| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 962,321 | G→A | 6.9% | intergenic (+25/‑135) | spsB_2 → / → addB | Signal peptidase IB/ATP‑dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 962,321 | 0 | G | A | 6.9% | 387.7 / 12.6 | 116 | intergenic (+25/‑135) | spsB_2/addB | Signal peptidase IB/ATP‑dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/61); new base A (4/4); total (51/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATCAATCACA > USA300TCH1516_ALE/962231‑962410 | tCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTACAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTg > 1:3544521/1‑91 (MQ=255)tCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTg > 1:2639784/1‑91 (MQ=255)tCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTg < 1:1324339/91‑1 (MQ=255)tCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTg < 1:1324221/91‑1 (MQ=255)tCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTg < 1:2514143/91‑1 (MQ=255) cATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGt > 1:3940233/1‑91 (MQ=255) aTTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTc > 1:919763/1‑91 (MQ=255) ttAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCgg < 1:2280481/91‑1 (MQ=255) aGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGtt < 1:941416/91‑1 (MQ=255) cTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAAt < 1:2591020/91‑1 (MQ=255) cTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAAt > 1:200037/1‑91 (MQ=255) cTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAAt < 1:1056523/91‑1 (MQ=255) cTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAAt < 1:3806064/91‑1 (MQ=255) gCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACt < 1:2637128/91‑1 (MQ=255) gCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACt > 1:3876438/1‑91 (MQ=255) gCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACt > 1:3876420/1‑91 (MQ=255) ccATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTg > 1:101780/1‑91 (MQ=255) ccATTTAGTGAATTTAAACATAATGTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATAAAACATCGTTTATCAGTATTAAAAccg < 1:1582668/91‑3 (MQ=25) tttAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATa > 1:2774868/1‑91 (MQ=255) tttAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATa > 1:2774367/1‑91 (MQ=255) tttAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATa > 1:900638/1‑91 (MQ=255) tAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATaaa < 1:2662405/91‑1 (MQ=255) aGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAAc > 1:510585/1‑91 (MQ=255) gTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACg < 1:1016794/91‑1 (MQ=255) gTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACg < 1:356379/91‑1 (MQ=255) tGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGa < 1:1833661/91‑1 (MQ=255) tGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGa < 1:1849993/91‑1 (MQ=255) gAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGAt > 1:3266146/1‑91 (MQ=255) gAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTATCAGTATTAAAACCGACAAACGAt < 1:1811360/91‑1 (MQ=21) tttAAACATCATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGtt < 1:3904351/91‑1 (MQ=255) tttAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGtt < 1:708920/91‑1 (MQ=255) tttAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGtt < 1:709640/91‑1 (MQ=255) ttAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGttt < 1:1232550/91‑1 (MQ=255) tAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGtttt < 1:2884851/91‑1 (MQ=255) tAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGtttt < 1:2991357/91‑1 (MQ=255) aCATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATCTTTTAtt > 1:2070280/1‑91 (MQ=255) cATAATTTCAATCCTGAAAATACTATAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTAttt < 1:3875613/91‑1 (MQ=255) cATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACCACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAGCGATGTTTTAttt > 1:4153646/1‑91 (MQ=255) cATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACCACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAGCGATGTTTTAttt > 1:4153589/1‑91 (MQ=255) aaTTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGt > 1:3661975/1‑91 (MQ=255) aTTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATAAAACATCGTTTATCAGTATTAAAACCGACAAACGATGTTGTAtttgttt < 1:2996262/91‑5 (MQ=2) ttCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAg < 1:4059980/91‑1 (MQ=255) cAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTa > 1:701139/1‑91 (MQ=255) aaTCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTAc > 1:2876056/1‑91 (MQ=255) aTCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTAcc < 1:578937/91‑1 (MQ=255) aTCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTAcc < 1:578854/91‑1 (MQ=255) tCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACca > 1:425641/1‑91 (MQ=255) tCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACca > 1:426048/1‑91 (MQ=255) gAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAAt > 1:87159/1‑91 (MQ=255) gAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAAt < 1:510869/91‑1 (MQ=255) aaaTACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTCATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATaa < 1:3596343/91‑1 (MQ=255) aaaTACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATaa < 1:1812934/91‑1 (MQ=255) aTACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATaaaa > 1:1271017/1‑91 (MQ=255) aTACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATaaaa > 1:1267726/1‑91 (MQ=255) tACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAg < 1:2310791/91‑1 (MQ=255) cTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCt < 1:3627356/91‑1 (MQ=255) tAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTa > 1:1956067/1‑91 (MQ=255) tAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTa < 1:466858/91‑1 (MQ=255) tAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTa > 1:1600585/1‑91 (MQ=255) tAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTa > 1:1600577/1‑91 (MQ=255) tAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCCGTTTTAATACTGACAAACGATGTTTTAGTTTGTTAGTACCACAATAACAGCTa > 1:3861976/1‑91 (MQ=255) aaaTTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCTGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGt < 1:756104/91‑1 (MQ=255) aaTTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGtt < 1:1660082/91‑1 (MQ=255) aaTTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGtt < 1:3358280/91‑1 (MQ=255) aTTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTc < 1:1140391/91‑1 (MQ=255) aTTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTc < 1:1142369/91‑1 (MQ=255) aaTATGAATCAAATACCACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaa < 1:1299492/91‑1 (MQ=255) aaTATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaa > 1:1441699/1‑91 (MQ=255) aaTATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaa > 1:1441625/1‑91 (MQ=255) atatGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTcattt < 1:4055556/91‑5 (MQ=255) atatGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaaa < 1:2507486/91‑1 (MQ=255) atatGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaaa > 1:2095850/1‑91 (MQ=255) atatGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGaaa < 1:1027944/91‑1 (MQ=255) tatGAAACACATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAAt < 1:3964368/91‑1 (MQ=255) tatGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAAt > 1:524220/1‑91 (MQ=255) atGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATg > 1:943777/1‑91 (MQ=255) atGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATg > 1:3807276/1‑91 (MQ=255) atGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATg > 1:3806860/1‑91 (MQ=255) atGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATg > 1:3807288/1‑91 (MQ=255) atGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATg > 1:3244578/1‑91 (MQ=255) aaaCAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAAc < 1:34937/91‑1 (MQ=255) caaaaTAAAACATCGTTTATCAGTATTAAAACCGACAAACGATGTTGTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACtt > 1:697530/3‑91 (MQ=2) aCAAATGCAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACtt > 1:1013211/1‑91 (MQ=255) cAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTta < 1:753074/91‑1 (MQ=255) aaTAAAACATCGTTTATCAGTATTAAAACCGACAAACGATGTTGTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTtata > 1:778764/1‑91 (MQ=14) aTACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATTCTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTataa < 1:1852879/91‑1 (MQ=255) aTACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTataa < 1:2110339/91‑1 (MQ=255) tACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTataat > 1:580379/1‑91 (MQ=255) acaacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTataata < 1:829996/91‑1 (MQ=255) acaacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTataata < 1:1857396/91‑1 (MQ=255) caacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTAtaataa > 1:3189508/1‑91 (MQ=255) caacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTAtaataa > 1:3428707/1‑91 (MQ=255) aaacaTCGTTTATCAGTATTAAAACCGACAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTAtaataa > 1:3141644/2‑91 (MQ=18) aacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATaaa > 1:1853407/1‑91 (MQ=255) aacaTCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATaaa < 1:2730822/91‑1 (MQ=255) cGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAaatcaat < 1:2117156/91‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATcaatcac < 1:113692/91‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATcaatcac < 1:113674/91‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATcaatcac < 1:3689991/91‑1 (MQ=255) tGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATcaatcaca > 1:2580247/1‑91 (MQ=255) | TCATTTAGGTTCTGGCCATTTAGTGAATTTAAACATAATTTCAATCCTGAAAATACTAAAAATTAATATGAAACAAATACAACATCGTTTGTCGGTTTTAATACTGATAAACGATGTTTTATTTTGTTAGTACCACAATAAAAGCTAAGTTCGAAATGAACTTATAATAAATCAATCACA > USA300TCH1516_ALE/962231‑962410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |