| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,117,393 | C→G | 6.9% | intergenic (+106/+48) | suhB_1 → / ← USA300TCH1516_01040 | Inositol‑1‑monophosphatase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,117,393 | 0 | C | G | 6.9% | 406.0 / 15.9 | 116 | intergenic (+106/+48) | suhB_1/USA300TCH1516_01040 | Inositol‑1‑monophosphatase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/67); new base G (2/6); total (43/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TATGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTGTAGTAA > USA300TCH1516_ALE/1117303‑1117481 | TATGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTtcatc < 1:3254376‑M1/91‑1 (MQ=255)TATGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTtcatc < 1:3470220‑M1/91‑1 (MQ=255)TATGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAACGTtcatc < 1:2070733‑M1/91‑1 (MQ=255) tgttacctaattgttaggactacatattacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTcatcat > 1:3558223‑M2/37‑91 (MQ=255) TGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTcatcat > 1:2519496‑M1/1‑91 (MQ=255) GTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATg > 1:69175‑M1/1‑91 (MQ=255) aGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGaa < 1:2680417/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGaa < 1:2019125/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGaa < 1:2096266/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGaa < 1:1483770/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGaa < 1:2791869/91‑1 (MQ=255) gTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAAc < 1:759560/91‑1 (MQ=255) acctaattgttaggactacatattacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAAc > 1:3939427‑M2/33‑91 (MQ=255) ccTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAt > 1:1243152/1‑91 (MQ=255) cTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtg < 1:2842471/91‑1 (MQ=255) tAACAGTTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATGATAAAAACACGCGGCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgt < 1:3856578/91‑1 (MQ=255) aaCAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtg < 1:3231897/91‑1 (MQ=255) aaCAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtg < 1:3232519/91‑1 (MQ=255) aCAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATGATGAACAtttaa < 1:162538/91‑5 (MQ=255) aCAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtgt < 1:2791160/91‑1 (MQ=255) aCAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtgt < 1:259507/91‑1 (MQ=255) cAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTGAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtgtg < 1:3537544/91‑1 (MQ=255) cAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtgtg > 1:3828732/1‑91 (MQ=255) cAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACAtgtgtg > 1:553730/1‑91 (MQ=255) tAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCt < 1:394833/91‑1 (MQ=255) tAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTaaa > 1:207626/1‑91 (MQ=255) tAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTaaa < 1:914899/91‑1 (MQ=255) tAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTaaa < 1:3564524/91‑1 (MQ=255) tAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTaaa < 1:3201672/91‑1 (MQ=255) acatattacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATc > 1:240475‑M2/16‑91 (MQ=255) catattacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCa < 1:3899963‑M2/77‑1 (MQ=255) tattacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAc < 1:1055597‑M2/79‑1 (MQ=255) attacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcg < 1:3649285‑M2/80‑1 (MQ=255) ttacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgc < 1:1710098‑M2/81‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:3928133‑M2/82‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:3927940‑M2/82‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:2439682‑M2/82‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:2880712‑M2/82‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:1974980‑M2/82‑1 (MQ=255) tacgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAAcgcg < 1:3606475‑M2/82‑1 (MQ=255) acgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCgt > 1:2903676‑M2/9‑91 (MQ=255) cgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCgtg > 1:3643939‑M2/8‑91 (MQ=255) cgcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCgtg > 1:3643983‑M2/8‑91 (MQ=255) gcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCCGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGcgtgg > 1:2314986‑M2/7‑90 (MQ=255) gcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCgtgt > 1:1054742‑M2/7‑91 (MQ=255) gcttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCgtgt < 1:346961‑M2/85‑1 (MQ=255) cttttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGtt > 1:3377872‑M2/6‑91 (MQ=255) tttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTAt < 1:1629583‑M2/88‑1 (MQ=255) tttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTAt < 1:1629262‑M2/88‑1 (MQ=255) ttATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTAtt < 1:1465716‑M2/89‑1 (MQ=255) taCCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTc < 1:1770974/91‑1 (MQ=255) ccTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGa > 1:513014/1‑91 (MQ=255) ttAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGata > 1:1384238/1‑91 (MQ=255) aaaTAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGAtata > 1:3089350/1‑91 (MQ=255) aaaTAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGAtata < 1:2979778/91‑1 (MQ=255) ataaAAACACGCGTCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTta < 1:4145334/91‑1 (MQ=255) ataaAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTta > 1:3392367/1‑91 (MQ=255) ataaAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTta < 1:3585167/91‑1 (MQ=255) ataaAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTta < 1:1935672/91‑1 (MQ=255) ataaAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTta > 1:239120/1‑91 (MQ=255) taaAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGCCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTtat > 1:1477391/1‑91 (MQ=255) aaaaCACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAg < 1:173224/91‑1 (MQ=255) acGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAAt < 1:1038866/91‑1 (MQ=255) acGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAAt < 1:481326/91‑1 (MQ=255) gcgcCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCg > 1:2625089/1‑91 (MQ=255) cgcCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGt > 1:1827824/1‑91 (MQ=255) cgcCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGt > 1:3141587/1‑91 (MQ=255) cgcCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGt > 1:3141586/1‑91 (MQ=255) aaTATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTtc < 1:839605/91‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTtc < 1:3057825/91‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTtc > 1:451384/1‑91 (MQ=255) atatAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTtct < 1:2531895/91‑1 (MQ=255) tataAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTtctc > 1:934762/1‑91 (MQ=255) ataAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCg < 1:1211379/91‑1 (MQ=255) taAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGa < 1:3747724/91‑1 (MQ=255) taAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGa < 1:2502920/91‑1 (MQ=255) aaaCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGGCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGata < 1:3012262/91‑1 (MQ=255) aaCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGatat > 1:1944983/1‑91 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:231791/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:1878649/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:63875/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:231213/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:3959440/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtt < 1:2776639/91‑1 (MQ=255) cAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAtttt < 1:1740955/91‑1 (MQ=255) ttAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTc > 1:3287666/1‑91 (MQ=255) tAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATAttttttat > 1:4061114/1‑89 (MQ=255) tAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCt > 1:1970275/1‑91 (MQ=255) tAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCt > 1:813025/1‑91 (MQ=255) aaTGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCttt > 1:3259928/1‑91 (MQ=255) aTGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTg < 1:1865624/91‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGAGATTTTTTCTTTg < 1:3175905/91‑1 (MQ=255) tcatgaTGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagt > 1:2449626/1‑91 (MQ=255) tcatgaTGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagt > 1:2544822/1‑91 (MQ=255) tcatgaTGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagt > 1:834009/1‑91 (MQ=255) tcatgaTGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagt > 1:4098027/1‑91 (MQ=255) tcatcaTGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagt < 1:1716929/91‑1 (MQ=255) catcatGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTgtagta > 1:2839057/1‑91 (MQ=255) atcatGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTGTAGTaa < 1:3948075/91‑1 (MQ=255) atcatGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTGTAGTaa > 1:4127962/1‑91 (MQ=255) | TATGTAGTCCTAACAATTAGGTAACATATTACGCTTTTATACCTTAAATAATAAAAACACGCGCCAATATAAAACCAGTTAAATGTTCATCATGAACATGTGTGGTCTTAAATCAACGCGTGTTATTGTCGATATAACTTATAGCCAATCGTTTTCTCGATATTTTTTCTTTGTAGTAA > USA300TCH1516_ALE/1117303‑1117481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |