| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 790,718 | T→A | 6.7% | intergenic (+217/‑257) | kipA_1 → / → ltaS | KipI antagonist/Lipoteichoic acid synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 790,718 | 0 | T | A | 6.7% | 419.8 / 16.5 | 120 | intergenic (+217/‑257) | kipA_1/ltaS | KipI antagonist/Lipoteichoic acid synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/54); new base A (3/5); total (61/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
ATAAAGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCAAAGTT > USA300TCH1516_ALE/790628‑790807 | aTAAAGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAAtttt < 1:192321/91‑1 (MQ=255) tAAAGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTa < 1:3774731/91‑1 (MQ=255) aaGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTaaa > 1:1918501/1‑91 (MQ=255) aGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAAt < 1:1058466/91‑1 (MQ=255) aGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAAt > 1:2338612/1‑91 (MQ=255) aGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTAAAAt < 1:2939132/91‑1 (MQ=255) aGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTAAAAt < 1:346451/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg < 1:3433456/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg > 1:1075912/1‑91 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg < 1:625449/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg < 1:625367/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg < 1:625294/91‑1 (MQ=255) gtgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTg < 1:3770147/91‑1 (MQ=255) tgtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGt > 1:1504790/1‑91 (MQ=255) gtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGtt > 1:2729276/1‑91 (MQ=255) gtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGtt > 1:2729216/1‑91 (MQ=255) gtTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGtt > 1:1519220/1‑91 (MQ=255) ttACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATTAACAAATTTAAAATTTGtaatc < 1:1685283/91‑5 (MQ=38) tACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTg < 1:1669729/91‑1 (MQ=255) aCTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGa > 1:1014174/1‑91 (MQ=255) cTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGaa > 1:2902238/1‑91 (MQ=255) cTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGaa > 1:4072643/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAAt > 1:1654834/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAAt < 1:3947273/91‑1 (MQ=255) ttGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAAt < 1:2524910/91‑1 (MQ=255) tGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATg < 1:373708/91‑1 (MQ=255) aaTTTTGTCTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTATTTGAATGat < 1:2080194/91‑1 (MQ=255) aaTTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGat < 1:269742/91‑1 (MQ=255) aaTTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGat < 1:2035184/91‑1 (MQ=255) tGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTGTTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAatat < 1:4139603/91‑1 (MQ=255) tGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAatat > 1:3513160/1‑91 (MQ=255) gACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATAtt > 1:2679876/1‑91 (MQ=255) aCTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATATGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATta < 1:3588868/91‑1 (MQ=255) cTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATtaa > 1:1918759/1‑91 (MQ=255) aaaaTTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATtaaat < 1:37252/91‑1 (MQ=255) aaaTTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATtaaata > 1:1844327/1‑91 (MQ=255) aaaTTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATtaaata > 1:797434/1‑91 (MQ=255) aTTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATtaaataaa < 1:3819248/91‑1 (MQ=255) aCTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGaa > 1:3446930/1‑91 (MQ=255) ctctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGaaa < 1:2461938/91‑1 (MQ=255) tctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAAc < 1:1603488/91‑1 (MQ=255) tctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAAc > 1:2563473/1‑91 (MQ=255) tctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAAc > 1:2442938/1‑91 (MQ=255) tctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAAc > 1:504583/1‑91 (MQ=255) tctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAAc > 1:2259546/1‑91 (MQ=255) ctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACt < 1:2323650/91‑1 (MQ=255) ctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACt > 1:1894700/1‑91 (MQ=255) ctATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACt < 1:161707/91‑1 (MQ=255) tataTTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACtt > 1:2017233/1‑91 (MQ=255) tataTTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACtt > 1:182148/1‑91 (MQ=255) atatTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTa < 1:1007685/91‑1 (MQ=255) atatTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTa > 1:1613810/1‑91 (MQ=255) atatTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTa < 1:1009122/91‑1 (MQ=255) tatttattAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTac < 1:2346813/91‑1 (MQ=255) atttattAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTaca < 1:3707080/91‑1 (MQ=255) ttattaATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTAcaca < 1:804394/91‑1 (MQ=255) tattaATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACaa > 1:1483870/1‑91 (MQ=255) attaATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAg > 1:3634248/1‑91 (MQ=255) attaATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAg > 1:3634222/1‑91 (MQ=255) ttaATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGc < 1:407753/91‑1 (MQ=255) taATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCa > 1:341320/1‑91 (MQ=255) aaTTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCaa > 1:766589/1‑91 (MQ=255) aaTTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCaa > 1:2930578/1‑91 (MQ=255) aaTTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCaa > 1:1820901/1‑91 (MQ=255) aTTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCaaa > 1:1412708/1‑91 (MQ=255) aTTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCaaa < 1:2097812/91‑1 (MQ=255) gAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAatat < 1:2639596/91‑1 (MQ=255) aGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATg < 1:2768424/91‑1 (MQ=255) aGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATg < 1:2768157/91‑1 (MQ=255) cTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAg < 1:1661886/91‑1 (MQ=255) aTGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGtt > 1:1958846/1‑91 (MQ=255) tGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTg > 1:2568915/1‑91 (MQ=255) tGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTg < 1:1535840/91‑1 (MQ=255) cTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTa > 1:308372/1‑91 (MQ=255) cTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTa > 1:308176/1‑91 (MQ=255) tattattaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGc > 1:2284029/1‑91 (MQ=255) tattattaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGc > 1:2060882/1‑91 (MQ=255) ttattaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGccc < 1:211109/91‑1 (MQ=255) ttattaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGccc > 1:1606507/1‑91 (MQ=255) tattaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCa < 1:2824829/91‑1 (MQ=255) attaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCaa < 1:1015524/91‑1 (MQ=255) attaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCaa > 1:135405/1‑91 (MQ=255) ttaCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCaaa < 1:1358741/91‑1 (MQ=255) taCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCaaaa < 1:3315084/91‑1 (MQ=255) aCAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAAt < 1:279361/91‑1 (MQ=255) aTTTGATT‑ACACATTTTAAATTTGTTCAATGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACt > 1:2650755/1‑91 (MQ=255) ttGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTg < 1:3354096/91‑1 (MQ=255) aTT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTa > 1:3134479/1‑91 (MQ=255) aTT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTa > 1:1152871/1‑91 (MQ=255) tt‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTaa > 1:1245454/1‑91 (MQ=255) tt‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTaa > 1:688302/1‑91 (MQ=255) aaCAAATTTAAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATCCTTGTTaaa > 1:3974024/2‑91 (MQ=255) aaCAAATTTAAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTaaa > 1:3974085/2‑91 (MQ=255) aCAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAAt < 1:1272098/91‑1 (MQ=255) aCAAATTTAAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCCAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAAt > 1:3685328/1‑91 (MQ=255) cAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATc < 1:2273895/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCaa > 1:474216/1‑91 (MQ=255) aaTTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCaa > 1:474233/1‑91 (MQ=255) ttAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACTCAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCAAAGtt < 1:3297388/91‑1 (MQ=255) ttAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCAAAGtt > 1:2433026/1‑91 (MQ=255) | ATAAAGTGTGTTTTTACTTGAATTTTGACTAAAATTACTCTATATTTATTAATTGAGCTATGCTTATTATTACAATTTGATT‑ACAAATTTTAAATTTGTTAATTGAATGATAATATTAAATAAAGAAACTTACACAAGCAAATATGAGTTGTAGCCCAAAATACTTGTTAAATCAAAGTT > USA300TCH1516_ALE/790628‑790807 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |