| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,254,017 | A→T | 8.4% | intergenic (+114/‑74) | rpsP → / → rimM | 30S ribosomal protein S16/Ribosome maturation factor RimM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,254,017 | 0 | A | T | 8.4% | 468.9 / 22.4 | 138 | intergenic (+114/‑74) | rpsP/rimM | 30S ribosomal protein S16/Ribosome maturation factor RimM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/71); new base T (3/9); total (58/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TAAGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTGG > USA300TCH1516_ALE/1253928‑1254107 | aGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATg < 1:663904/91‑1 (MQ=255) aGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATg < 1:679815/91‑1 (MQ=255) aGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATg < 1:1071967/91‑1 (MQ=255) aGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATg < 1:1072229/91‑1 (MQ=255) aaTACCTCGTATACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGt < 1:198603/91‑1 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGt < 1:1285184/91‑1 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGt < 1:4137882/91‑1 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGt < 1:2522581/91‑1 (MQ=255) aTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTg > 1:3791981/1‑91 (MQ=255) aTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGta < 1:3343180/91‑2 (MQ=255) tAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGc < 1:364087/91‑1 (MQ=255) aaCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGcc > 1:650840/1‑91 (MQ=255) aCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGccc > 1:3245181/1‑91 (MQ=255) aCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGccc > 1:1378928/1‑91 (MQ=255) aCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGccc > 1:1379252/1‑91 (MQ=255) tCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATGCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCtt < 1:79080/91‑1 (MQ=255) tCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGcccaa > 1:2127144/1‑89 (MQ=255) tCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCtt < 1:2581393/91‑1 (MQ=255) cGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCttt < 1:2055144/91‑1 (MQ=255) cGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGTAcccaat < 1:1332452/91‑4 (MQ=255) gTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCtttt < 1:3562190/91‑1 (MQ=255) gTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCtttt > 1:267515/1‑91 (MQ=255) cacTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCttt > 1:3366799/1‑91 (MQ=255) cTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGa < 1:1978100/91‑1 (MQ=255) cTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGa < 1:1978151/91‑1 (MQ=255) cTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGa < 1:1147580/91‑1 (MQ=255) aGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAattat < 1:3772717/91‑1 (MQ=255) aGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAattat < 1:3772675/91‑1 (MQ=255) gttgttACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAattatt < 1:3212046/91‑1 (MQ=255) ttattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTAttt < 1:2281471/91‑1 (MQ=255) tattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTAtttt < 1:3818190/91‑1 (MQ=255) tattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTAtttt > 1:1801549/1‑91 (MQ=255) attaCTCTATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTc < 1:2066838/91‑1 (MQ=255) ttaGTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCa < 1:3263961/91‑1 (MQ=255) aCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAAt > 1:3701807/1‑91 (MQ=255) aCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAAt > 1:3592138/1‑91 (MQ=255) aCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAAt > 1:3702226/1‑91 (MQ=255) cTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAAtt < 1:3837031/91‑1 (MQ=255) cAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTaa > 1:3573202/1‑91 (MQ=255) aaTGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTaaa > 1:1435218/1‑91 (MQ=255) tGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAAt < 1:4133955/91‑1 (MQ=255) tGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAAt < 1:4131484/91‑1 (MQ=255) aTACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAg > 1:2413949/1‑91 (MQ=255) aTACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAg < 1:627746/91‑1 (MQ=255) tACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGa > 1:3576235/1‑91 (MQ=255) tACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGa < 1:3977484/91‑1 (MQ=255) tACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGa < 1:3976086/91‑1 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa > 1:301988/1‑91 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa < 1:1607016/91‑1 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa < 1:2290115/91‑1 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa < 1:2377498/91‑1 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa < 1:2679218/91‑1 (MQ=255) cGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAg > 1:924834/1‑91 (MQ=255) cGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAg < 1:495723/91‑1 (MQ=255) cGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAg < 1:496339/91‑1 (MQ=255) cGTTGGGAATATCACATGCTAGTAATATAGAACGCATTGGGTACCAAAATGGTGCCCTCTTTCTTTGAATTATTTTCCATTAAAATAGAAg > 1:1191951/1‑91 (MQ=255) ttGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtg < 1:31475/91‑1 (MQ=255) ttGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtg > 1:2490513/1‑91 (MQ=255) ttGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtg > 1:2723285/1‑91 (MQ=255) tGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtgt < 1:1741258/91‑1 (MQ=255) gggAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGtt < 1:2815209/91‑1 (MQ=255) tatCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAg > 1:3259609/1‑91 (MQ=255) atCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGc < 1:1180942/91‑1 (MQ=255) tCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCa < 1:2221891/91‑1 (MQ=255) cacaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCAt < 1:272459/91‑1 (MQ=255) cacaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCAt < 1:3284299/91‑1 (MQ=255) cacaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCAt < 1:2303170/91‑1 (MQ=255) acaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATa > 1:2814232/1‑91 (MQ=255) acaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATa > 1:2814331/1‑91 (MQ=255) acaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATa < 1:1533229/91‑1 (MQ=255) acaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATa < 1:1187821/91‑1 (MQ=255) caTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATag < 1:3779478/91‑1 (MQ=255) tAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTg < 1:784460/91‑1 (MQ=255) aaTATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAgg > 1:400604/1‑91 (MQ=255) aaTATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAgg < 1:2210730/91‑1 (MQ=255) aaTATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAgg < 1:2134921/91‑1 (MQ=255) tataGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTa < 1:2309709/91‑1 (MQ=255) ataGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTaa > 1:8978/1‑91 (MQ=255) taGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAAt < 1:2879630/91‑1 (MQ=255) aGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATa > 1:968680/1‑91 (MQ=255) aCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGaa > 1:966013/1‑91 (MQ=255) cGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAAt < 1:944431/91‑1 (MQ=255) gTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTTAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATg < 1:4134567/91‑1 (MQ=255) aTTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgag < 1:1460735/91‑1 (MQ=255) aTTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgag < 1:1925296/91‑1 (MQ=255) ttGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgaga > 1:429975/1‑91 (MQ=255) tGGGTACCATAATGGTGCCCCTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGagag > 1:4028157/1‑91 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt > 1:3656453/1‑91 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt > 1:3656320/1‑91 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt > 1:1263584/1‑91 (MQ=255) ggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt < 1:1121148/91‑1 (MQ=255) ggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt > 1:102832/1‑91 (MQ=255) gcaCCATTATGGTACCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCACAGCATCGAGTTGGTGGTAATAGAATGAGAGTTg > 1:1939516/3‑91 (MQ=255) gcaCCATTATGGTACCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTg > 1:2046479/3‑91 (MQ=255) gTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTg > 1:1780391/1‑91 (MQ=255) ccATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAg > 1:578585/1‑91 (MQ=255) ccATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAg < 1:3552729/91‑1 (MQ=255) cATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGt > 1:2894287/1‑91 (MQ=255) aTAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGtt > 1:3061560/1‑91 (MQ=255) aaTGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTgg < 1:531902/91‑1 (MQ=255) | TAAGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTGG > USA300TCH1516_ALE/1253928‑1254107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |