| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2818806 = | 115 (1.170) | 5 (0.060) | 4/142 | NT | 4.5% | intergenic (‑478/+67) | sraP/USA300HOU_RS14425 | Serine‑rich adhesin for platelets/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2818849 = | 111 (1.270) | intergenic (‑521/+24) | sraP/USA300HOU_RS14425 | Serine‑rich adhesin for platelets/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
AAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2818760‑2818939 | aaaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTaa > 1:3230032/1‑91 (MQ=255)aaaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTaa < 1:1326135/91‑1 (MQ=255)aaaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTaa > 1:3229188/1‑91 (MQ=255) aTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAAtt > 1:3009612/1‑91 (MQ=255) aTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAAtt < 1:2462073/91‑1 (MQ=255) aCCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCa < 1:2283114/91‑1 (MQ=255) cACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACt < 1:516750/91‑1 (MQ=255) aCGACCTATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTa < 1:2180923/91‑1 (MQ=255) cGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTaa < 1:1239617/91‑1 (MQ=255) cGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTaa > 1:1963014/1‑91 (MQ=255) gACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTaaa > 1:3698067/1‑91 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg < 1:98487/91‑1 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg < 1:845529/91‑1 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg < 1:2762945/91‑1 (MQ=255) tatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGa < 1:559527/91‑1 (MQ=255) gCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTaa > 1:2466560/1‑91 (MQ=255) gCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTaa > 1:1879077/1‑91 (MQ=255) tttAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAAt < 1:168/91‑1 (MQ=255) aaCATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTAc < 1:1289295/91‑1 (MQ=255) cATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACtt < 1:2819743/91‑1 (MQ=255) tttCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTtata > 1:3211722/1‑91 (MQ=255) tCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATc < 1:524495/91‑1 (MQ=255) tCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATc < 1:524543/91‑1 (MQ=255) cATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCt > 1:179134/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCtt > 1:4130026/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCtt > 1:959222/1‑91 (MQ=255) tttATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCttt > 1:794673/1‑91 (MQ=255) ttATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCtttt > 1:2104801/1‑91 (MQ=255) tataAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTGAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTc > 1:3934841/1‑91 (MQ=255) ataAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAATGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCa < 1:3292118/91‑1 (MQ=255) aGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtg < 1:4062595/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtga > 1:1041650/1‑91 (MQ=255) gCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtga > 1:2128988/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtgattg > 1:805745/1‑91 (MQ=255) atgcatccttactaaacattcaacttagtagcgatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt > 1:164338‑M2/42‑91 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt < 1:1956553‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt > 1:3253548‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt > 1:1999533‑M1/1‑91 (MQ=255) TGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATc > 1:566882‑M1/1‑91 (MQ=255) gcatccttactaaacattcaacttagtagcgatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCg > 1:937394‑M2/40‑91 (MQ=255) GCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCg < 1:3828133‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCg < 1:537021‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCg > 1:1809147‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa < 1:1458919‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa > 1:4099161‑M1/1‑91 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa < 1:2864085‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa > 1:1931231‑M1/1‑91 (MQ=255) atccttactaaacattcaacttagtagcgatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGaa > 1:1505816‑M2/38‑91 (MQ=255) ATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGaa < 1:378527‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGaa < 1:3699168‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAt > 1:2229100‑M1/1‑91 (MQ=255) ctactaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAttt < 1:1782711/91‑1 (MQ=255) ctactaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAttt < 1:970785/91‑1 (MQ=255) tactaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttc < 1:3455607/91‑1 (MQ=255) ctaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttctt < 1:2964000/91‑1 (MQ=255) ctaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttctt > 1:471233/1‑91 (MQ=255) ctaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttctt < 1:2418011/91‑1 (MQ=255) aaGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAATTTTcttcc > 1:3586148/1‑91 (MQ=255) aaGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcc > 1:1033640/1‑91 (MQ=255) gTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcctt < 1:1433198/91‑1 (MQ=255) gTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcctt < 1:672705/91‑1 (MQ=255) gTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcctt < 1:2223652/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTGAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:2484749/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTGAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:2487548/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:3711807/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:483276/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:2723172/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:397031/91‑1 (MQ=255) gAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTa < 1:3896903/91‑1 (MQ=255) gAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTa > 1:260415/1‑91 (MQ=255) aaTGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTaa < 1:721492/91‑1 (MQ=255) tGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAAc < 1:75920/91‑1 (MQ=255) tGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAAc > 1:1553128/1‑91 (MQ=255) gTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAAcc < 1:838770/91‑1 (MQ=255) gTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAAcc < 1:1832622/91‑1 (MQ=255) tttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCt < 1:750974/91‑1 (MQ=255) tttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCt < 1:3766396/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCTTTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTCTATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTg < 1:4148391/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTCTATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTg < 1:4148334/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTg < 1:3822814/91‑1 (MQ=255) tAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGc < 1:2150310/91‑1 (MQ=255) aGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCt < 1:3900234/91‑1 (MQ=255) aGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCt < 1:2390409/91‑1 (MQ=255) aGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCt < 1:3900053/91‑1 (MQ=255) gTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTa < 1:2369865/91‑1 (MQ=255) gTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTa < 1:2943340/91‑1 (MQ=255) gTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTa < 1:3584835/91‑1 (MQ=255) gTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTa > 1:3467537/1‑91 (MQ=255) tAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTaa < 1:2890218/91‑1 (MQ=255) tAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTaa < 1:1857182/91‑1 (MQ=255) tAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTaa < 1:2907851/91‑1 (MQ=255) aGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAAct > 1:2901379/1‑91 (MQ=255) gatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAActct > 1:1883952‑M2/10‑91 (MQ=255) atgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACtctt > 1:2369157‑M2/9‑91 (MQ=255) atttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCttt < 1:1281306‑M2/87‑1 (MQ=255) atttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCttt < 1:1081725‑M2/87‑1 (MQ=255) ttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAg < 1:3176404‑M2/89‑1 (MQ=255) ttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAg > 1:610294‑M2/3‑91 (MQ=255) ttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAg < 1:554406‑M2/89‑1 (MQ=255) aaTTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGaa < 1:1520739/91‑1 (MQ=255) | AAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2818760‑2818939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |