Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | A→G | 20.4% | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920 ← / ← dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | 0 | A | G | 20.4% | 315.8 / 77.3 | 148 | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920/dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/70); new base G (16/14); total (64/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803449‑803629 | tCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGa > 1:69172/1‑91 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATTCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt < 1:1935491/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:1537562/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:1537454/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:342509/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:1507259/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:3244959/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTa < 1:1000500/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTa < 1:1000486/91‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTAc < 1:3130053/91‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 1:752476/1‑91 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt < 1:906410/91‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACATATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 1:2930543/1‑91 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:3080906/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg < 1:430098/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg < 1:2949563/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑t < 1:3223031/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑t < 1:2016292/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑t < 1:3904771/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑t < 1:943911/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑t < 1:1399710/91‑1 (MQ=255) gAGCAGATTAAGTTTTTATTTATACAGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑t < 1:3861506/91‑1 (MQ=37) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tt < 1:1220105/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tt < 1:337237/91‑1 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑ttttt < 1:3811944/91‑1 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑ttttt < 1:1280891/91‑1 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑ttttt > 1:781582/1‑91 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑ttttt < 1:3320082/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tttttt < 1:222773/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tttttt < 1:2473594/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tttttt < 1:222311/91‑1 (MQ=255) atTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑ttttttt < 1:233060/91‑2 (MQ=255) aaGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAAt > 1:4146088/1‑91 (MQ=255) aaGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAAt > 1:3199616/1‑91 (MQ=255) tttatttaTACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGc < 1:2456650/91‑1 (MQ=255) tttatttaTACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGc < 1:2456843/91‑1 (MQ=255) ttatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGcc < 1:1298571/91‑1 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCca < 1:370709/91‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:3631953/91‑1 (MQ=255) ttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGcctggc < 1:2659753/91‑5 (MQ=255) aCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAatat > 1:2006652/1‑91 (MQ=255) aCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAatat > 1:2006414/1‑91 (MQ=255) cTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt > 1:1799114/1‑91 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTa < 1:1743069/91‑1 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTa > 1:943874/1‑91 (MQ=255) tatCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACg > 1:1048328/1‑91 (MQ=255) atCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGt < 1:4124246/91‑1 (MQ=255) gAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATAcc > 1:595555/1‑91 (MQ=255) gAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATAcc > 1:1194264/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt > 1:1870769/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt > 1:3037516/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt > 1:1502644/1‑91 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCa > 1:3950607/1‑91 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCa < 1:2406444/91‑1 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt < 1:876499/91‑1 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 1:2091174/1‑91 (MQ=255) taatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATCCCTTTCATCGc > 1:3761683/1‑91 (MQ=255) taatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGc > 1:2877706/1‑91 (MQ=255) aatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCt < 1:2544376/91‑1 (MQ=255) aatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCt < 1:2544475/91‑1 (MQ=255) aatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCt > 1:939640/1‑91 (MQ=255) atAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCtt < 1:1035019/91‑1 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCttt < 1:526296/91‑1 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCttt > 1:936906/1‑91 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:911597/91‑1 (MQ=255) gAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga < 1:1475266/91‑1 (MQ=255) aaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg < 1:2298952/91‑1 (MQ=255) aCCGATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtaatga < 1:3268111/91‑1 (MQ=255) ccTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTgatgat > 1:2018683/1‑91 (MQ=255) ccTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTgatgat > 1:1778874/1‑91 (MQ=255) cTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGAtt > 1:1199941/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 1:2803526/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa < 1:2840912/91‑1 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaa < 1:2635050/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:2491773/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:2287592/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 1:1174408/1‑91 (MQ=255) cAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAt > 1:3607434/1‑91 (MQ=255) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg > 1:3488346/1‑91 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg < 1:761257/91‑1 (MQ=255) aagtcATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt > 1:789015/5‑91 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTgag > 1:261474/1‑89 (MQ=255) gCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTaa > 1:1999666/1‑91 (MQ=255) tcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTaa > 1:2873853/2‑91 (MQ=39) ccATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 1:588354/91‑1 (MQ=255) cATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATa > 1:564216/1‑91 (MQ=255) cATTTAAATAACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATa < 1:3979440/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc > 1:4024388/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc < 1:316186/91‑1 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTATGCCAACAATATTAACGTATACCTCTCATCGCTTTGCTGATTACAGGTGACATTGCTAATACa > 1:1221316/1‑91 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:355324/1‑91 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:2784774/1‑91 (MQ=255) tttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:2997190/1‑91 (MQ=255) ttAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa > 1:899645/1‑91 (MQ=255) ttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa < 1:2138224/91‑1 (MQ=255) ttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa < 1:284989/91‑1 (MQ=255) ttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa > 1:2901066/1‑91 (MQ=255) aaTGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACTAttg > 1:3460748/1‑91 (MQ=255) aaTGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttg > 1:1360263/1‑91 (MQ=255) aCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATtgttgt > 1:2693275/1‑91 (MQ=255) | TCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803449‑803629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |