AGTTTCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACTTGGA > USA300TCH1516_ALE/1805728‑1805908
|
aGTTTCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGttt < 1:1279824/91‑1 (MQ=255)
aGTTTCACCAGTTAGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGttt < 1:1279444/91‑1 (MQ=255)
gTTTCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTa < 1:3100085/91‑1 (MQ=255)
gTTTCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTa > 1:3692547/1‑91 (MQ=255)
ttCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTAAAc < 1:2459150/91‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTAAAc < 1:2459124/91‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTAAAc < 1:2458692/91‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTAAAc < 1:2459123/91‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTAAAc < 1:2459100/91‑1 (MQ=255)
tCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAAGAATGATTAAATCAGCATTAGATACTCTGCCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACa < 1:3858114/91‑1 (MQ=255)
cACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACaa > 1:3479391/1‑91 (MQ=255)
ccAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATg > 1:1076997/1‑91 (MQ=255)
ttGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATc < 1:1217850/91‑1 (MQ=255)
tGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCt > 1:3158553/1‑91 (MQ=255)
tGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCt < 1:3883989/91‑1 (MQ=255)
ggTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTg < 1:2078513/91‑1 (MQ=255)
tACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTa > 1:1440105/1‑91 (MQ=255)
tACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTa > 1:1321260/1‑91 (MQ=255)
acacCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTAc < 1:156783/91‑1 (MQ=255)
cacCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTAct > 1:3975187/1‑91 (MQ=255)
cagcagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCtt > 1:751656/1‑91 (MQ=255)
gcagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTAc < 1:2127209/91‑1 (MQ=255)
gcagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTAc < 1:2128449/91‑1 (MQ=255)
cagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACg < 1:3525660/91‑1 (MQ=255)
cagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACg > 1:900074/1‑91 (MQ=255)
cagTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACg < 1:238465/91‑1 (MQ=255)
agTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGt < 1:2935925/91‑1 (MQ=255)
gTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTc < 1:2637324/91‑1 (MQ=255)
gTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTc < 1:2637253/91‑1 (MQ=255)
gTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTc < 1:2549839/91‑1 (MQ=255)
taataaTGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTcc < 1:1236911/91‑1 (MQ=255)
aataatGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCt > 1:1067335/1‑91 (MQ=255)
taatGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCttt > 1:801030/1‑91 (MQ=255)
ggtGATTTAATCATTATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCtttt > 1:552386/3‑91 (MQ=255)
aatGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCtttt > 1:2918583/1‑91 (MQ=255)
atGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCttttt < 1:2234076/91‑1 (MQ=255)
gATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTa < 1:3887947/91‑1 (MQ=255)
ttAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAAc < 1:2540246/91‑1 (MQ=255)
aaTCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTAc > 1:92635/1‑91 (MQ=255)
aaTCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTAc > 1:3440458/1‑91 (MQ=255)
aTCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACa < 1:1406075/91‑1 (MQ=255)
tCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAg > 1:1526894/1‑91 (MQ=255)
aCCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGt < 1:928348/91‑1 (MQ=255)
aCCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGt < 1:4020585/91‑1 (MQ=255)
ccATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGtt > 1:374960/1‑91 (MQ=255)
ccATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGtt > 1:375021/1‑91 (MQ=255)
ccATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGtt < 1:702273/91‑1 (MQ=255)
ccATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGtt > 1:1686126/1‑91 (MQ=255)
cATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTg > 1:1848223/1‑91 (MQ=255)
ttAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGaa < 1:2642429/91‑1 (MQ=255)
ttAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGaa < 1:3964869/91‑1 (MQ=255)
tAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAAc < 1:482597/91‑1 (MQ=255)
aGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACt < 1:4043898/91‑1 (MQ=255)
aGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACt > 1:427273/1‑91 (MQ=255)
aGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACt > 1:3819614/1‑91 (MQ=255)
gATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTc > 1:951123/1‑91 (MQ=255)
aTACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTcc < 1:3601145/91‑1 (MQ=255)
aCTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTcccc > 1:2409844/1‑91 (MQ=255)
ctctACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCa > 1:2103960/1‑91 (MQ=255)
ctctACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCa > 1:1338311/1‑91 (MQ=255)
tctACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCaa < 1:2551316/91‑1 (MQ=255)
tctACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCaa < 1:1482824/91‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACaa > 1:1979914/1‑91 (MQ=255)
aGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAAtt < 1:574654/91‑1 (MQ=255)
aGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCC‑TTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTg < 1:1732522/91‑1 (MQ=255)
tCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAAc > 1:134221/1‑91 (MQ=255)
gcAACAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCGAACAATTGAAc > 1:3762097/2‑91 (MQ=255)
gcAACAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAAc > 1:1307843/2‑91 (MQ=255)
gcAACAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAAc > 1:1569278/2‑91 (MQ=255)
cAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACa > 1:1630833/1‑91 (MQ=255)
cAACAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACa > 1:2399879/1‑91 (MQ=255)
aaCAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACAt > 1:2852248/1‑91 (MQ=255)
aaCAGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACAt > 1:2032962/1‑91 (MQ=255)
aCAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACAtt > 1:3431887/1‑91 (MQ=255)
aCAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACAtt > 1:2442959/1‑91 (MQ=255)
aGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGa > 1:672090/1‑91 (MQ=255)
aGCTGTTGAAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGa > 1:394439/1‑91 (MQ=255)
gCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGAc < 1:3307069/91‑1 (MQ=255)
cTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACg < 1:1959156/91‑1 (MQ=255)
gTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTg < 1:3570559/91‑1 (MQ=255)
cAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGt > 1:2605864/1‑91 (MQ=255)
aaCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGtt < 1:4028337/91‑1 (MQ=255)
aaCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGtt < 1:4028519/91‑1 (MQ=255)
aaCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGtt < 1:4028091/91‑1 (MQ=255)
aaCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGtt < 1:3953308/91‑1 (MQ=255)
aCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGttt < 1:687081/91‑1 (MQ=255)
aCTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGttt < 1:687082/91‑1 (MQ=255)
tGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTttct < 1:3369597/91‑1 (MQ=255)
tGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTttct < 1:218050/91‑1 (MQ=255)
tGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTttct < 1:3963649/91‑1 (MQ=255)
tGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTttct > 1:3843326/1‑91 (MQ=255)
ttGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCAc < 1:2408092/91‑1 (MQ=255)
ttGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCAc < 1:2408247/91‑1 (MQ=255)
ttGTTAAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCAc > 1:2327746/1‑91 (MQ=255)
ttGTTAAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCAc > 1:3613047/1‑91 (MQ=255)
tGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACt < 1:852071/91‑1 (MQ=255)
gTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACtt < 1:1025951/91‑1 (MQ=255)
tttAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACTTg < 1:2880911/91‑1 (MQ=255)
ttAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACTTgg < 1:415457/91‑1 (MQ=255)
tAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACTTGGa > 1:2272829/1‑91 (MQ=255)
|
AGTTTCACCAGTTGGTACACCAGCAGTAATAATGATTAAATCACCATTAGATACTCTACCAGTTTCAACAGCTGTTGCAACTGCATTGTTTAACAATGCATCTGTACTCTTACGTCCTTTTTTAACTACAGGTTGAACTCCCCAAACAATTGAACATTGACGTGCAGTTTCTTCACTTGGA > USA300TCH1516_ALE/1805728‑1805908
|