| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 937,148 | T→C | 6.4% | intergenic (+55/‑76) | USA300HOU_RS04665 → / → pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 937,148 | 0 | T | C | 6.4% | 445.6 / 15.9 | 140 | intergenic (+55/‑76) | USA300HOU_RS04665/pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/71); new base C (2/7); total (62/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GGTATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTA > USA300TCH1516_ALE/937058‑937238 | ggtATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGt > 1:1307837/1‑91 (MQ=255) gtATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTc > 1:518985/1‑91 (MQ=255) aTCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCt > 1:56392/1‑91 (MQ=255) aTCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCt < 1:3427283/91‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt < 1:101636/91‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt < 1:1722888/91‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt < 1:1240259/91‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt < 1:37953/91‑1 (MQ=255) gTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAg < 1:3260519/91‑1 (MQ=255) ttAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtg < 1:1611847/91‑1 (MQ=255) ttAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtg < 1:843424/91‑1 (MQ=255) tAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtgt > 1:2181116/1‑91 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACt < 1:1725624/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTg < 1:489245/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTg > 1:182460/1‑91 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTg < 1:4110666/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGa > 1:2817560/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 1:1237925/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 1:3252586/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 1:1933731/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATATATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 1:3868814/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAg < 1:1286519/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAgg < 1:2992960/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGACACTGAAgga < 1:1850135/91‑2 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAgga < 1:516045/91‑2 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAgga < 1:250435/91‑2 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAgga < 1:4129980/91‑2 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 1:3186973/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAggac < 1:655312/91‑3 (MQ=255) aGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCtt < 1:2406645/91‑1 (MQ=255) aGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCtt > 1:1759527/1‑91 (MQ=255) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt < 1:819151/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:1289911/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:4030958/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:2778795/1‑91 (MQ=255) aaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttg > 1:3029695/1‑91 (MQ=255) aaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTAtaa < 1:4013448/91‑3 (MQ=37) tCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgttg < 1:1832324/91‑1 (MQ=255) cTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATtgttgt > 1:493963/1‑91 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa > 1:562041/1‑91 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa > 1:1650970/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt < 1:2821316/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt < 1:2821139/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAtt < 1:3889794/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAtt < 1:1151590/91‑1 (MQ=255) ttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAttt > 1:3371320/1‑91 (MQ=255) ttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAttt < 1:682371/91‑1 (MQ=255) ttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATAAAATTATTCATTGATAAAGTCGTTCGGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAttt < 1:3316070/91‑1 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGa < 1:4024728/91‑1 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa < 1:2010426/91‑1 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:1382782/1‑91 (MQ=255) ataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAg < 1:2958821/91‑1 (MQ=255) aaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTg > 1:589132/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg > 1:3166221/1‑91 (MQ=255) tttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTa < 1:3642033/91‑1 (MQ=255) tttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTa < 1:1359371/91‑1 (MQ=255) tCAGCTAAACACATAAACTTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCCCTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAAc < 1:849827/91‑1 (MQ=255) tCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAAc < 1:3571394/91‑1 (MQ=255) cAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACa > 1:487809/1‑91 (MQ=255) cTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACatat < 1:3906127/91‑1 (MQ=255) cTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACatat < 1:2618526/91‑1 (MQ=255) cTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACatat < 1:2618500/91‑1 (MQ=255) tAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATc < 1:3168045/91‑1 (MQ=255) aaaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCa < 1:2865475/91‑1 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaa > 1:734800/1‑91 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa > 1:1516722/1‑91 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 1:2727726/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTa > 1:582618/1‑91 (MQ=255) aTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGGGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTa > 1:638407/1‑91 (MQ=255) tAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTaa > 1:3714407/1‑91 (MQ=255) aaattaaattATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAagg < 1:714133/91‑1 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3243393/91‑1 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:684625/91‑1 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt > 1:2406481/1‑91 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc < 1:120228/91‑1 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc > 1:3922609/1‑91 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc < 1:822949/91‑1 (MQ=255) ttattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACAt > 1:2466310/1‑91 (MQ=255) ttattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACAt < 1:717952/91‑1 (MQ=255) ttattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACAt < 1:1396910/91‑1 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa < 1:1088817/91‑1 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa > 1:3642709/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa < 1:1113093/91‑1 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa < 1:2102628/91‑1 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa > 1:3642780/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 1:3092632/91‑1 (MQ=255) ttATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAtt < 1:3006547/91‑1 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt < 1:3041562/91‑1 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt < 1:3038624/91‑1 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt < 1:2473091/91‑1 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt > 1:3590268/1‑91 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt > 1:1751882/1‑91 (MQ=255) aataAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTAAGAAttt > 1:2087014/2‑91 (MQ=25) aaaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa > 1:3465684/1‑91 (MQ=255) aaaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa > 1:3019204/1‑91 (MQ=255) aaaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa > 1:162476/1‑91 (MQ=255) aaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaa < 1:273624/91‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatt > 1:1827575/1‑91 (MQ=255) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 1:3129359/1‑91 (MQ=255) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 1:3128357/1‑91 (MQ=255) | GGTATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTA > USA300TCH1516_ALE/937058‑937238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |