| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 1975 = | NA (NA) | 276 (0.030) | 24/138 | NT | 12.3% | intergenic (+208/+118) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2042 = | 2275 (0.230) | intergenic (+275/+51) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 7607 total aligned reads displayed.
TGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1955‑2132 | cgttgagcctcggaatccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagcacacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:3539066‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:2759642‑M2/91‑91 (MQ=255)cgtcgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag < 1:3350154‑M2/1‑1 (MQ=255)cgatgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatcgcgcacgctatgccgacattcgtctgcacgattag > 1:962523‑M2/91‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacactcccaaaacatgtcgaatggtcagcttaatagctcccgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 1:3309989‑M2/90‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt > 1:415220‑M2/90‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt < 1:523083‑M2/2‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:2380962‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa > 1:1766678‑M2/88‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 1:2652641‑M2/87‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 1:2020663‑M2/87‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 1:2888083‑M2/87‑91 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 1:3078051‑M2/5‑1 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa > 1:821125‑M2/87‑91 (MQ=255) ttgtcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:3794482‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:391059‑M2/85‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:3610404‑M2/85‑91 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg > 1:1839536‑M2/85‑91 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg > 1:2336964‑M2/84‑91 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg < 1:2792461‑M2/8‑1 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg > 1:139423‑M2/84‑91 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg > 1:402461‑M2/84‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 1:1577268‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 1:2716817‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 1:4067746‑M2/9‑1 (MQ=255) tcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGtt > 1:320135‑M2/82‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 1:1726225‑M2/81‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 1:3389296‑M2/81‑91 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc > 1:3504752‑M2/81‑91 (MQ=255) ccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGc > 1:2926674‑M2/75‑91 (MQ=255) aacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCaa > 1:2180254‑M2/71‑91 (MQ=255) caatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtntgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACg > 1:1291465‑M2/69‑91 (MQ=255) tcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGTCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg > 1:3005299‑M2/36‑91 (MQ=255) cgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGTCTGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc > 1:484666‑M2/35‑91 (MQ=255) acttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc > 1:1044561‑M2/59‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:3571904‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:773788‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:2839850‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:1254272‑M2/86‑1 (MQ=255) gtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:1806022‑M2/29‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:3980746‑M2/5‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:1219195‑M2/5‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2295981‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa < 1:3158268‑M2/88‑1 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa < 1:2970431‑M2/88‑1 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:857399‑M2/4‑91 (MQ=255) cggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:3682380‑M2/27‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat < 1:3270699‑M2/90‑1 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:3645733‑M2/2‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:1353061‑M2/2‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGATTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCACTTGGaataaat > 1:3754680‑M2/2‑91 (MQ=255) ataGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata > 1:3114764‑M2/4‑91 (MQ=255) taGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 1:1514239‑M2/89‑1 (MQ=255) taGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 1:2521125‑M2/89‑1 (MQ=255) atagctcacgctatgccgacCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTa > 1:2690086‑M2/21‑91 (MQ=255) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:1322146/1‑91 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:2551504/1‑91 (MQ=37) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAGATAGTATc > 1:118093/1‑91 (MQ=25) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:1433647/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:4106646/91‑1 (MQ=38) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt > 1:3946006/1‑91 (MQ=39) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa > 1:638403/1‑91 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa > 1:897477/1‑91 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 1:603752/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa < 1:22517/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:2486809/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc < 1:2588678/91‑1 (MQ=255) ccGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt > 1:1000232/1‑91 (MQ=255) ccGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt < 1:1876044/91‑1 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt > 1:1148551/1‑91 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:2135058/91‑1 (MQ=255) gACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:1916029/91‑1 (MQ=255) aCCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt > 1:741746/1‑91 (MQ=255) ccATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:2211537/1‑91 (MQ=255) ATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 1:1655024‑M2/91‑1 (MQ=255) TTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg < 1:1614903‑M2/91‑1 (MQ=255) TTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg > 1:3237067‑M2/1‑91 (MQ=255) TTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg > 1:2416483‑M2/1‑91 (MQ=255) CG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 1:570823‑M2/91‑1 (MQ=255) CG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt > 1:1945771‑M2/1‑91 (MQ=255) aCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTa > 1:708264/1‑91 (MQ=255) aCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTa > 1:1116038/1‑91 (MQ=255) GTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAtt > 1:3718318‑M2/1‑91 (MQ=255) GTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACAtt < 1:448315‑M2/91‑1 (MQ=255) TTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg > 1:1079742‑M2/1‑91 (MQ=255) TTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg > 1:1547441‑M2/1‑91 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa < 1:1980569/91‑1 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt > 1:674368/1‑91 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc > 1:3468106/1‑91 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2617244/91‑1 (MQ=255) gATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATc < 1:2056520/91‑1 (MQ=255) aTTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATcc < 1:3830090/91‑1 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCGACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:2095437/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:244768/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:1473267/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:931959/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:3430011/1‑91 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGAATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 1:3871960/1‑91 (MQ=255) GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTc > 1:3042947‑M2/1‑91 (MQ=255) GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTc < 1:1692035‑M2/91‑1 (MQ=255) | TGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCG‑‑‑ACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1955‑2132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |