Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,313,118 | A→T | 5.6% | intergenic (+22/+275) | rny_1 → / ← USA300HOU_RS06485 | Ribonuclease Y/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,313,118 | 0 | A | T | 5.6% | 431.8 / 13.4 | 124 | intergenic (+22/+275) | rny_1/USA300HOU_RS06485 | Ribonuclease Y/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/57); new base T (5/2); total (65/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.50e-01 |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TTACAATATCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTATTTGAAAGTA > USA300TCH1516_ALE/1313028‑1313208 | ttACAATATCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTa < 1:3192168/91‑1 (MQ=255) ttACAATATCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTa < 1:212539/91‑1 (MQ=255) tACAATATCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAg < 1:182824/91‑1 (MQ=255) tACAATATCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAg < 1:185188/91‑1 (MQ=255) atatCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAg > 1:3839831/1‑91 (MQ=255) atatCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAg > 1:3841279/1‑91 (MQ=255) atatCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAg > 1:1776098/1‑91 (MQ=255) atatCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAg < 1:2048087/91‑1 (MQ=255) tatCCTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAgg > 1:1444372/1‑91 (MQ=255) ccTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAg < 1:3153267/91‑1 (MQ=255) ccTGGTCATATCAAGGTCACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAg < 1:3551049/91‑1 (MQ=255) cTGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGc < 1:179279/91‑1 (MQ=255) tGGTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCt > 1:2910140/1‑91 (MQ=255) ggTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACTAATTTGTGAGGGAgaca < 1:3951028/91‑4 (MQ=39) gTCATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCttt > 1:2017538/1‑91 (MQ=255) cATATCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCttttt < 1:3777419/91‑1 (MQ=255) atatCAAGGTGACAGTTGTCCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCtttttt > 1:519586/1‑91 (MQ=255) tatgaaGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTa < 1:3734007/87‑1 (MQ=255) tatCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTa < 1:266885/91‑1 (MQ=255) tatCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTa < 1:1446104/91‑1 (MQ=255) tCAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAg < 1:3870980/91‑1 (MQ=255) cAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGt > 1:3813589/1‑91 (MQ=255) cAAGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAAAAATTTTTGTCTCCCTCACCAATTAGTGAGGGAGCGTTTTTAAGt > 1:894728/1‑91 (MQ=255) aaGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTGTGTCTCCCTCACAGATTAGTGAGGGAGCTTTTTCAAGtt > 1:3865672/1‑91 (MQ=255) aGGTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTg < 1:1899412/91‑1 (MQ=255) ggTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGt < 1:3838483/91‑1 (MQ=255) ggTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGt > 1:1810944/1‑91 (MQ=255) ggTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGt > 1:3893292/1‑91 (MQ=255) gTGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTa < 1:3998692/91‑1 (MQ=255) tGACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAg > 1:2589789/1‑91 (MQ=255) gACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGt < 1:1159103/91‑1 (MQ=255) gACAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGt < 1:1159440/91‑1 (MQ=255) aCAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTc > 1:1697130/1‑91 (MQ=255) aCAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTc > 1:2815755/1‑91 (MQ=255) aCAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTc > 1:1696278/1‑91 (MQ=255) aCAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTc < 1:1901417/91‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCt < 1:1494068/91‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCt > 1:4132924/1‑91 (MQ=255) cAGTTGTTCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCt > 1:2694803/1‑91 (MQ=255) gttgttCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTa > 1:2262429/1‑91 (MQ=255) ttgttCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTaa < 1:3349987/91‑1 (MQ=255) ttgttCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTaa > 1:1700107/1‑91 (MQ=255) gttCGAGAGACTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATc < 1:2500779/91‑1 (MQ=255) gagagaCTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGt < 1:3815003/91‑1 (MQ=255) agaggCAAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGtt < 1:1118116/91‑1 (MQ=255) agagaCTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGtt > 1:1092491/1‑91 (MQ=255) gagaCTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTa > 1:1205890/1‑91 (MQ=255) cTAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACa > 1:1029218/1‑91 (MQ=255) tAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAg < 1:2667820/91‑1 (MQ=255) tAGAGCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAg < 1:2015403/91‑1 (MQ=255) agagCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGc < 1:1611415/91‑1 (MQ=255) gagCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCa > 1:3020246/1‑91 (MQ=255) agCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCAc > 1:2778924/1‑91 (MQ=255) agCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCAc > 1:727524/1‑91 (MQ=255) agCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCAc < 1:30869/91‑1 (MQ=255) gCAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACt > 1:1896473/1‑91 (MQ=255) cAGTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACtt > 1:2401230/1‑91 (MQ=255) gTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTa < 1:1041038/91‑1 (MQ=255) gTAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTa < 1:1037916/91‑1 (MQ=255) tAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTAt < 1:1773338/91‑1 (MQ=255) tAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTAt < 1:812199/91‑1 (MQ=255) tAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTAt < 1:812345/91‑1 (MQ=255) tAGAATATGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTAt < 1:2831519/91‑1 (MQ=255) aaTATGCGAAATCATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTAACgg > 1:3209623/1‑91 (MQ=255) atatGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGt < 1:3703185/91‑1 (MQ=255) atGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGtaa > 1:4047042/1‑91 (MQ=255) atGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAAGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATTTAGTTAGACAGCACTTTATAGGtaa > 1:3865950/1‑91 (MQ=255) tGCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGtaat < 1:3472032/91‑1 (MQ=255) gCGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGtaata < 1:1757036/91‑1 (MQ=255) cGAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGtaataa > 1:760198/1‑91 (MQ=255) gAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTATTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAAc < 1:3497040/91‑1 (MQ=255) gAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAAc < 1:1604337/91‑1 (MQ=255) gAAATAATTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAAc < 1:1317382/91‑1 (MQ=255) aatTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTatat < 1:3380785/91‑1 (MQ=255) aatTTTTGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTatat < 1:3379494/91‑1 (MQ=255) ttttGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTaa > 1:460041/1‑91 (MQ=255) ttttGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTaa > 1:24361/1‑91 (MQ=255) ttttGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACCATATTaa > 1:2066740/1‑91 (MQ=255) tttGTCTCCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTaaa > 1:280270/1‑91 (MQ=255) gctcCCTCACTAATTTGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATGTTAAACagt > 1:2641694/2‑91 (MQ=39) ctcCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagta < 1:3814026/91‑1 (MQ=255) tcCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtag > 1:1589877/1‑91 (MQ=255) tcCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtag > 1:4018261/1‑91 (MQ=255) tcCCTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtag > 1:109314/1‑91 (MQ=255) cccTCACTAATTTGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtagt > 1:2897435/1‑91 (MQ=255) cccTCACAAATTAGTGGGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtagt > 1:1209444/1‑91 (MQ=255) cccTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACagtagt > 1:3239860/1‑91 (MQ=255) ccTCACTAATTTGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGtt > 1:1001339/1‑91 (MQ=255) cTCACAAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTCAATCTAATTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATAGTAAACAGTGGTTa > 1:3203182/1‑91 (MQ=255) cactAATTTGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTAtt > 1:760715/1‑91 (MQ=255) caAATTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTATTTg > 1:2889343/1‑91 (MQ=255) aaTTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTATTTGaa > 1:1191871/1‑91 (MQ=255) aaTTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTATTTGaa > 1:3242481/1‑91 (MQ=255) aTTAGTGAGGGAGCTTTTTTAAGTTGTAGTCTTAATCTAGTTAGACAGCACTTTATCGGTAATAACTATATTAAACAGTAGTTATTTGaaa > 1:2318630/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |