| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 1992 | 2238 (0.220) | 1026 (0.110) | 41/148 | NT | 36.5% | intergenic (+225/+101) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 2020 | 1505 (0.160) | intergenic (+253/+73) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 5162 total aligned reads displayed.
ATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTT > NC_012417/1931‑2110 | aTTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACc < 1:227887‑M2/91‑2 (MQ=255) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCGGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcat < 1:208233‑M2/91‑4 (MQ=255) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcat > 1:4122798‑M2/1‑88 (MQ=255) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattc < 1:2114697‑M2/91‑6 (MQ=255) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattc < 1:1262178‑M2/91‑6 (MQ=255) aTGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattc > 1:1300084‑M2/1‑86 (MQ=255) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcg < 1:3649459‑M2/91‑7 (MQ=255) tGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcg > 1:569607‑M2/1‑85 (MQ=255) GCCGAGAANATTNANTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:270136‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:1115914‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 1:49850‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa > 1:1693701‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:368310‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:2045004‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:1839655‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:2905008‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:2494618‑M1/1‑91 (MQ=255) CCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGAc > 1:1154353‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACaa > 1:3615146‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACaa > 1:925329‑M1/1‑91 (MQ=255) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGt < 1:425280/91‑1 (MQ=31) gaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGt < 1:2949375/91‑1 (MQ=31) aaCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatccataaatttt < 1:3968364‑M2/91‑48 (MQ=255) cTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattt < 1:1571416‑M2/91‑50 (MQ=255) gCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcgg < 1:3571773‑M2/91‑53 (MQ=255) cAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggc < 1:1723664‑M2/91‑54 (MQ=255) aaTGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattccactgcaagtttagctaagggttcttctcaacatcaataaattttctccgcata < 1:3861135‑M2/91‑60 (MQ=255) tGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaa < 1:3936718‑M2/91‑62 (MQ=255) gTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 1:404498‑M2/91‑63 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:133809‑M2/86‑1 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:2531043‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:2770573‑M2/86‑1 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:642559‑M2/86‑1 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:1452911‑M2/86‑1 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:1539164‑M2/6‑91 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 1:2601805‑M2/91‑64 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 1:1415630‑M2/91‑64 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatg < 1:3140065‑M2/91‑64 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:1938747‑M2/5‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:242792‑M2/5‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata > 1:1219195‑M2/5‑91 (MQ=255) cGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:3406809‑M2/91‑65 (MQ=255) cGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:2822568‑M2/91‑65 (MQ=255) cGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:3094061‑M2/91‑65 (MQ=255) cGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:1613399‑M2/91‑65 (MQ=255) cGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgc < 1:1496723‑M2/91‑65 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:3484188‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2167312‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:780936‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa < 1:2987997‑M2/88‑1 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:965010‑M2/4‑91 (MQ=255) ggCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACcattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttttcggcataaatacg < 1:2361053‑M2/91‑66 (MQ=255) ggCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgt < 1:3299280‑M2/91‑66 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:2635941‑M2/2‑91 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaat > 1:4080968‑M2/2‑91 (MQ=255) ataGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata > 1:3233604‑M2/4‑91 (MQ=255) ataGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 1:2860397‑M2/88‑1 (MQ=255) taGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAg < 1:13806‑M2/89‑1 (MQ=255) gCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTa > 1:455739/1‑91 (MQ=35) cGTGAGCTATTAAGCCGACattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctat < 1:2320883‑M2/91‑73 (MQ=255) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:1650580/1‑91 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt < 1:1180666/91‑1 (MQ=37) cGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 1:344926/1‑91 (MQ=37) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:2664160/91‑1 (MQ=38) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:3788888/91‑1 (MQ=38) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt > 1:1076794/1‑91 (MQ=39) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 1:3526408/1‑91 (MQ=40) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa < 1:2569494/91‑1 (MQ=40) aGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa > 1:1908239/1‑91 (MQ=255) aGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaa > 1:1971193/1‑91 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg < 1:3059871/91‑1 (MQ=255) cTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg < 1:220178/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa < 1:1768416/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa < 1:3754597/91‑1 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:2459109/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:853905/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTCTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:389537/1‑91 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc < 1:3718250/91‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc < 1:3374388/91‑1 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAc > 1:3342254/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 1:2240466/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 1:4004770/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:3823201/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:3266584/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:715644/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:53259/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:1038514/91‑1 (MQ=255) gCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCg < 1:180902/91‑1 (MQ=255) ccGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt < 1:1876044/91‑1 (MQ=255) ccGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt > 1:815538/1‑91 (MQ=255) ccGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGt > 1:1000232/1‑91 (MQ=255) cGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:2747339/91‑1 (MQ=255) cGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa > 1:3026006/1‑91 (MQ=255) gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt > 1:611290/1‑91 (MQ=255) gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:676351/91‑1 (MQ=255) gACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAt < 1:743675/91‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:201045/1‑91 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:2405133/91‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:889018/91‑1 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:3186045/1‑91 (MQ=255) | ATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTT > NC_012417/1931‑2110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |