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| * | USA300TCH1516_ALE | 618,513 | 0 | T | C | 5.4% | 947.7 / 7.1 | 396 | D1205D (GAT→GAC) | sdrD | Serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
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Only 100 of 405 total aligned reads displayed.
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2:849523/139‑1 (MQ=255) gCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAg < 1:1358273/141‑1 (MQ=255) aCTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATa < 1:1486222/141‑1 (MQ=255) ctaaGATTGAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAg < 2:1022017/138‑1 (MQ=255) cTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAg > 1:3968393/1‑141 (MQ=255) cTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGAATCAGACCAGGACAGCGATTGAGACTCGGAAAGCGACTCAGATACAAATAGCGATACGGGCTAAGAtta > 2:3335864/1‑139 (MQ=14) cAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCg > 1:2621575/1‑141 (MQ=255) aGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGAATCAGACTTCGAGAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGa > 2:525232/1‑141 (MQ=14) gATTCAGCGCGCGAAGCAGACACAGACAGCGACACAGAATCAGATAGAGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGAc < 2:2401498/141‑1 (MQ=14) aTTCAGAcagcgactcagactcagacagcgactcagactcaga > 1:1738187/1‑43 (MQ=35) aTTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACt > 1:602051/1‑141 (MQ=255) | GATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCG‑ACTCAGATTCAGACAGC‑GACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGA‑‑CTCAGAT‑AGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTC > USA300TCH1516_ALE/618373‑618653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |