Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,905,775 | G→C | 12.3% | E128Q (GAA→CAA) | sigS → | RNA polymerase sigma factor SigS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,905,775 | 0 | G | C | 12.3% | 442.0 / 46.3 | 138 | E128Q (GAA→CAA) | sigS | RNA polymerase sigma factor SigS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (69/52); new base C (6/11); total (75/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGT > USA300TCH1516_ALE/1905685‑1905865 | cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGACGGATACAAGCAATTTg > 1:379453/1‑91 (MQ=255) cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTg > 1:3389602/1‑91 (MQ=255) cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTg > 1:3389255/1‑91 (MQ=255) cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTg > 1:2673234/1‑91 (MQ=255) gACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCaaa < 1:2764059/91‑1 (MQ=255) gACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCaaa < 1:2764002/91‑1 (MQ=255) gACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTGTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCaaa < 1:2764060/91‑1 (MQ=255) aCCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAt > 1:4064945/1‑91 (MQ=255) aCCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCAAAt < 1:253036/91‑1 (MQ=255) aCCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCAAAt < 1:523825/91‑1 (MQ=255) ccTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGGGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAtt < 1:368587/91‑1 (MQ=255) ccTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAtt < 1:108222/91‑1 (MQ=255) ccTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAtt < 1:1294544/91‑1 (MQ=255) tCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCt > 1:113600/1‑91 (MQ=255) cGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTg < 1:367583/91‑1 (MQ=255) gTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGa < 1:1267306/91‑1 (MQ=255) gTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGa > 1:1746097/1‑91 (MQ=255) ttACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGaaa > 1:1631285/1‑91 (MQ=255) aCAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATc < 1:2251179/91‑1 (MQ=255) cAAGATATCTTCTAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCa > 1:3186770/1‑91 (MQ=255) aaGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCAt < 1:3073492/91‑1 (MQ=255) aGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATg < 1:2604795/91‑1 (MQ=255) tatCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGACATCATGTCa > 1:3974842/1‑91 (MQ=255) tatCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCa > 1:2606950/1‑91 (MQ=255) atCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATTTCAt < 1:3272517/91‑1 (MQ=255) tCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCAtt < 1:1641719/91‑1 (MQ=255) cTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTa > 1:2643981/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:2106498/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt < 1:2439666/91‑1 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:1314806/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:4137905/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:3404760/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt < 1:3752551/91‑1 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:3404852/1‑91 (MQ=255) tCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATc < 1:1174475/91‑1 (MQ=255) aGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCt > 1:3541150/1‑91 (MQ=255) aGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCt > 1:3735890/1‑91 (MQ=255) tttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCa > 1:3762845/1‑91 (MQ=255) tttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCa < 1:2712606/91‑1 (MQ=255) tttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCa > 1:440968/1‑91 (MQ=255) ttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCaa > 1:177610/1‑91 (MQ=255) tAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAAc < 1:452941/91‑1 (MQ=255) tAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAACAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAAc > 1:3525228/1‑91 (MQ=255) aaTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGa < 1:321981/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat < 1:2728612/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat < 1:40316/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat < 1:1228216/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat < 1:1228020/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat > 1:3405484/1‑91 (MQ=255) cAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGatta > 1:3880227/1‑91 (MQ=255) aaaGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaa > 1:1760279/1‑91 (MQ=255) aaGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaa < 1:4106664/91‑1 (MQ=255) agagAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaat > 1:2260656/1‑91 (MQ=255) gagaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatt < 1:1541919/91‑1 (MQ=255) gagaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatt < 1:1658089/91‑1 (MQ=255) agaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatta > 1:1330271/1‑91 (MQ=255) gaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaattaa < 1:1472376/91‑1 (MQ=255) aGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAGATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAattaatta < 1:3294265/91‑1 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa > 1:2818562/1‑91 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa > 1:56763/1‑91 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa > 1:61033/1‑91 (MQ=255) aCTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATGCAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAg < 1:3330254/91‑1 (MQ=255) cTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGa < 1:1889198/91‑1 (MQ=255) ggCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTc > 1:876322/1‑91 (MQ=255) ggCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTc > 1:876593/1‑91 (MQ=255) gCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTcc < 1:484554/91‑1 (MQ=255) gCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTcc < 1:1442620/91‑1 (MQ=255) gCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTcc > 1:3131390/1‑91 (MQ=255) cTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCg > 1:955314/1‑91 (MQ=255) tCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGt > 1:3654171/1‑91 (MQ=255) aaaCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTa < 1:1919241/91‑1 (MQ=255) aCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAg < 1:1090944/91‑1 (MQ=255) aCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAg < 1:216699/91‑1 (MQ=255) aCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAg < 1:3647456/91‑1 (MQ=255) cTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGc > 1:2940961/1‑91 (MQ=255) ttGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATg < 1:2966658/91‑1 (MQ=255) tGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGc < 1:2183972/91‑1 (MQ=255) gAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGcc > 1:1743433/1‑91 (MQ=255) gAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGcc > 1:3337802/1‑91 (MQ=255) ggATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAAc > 1:1795503/1‑91 (MQ=255) gATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTACATGCCAACa > 1:3967679/1‑91 (MQ=255) gATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACa > 1:894724/1‑91 (MQ=255) aTACAGGCAATTTGAAATTGCTGAACTCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAGATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACAt < 1:3859347/91‑1 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:4010225/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:1950592/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:1951279/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:4010140/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:2925399/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:2925439/1‑91 (MQ=255) aCAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATaa > 1:710283/1‑91 (MQ=255) aCAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATaa > 1:2702379/1‑91 (MQ=255) aCAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATaa > 1:3154334/1‑91 (MQ=255) aCAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATaa > 1:1407196/1‑91 (MQ=255) caGCAATTTCAAATTGCTTAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAAtt > 1:3715220/2‑91 (MQ=255) aGCAATTTCAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAAttt > 1:1540556/1‑91 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 1:1712638/91‑1 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 1:2419085/91‑1 (MQ=255) aTTTCAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt > 1:1093091/1‑91 (MQ=255) ttGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTa > 1:1912343/1‑91 (MQ=255) gAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGt > 1:4078809/1‑91 (MQ=255) | CATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGT > USA300TCH1516_ALE/1905685‑1905865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |