTTTTTCTTGCCTACTTATCCCCTGTAAACCTCATATATTTAAGTGGCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg < 1:397197/134‑1 (MQ=12) gATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCTAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg < 1:939554/134‑1 (MQ=255) gATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAATCTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg < 1:751284/134‑1 (MQ=255) gATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg < 1:1179044/134‑1 (MQ=255) gATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg < 2:871624/134‑1 (MQ=255) at‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGttt < 1:911927/134‑1 (MQ=255) t‑tGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCTCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGtttt < 1:59460/134‑1 (MQ=255) gTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTACAATACAGAGAATTAATAGCTTAGAACATGGTGTTTTTATTAACTTTCAGTTTTaa > 2:1082768/1‑134 (MQ=21) tCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataataataatcgaattcaacaaaaactaggctacttatcccctgtaaaatacagagaattaatagcctagaacatggtgtttttattaagttcccgttttaagggt > 1:2575614‑M2/1‑20 (MQ=255) gAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAggg > 2:185936/1‑134 (MQ=255) aaaaGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGt < 1:2322825/134‑1 (MQ=255) aaaaGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGt < 2:2404204/134‑1 (MQ=255) aaaaGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATAGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCTTGTAAAATACAGAGAATTATCAGCCTAGAACATAGTGTTTTTATTAAGTTCCCATTTTAAGGGt < 2:923037/134‑1 (MQ=14) aaaGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATACTATTAAATATAATAATATTATTAATTTCCCGTTTTAAGGGta > 1:2703701/1‑133 (MQ=18) aaGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCGACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAAAATTAATAGCGTAGAACATGGTGGTTATATTAAGTTTCCGGTTTAGGGGTTc > 2:2603799/1‑134 (MQ=18) aGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCATTTTAAGGGTTCa > 2:700797/1‑134 (MQ=255) aCATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTg < 2:1984903/134‑1 (MQ=255) aCATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCAGTTTTAAGAGTTCAGTg > 2:164686/1‑134 (MQ=255) aTTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGc < 1:166650/133‑1 (MQ=255) ttAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGacc > 1:2764478/1‑134 (MQ=255) tAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTTAACAAAAATTAGGCTACTTATTTCTTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCt < 1:1855687/134‑1 (MQ=18) tAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTTAACAAAAACTAGCCAACGTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCt < 1:2012531/134‑1 (MQ=255) aaaaaC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTa < 2:323371/134‑1 (MQ=255) aaC‑‑‑AATAATAATAATAATAATACTCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGa > 1:815025/1‑134 (MQ=255) aaC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTAATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGa > 1:2493427/1‑134 (MQ=255) | AGGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATAT‑TGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAATAATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGA > USA300TCH1516_ALE/68522‑68786 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |