| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,494,035 | T→A | 5.9% | intergenic (‑61/+171) | USA300HOU_RS12835 ← / ← USA300HOU_RS12845 | Ferredoxin‑‑NADP reductase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,494,035 | 0 | T | A | 5.9% | 356.8 / 10.6 | 102 | intergenic (‑61/+171) | USA300HOU_RS12835/USA300HOU_RS12845 | Ferredoxin‑‑NADP reductase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/39); new base A (3/3); total (60/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCCACCAATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATCCCAT > USA300TCH1516_ALE/2493947‑2494123 | cGCCACCAATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAattat > 1:3555798/1‑91 (MQ=255)cGCCACCAATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAattat > 1:3555958/1‑91 (MQ=255) gCCACCAATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAattatt > 1:216173/1‑91 (MQ=255) ccaccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAAttatta > 1:3114149/1‑91 (MQ=255) ccaccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAAttatta < 1:742098/91‑1 (MQ=255) ccaccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAAttatta < 1:3916319/91‑1 (MQ=255) ccaccaATGATTGTAACATCTTTCACTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAAttatta < 1:3870578/91‑1 (MQ=255) accaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATAATTATc < 1:2205687/91‑1 (MQ=255) ccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑a > 1:875820/1‑91 (MQ=255) ccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAAATGATAATAATTATC‑a < 1:1202877/91‑1 (MQ=255) ccaATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAAATGATAATAATTATC‑a < 1:247782/91‑1 (MQ=255) aaTGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑Att > 1:1381679/1‑91 (MQ=255) aaTGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑Att > 1:2615774/1‑91 (MQ=255) tGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTa < 1:2789591/91‑1 (MQ=255) tGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTa > 1:3518617/1‑91 (MQ=255) aTTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTaaa > 1:389069/1‑91 (MQ=255) aTTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTaaa > 1:2146585/1‑91 (MQ=255) aTTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTaaa < 1:1231708/91‑1 (MQ=255) aTTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTaaa > 1:388960/1‑91 (MQ=255) aTTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTaaa > 1:403151/1‑91 (MQ=255) ttGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAg < 1:594482/91‑1 (MQ=255) gTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGcc > 1:2919522/1‑91 (MQ=255) aaCATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑AGTTAAAGCCAt > 1:2547987/1‑91 (MQ=255) cATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATta > 1:2911274/1‑91 (MQ=255) cTTTAATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATAc > 1:3276574/1‑91 (MQ=255) tttCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACt > 1:78904/1‑91 (MQ=255) tttCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACt > 1:1420703/1‑91 (MQ=255) ttCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTa < 1:3257292/91‑1 (MQ=255) ttCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTa < 1:3257361/91‑1 (MQ=255) tCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTAt > 1:2723361/1‑91 (MQ=255) tCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTAt > 1:1828085/1‑91 (MQ=255) cATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTAtt > 1:3335124/1‑91 (MQ=255) cATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTAtt > 1:1436362/1‑91 (MQ=255) cATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTAtt > 1:1436169/1‑91 (MQ=255) aTTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTa > 1:1871227/1‑91 (MQ=255) ttATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTaa > 1:745100/1‑91 (MQ=255) ttATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTaa > 1:744939/1‑91 (MQ=255) ttATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTaa > 1:3112921/1‑91 (MQ=255) ttATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTaa > 1:2778211/1‑91 (MQ=255) tATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAat > 1:1776805/1‑91 (MQ=255) tATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAat > 1:1554058/1‑91 (MQ=255) tgtgCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAatat < 1:4146174/91‑1 (MQ=255) gtgCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATAtt < 1:1496637/91‑1 (MQ=255) gCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTta < 1:1660214/91‑1 (MQ=255) ctcctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTtata < 1:3789352/91‑1 (MQ=255) ctcctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTtata < 1:1147500/91‑1 (MQ=255) tcctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTatat < 1:925941/91‑1 (MQ=255) tcctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTatat < 1:925813/91‑1 (MQ=255) tcctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTatat < 1:3234379/91‑1 (MQ=255) cctATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATAtt > 1:307263/1‑91 (MQ=255) tATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGt > 1:260599/1‑91 (MQ=255) aTGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGtt > 1:2666083/1‑91 (MQ=255) aTGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGtt < 1:1999127/91‑1 (MQ=255) aTGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGtt < 1:1999687/91‑1 (MQ=255) tGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTa > 1:2484228/1‑91 (MQ=255) gACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTaa < 1:3190808/91‑1 (MQ=255) gACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTaa > 1:2972872/1‑91 (MQ=255) aCTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTaaa > 1:1186766/1‑91 (MQ=255) ctctctATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTaaaa < 1:257110/91‑1 (MQ=255) tctctATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAaaat < 1:3407855/91‑1 (MQ=255) tctctATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAaaat > 1:2192456/1‑91 (MQ=255) tctctATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAaaat > 1:2193124/1‑91 (MQ=255) tctATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAaaataa > 1:3062138/1‑91 (MQ=255) tataTTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAaaataaat > 1:1173285/1‑91 (MQ=255) tatTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCg < 1:2540295/91‑1 (MQ=255) tatTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCg > 1:1446091/1‑91 (MQ=255) tatTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCg < 1:3141540/91‑1 (MQ=255) ttCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCa < 1:1037584/91‑1 (MQ=255) ttCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCa > 1:1148014/1‑91 (MQ=255) ttCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCa > 1:3616325/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAg > 1:3783576/1‑91 (MQ=255) tttctttcATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGt > 1:3788841/1‑91 (MQ=255) ctttcATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAg < 1:2958701/91‑1 (MQ=255) ctttcATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAg < 1:456358/91‑1 (MQ=255) ctttcATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAg < 1:2938893/91‑1 (MQ=255) ttcATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGcc < 1:2665704/91‑1 (MQ=255) cATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCAt > 1:1185398/1‑91 (MQ=255) cATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑AGTTAAAGCAATTATACTAGGAATATTTAGATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCAt < 1:547451/91‑1 (MQ=255) ttAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGa < 1:1905123/91‑1 (MQ=255) ttAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGa < 1:3997267/91‑1 (MQ=255) ttAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGa < 1:154099/91‑1 (MQ=255) aaCGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAACTCGCATAGTTAGCCATGAAt < 1:1712374/91‑1 (MQ=255) aaCGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAAGCGCATAGTTAGCCATGAAt < 1:3726383/91‑1 (MQ=255) aCGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAAtt < 1:2561806/91‑1 (MQ=255) cGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTCATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTa > 1:3296075/1‑91 (MQ=255) cGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTa > 1:2947852/1‑91 (MQ=255) tGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTAGACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATc > 1:3498821/1‑91 (MQ=255) cTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCaa > 1:2553698/1‑91 (MQ=255) cAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATa < 1:4098354/91‑1 (MQ=255) aaaTTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATaa < 1:1741932/91‑1 (MQ=255) aaaTTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATaa > 1:3489963/1‑91 (MQ=255) atGATAATAATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTa > 1:1943555/2‑91 (MQ=255) atGATAATAATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTa > 1:1294137/2‑91 (MQ=255) tGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTAt > 1:2423926/1‑91 (MQ=255) gATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATc > 1:1847860/1‑91 (MQ=255) gATAATAATTATCAATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTAt > 1:1612872/1‑91 (MQ=255) tAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATccc < 1:512490/91‑1 (MQ=255) tAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATccc > 1:790225/1‑91 (MQ=255) aaTTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATCCCa > 1:3877608/1‑91 (MQ=255) attattATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATCCCAt > 1:2592255/1‑91 (MQ=255) | CGCCACCAATGATTGTAACATCTTTCATTATGTGCCTCCTATGACTCTCTATATTCATTTCTTTCATTAACGTGCTCAAATTGATAATTATTATC‑ATTTAAAGCCATTATACTATTAATATTTATATTGTTAAAATAAATCGCATAGTTAGCCATGAATTATCAATAACTATCCCAT > USA300TCH1516_ALE/2493947‑2494123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |