| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,678,358 | A→G | 5.5% | intergenic (+104/+46) | glyQS → / ← recO | Glycine‑‑tRNA ligase/DNA repair protein RecO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,678,358 | 0 | A | G | 5.5% | 416.3 / 8.5 | 123 | intergenic (+104/+46) | glyQS/recO | Glycine‑‑tRNA ligase/DNA repair protein RecO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/50); new base G (5/2); total (71/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACTTT > USA300TCH1516_ALE/1678268‑1678447 | ccaccaCATATGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCaaa > 1:300273/1‑91 (MQ=255)ccaccaCATATGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCaaa > 1:300141/1‑91 (MQ=255)ccaccaCATATGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCaaa > 1:478236/1‑91 (MQ=255) caccaTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAAt > 1:3960048/1‑91 (MQ=255) accaTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATa > 1:107840/1‑91 (MQ=255) ccaTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATaa > 1:864164/1‑91 (MQ=255) caTATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATaaa > 1:461072/1‑91 (MQ=255) tatGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAaca < 1:709831/91‑1 (MQ=255) catatggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAaca > 1:1129851/5‑91 (MQ=255) tatggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAAcaca > 1:3006875/3‑91 (MQ=255) atggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACAt > 1:510000/2‑91 (MQ=255) tggtggCTATATAATTGATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATc < 1:2822710/91‑1 (MQ=255) ggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCt > 1:2019931/1‑91 (MQ=255) ggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCt > 1:121841/1‑91 (MQ=255) ggtggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCt > 1:1132287/1‑91 (MQ=255) ggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtg < 1:1475286/91‑1 (MQ=255) ggCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtg < 1:809890/91‑1 (MQ=255) cTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTAtgtg < 1:1840222/91‑1 (MQ=255) atataATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGc < 1:4106852/91‑1 (MQ=255) atataATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGc > 1:2175476/1‑91 (MQ=255) tataATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCt > 1:2244220/1‑91 (MQ=255) ataATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTa < 1:2941516/91‑1 (MQ=255) taATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTAc > 1:1748018/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACtt < 1:2949389/91‑1 (MQ=255) tataAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGaa > 1:3748240/1‑91 (MQ=255) aaaaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCGTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATAc > 1:2248517/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATAcc > 1:1558144/1‑91 (MQ=255) aaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAGTAGCCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCt < 1:1691559/91‑1 (MQ=17) aaaGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAGTAGCCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCt < 1:1933101/91‑1 (MQ=17) aaGGGATGCTGGTTAGTAAAATTGTCAGTATCACTGTTCTATTCAAAAAGAGATTCAAATAAACTCAACGATGTGGCTACTTTAATCCCtt < 1:1619431/91‑1 (MQ=255) gagaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCtttt > 1:727297/1‑91 (MQ=255) agaTGCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTtta < 1:1359659/91‑1 (MQ=255) agaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTtta < 1:1359732/91‑1 (MQ=255) agaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTtta < 1:3624556/91‑1 (MQ=255) gaTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttat > 1:710590/1‑91 (MQ=255) aTACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttatt > 1:556354/1‑91 (MQ=255) tACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTttatta < 1:1616039/91‑1 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat > 1:2171182/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat > 1:3314180/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat > 1:1086822/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat > 1:2271993/1‑91 (MQ=255) aCTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTtattat > 1:2272172/1‑91 (MQ=255) ttAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAATGTATTCAAATAAACACGTCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTAt > 1:1625588/1‑91 (MQ=255) ttAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAGTAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTAt > 1:3286144/1‑91 (MQ=255) ttAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTAt > 1:2173069/1‑91 (MQ=255) tAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATg < 1:1765000/91‑1 (MQ=255) aGTAAAATTGCTAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGt < 1:3760988/91‑1 (MQ=255) aGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACAAATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGt > 1:680679/1‑91 (MQ=255) tAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTa > 1:2734615/1‑91 (MQ=255) aTTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGt > 1:1458751/1‑91 (MQ=255) aTTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGt < 1:3838895/91‑1 (MQ=255) aTTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGt > 1:2523045/1‑91 (MQ=255) ttGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGtt < 1:4079685/91‑1 (MQ=255) ttGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGtt < 1:4079713/91‑1 (MQ=255) ttGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGtt < 1:2399938/91‑1 (MQ=255) ccAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCa > 1:3949755/1‑91 (MQ=255) cAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCaa > 1:462393/1‑91 (MQ=255) gTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATc < 1:2659095/91‑1 (MQ=255) gTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATc > 1:3298335/1‑91 (MQ=255) gTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATc < 1:1099656/91‑1 (MQ=255) gTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATc > 1:2422640/1‑91 (MQ=255) tATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCt < 1:2264363/91‑1 (MQ=255) ctctTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCtttt < 1:2481051/91‑1 (MQ=255) tctTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCttttt > 1:947933/1‑91 (MQ=255) ttttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTaa < 1:3224095/91‑1 (MQ=255) ttttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTaa > 1:2472647/1‑91 (MQ=255) tttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAAt < 1:2754042/91‑1 (MQ=255) tttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAAt > 1:2658692/1‑91 (MQ=255) tttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAAt < 1:2297741/91‑1 (MQ=255) ttCTATTCAAAAGGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAAtt < 1:2458216/91‑1 (MQ=255) ttCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAAtt < 1:57572/91‑1 (MQ=255) cTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTgg < 1:2803259/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGtt < 1:3121538/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTg > 1:1431761/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGa < 1:1298680/91‑1 (MQ=255) cAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGAt > 1:808133/1‑91 (MQ=255) cAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGAt > 1:4010772/1‑91 (MQ=255) aaaGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAg < 1:1946275/91‑1 (MQ=255) aaGGTATTCAAGTAGCCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGt > 1:930192/1‑91 (MQ=17) aaGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGt > 1:1101666/1‑91 (MQ=255) aGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGtt < 1:3929997/91‑1 (MQ=255) aGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGtt < 1:1761560/91‑1 (MQ=255) aGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGtt < 1:1839943/91‑1 (MQ=255) aGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGtt < 1:1839922/91‑1 (MQ=255) ggTATTCAAGTAACCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGttt > 1:3180809/1‑91 (MQ=18) ggTATTCAAGTAACCACATAGATGTGTTTATTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGttt > 1:3181743/1‑91 (MQ=18) gTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTc > 1:1427249/1‑91 (MQ=255) gTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTc > 1:2415020/1‑91 (MQ=255) aTTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTg > 1:3812932/1‑91 (MQ=255) aTTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTg < 1:3480070/91‑1 (MQ=255) aTTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTg < 1:2854177/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTgg > 1:1045145/1‑90 (MQ=255) ttCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTgg > 1:1044127/1‑90 (MQ=255) ttCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGa < 1:1822224/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGa < 1:1822266/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGa > 1:204585/1‑91 (MQ=255) cAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACt < 1:1826699/91‑1 (MQ=255) cAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACt > 1:224941/1‑91 (MQ=255) aaTAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACttt > 1:848933/1‑91 (MQ=255) aaTAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACttt > 1:3734257/1‑91 (MQ=255) | CCACCATATGTGGTGGCTATATAATTTATAAAAAGAGATACTGGTTAGTAAAATTGCCAGTATCTCTTTTCTATTCAAAAAGGTATTCAAATAAACACATCTATGTGGCTACTTGAATACCTTTTATTATTTTATGTTATTGTTCCAATCTTTTTAATTGGTTGATTAGTTTCTGACTTT > USA300TCH1516_ALE/1678268‑1678447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |