Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 2,847,006 | G→C | 15.1% | intergenic (‑210/‑170) | salL ← / → yceI | Adenosyl‑chloride synthase/Protein YceI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 2,847,006 | 0 | G | C | 15.1% | 281.1 / 42.1 | 99 | intergenic (‑210/‑170) | salL/yceI | Adenosyl‑chloride synthase/Protein YceI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/46); new base C (7/8); total (45/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.47e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTGACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCATC > USA300TCH1516_ALE/2846917‑2847096 | gtGACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGa < 1:755696/91‑1 (MQ=255) tGACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGAc > 1:1802038/1‑91 (MQ=255) gACTATAGAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACt < 1:2077744/91‑1 (MQ=255) gACTATAGAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACt < 1:2077894/91‑1 (MQ=255) gACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACt > 1:2740904/1‑91 (MQ=255) gACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACt > 1:2740915/1‑91 (MQ=255) gACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACt < 1:2772594/91‑1 (MQ=255) gACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACt < 1:2078262/91‑1 (MQ=255) gACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACt < 1:3996798/91‑1 (MQ=255) aCTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTa < 1:1362061/91‑1 (MQ=255) tataAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAgg < 1:1732372/91‑1 (MQ=255) taAAAATGGTAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGt < 1:1941317/91‑1 (MQ=255) aaaaTGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGtat > 1:1082800/1‑91 (MQ=255) gATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACaa > 1:3641317/1‑91 (MQ=255) ataataataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAAt < 1:1233714/91‑1 (MQ=255) aataataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAg > 1:2872357/1‑91 (MQ=255) taataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAgtg > 1:69631/1‑91 (MQ=255) taataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAgtg < 1:2433911/91‑1 (MQ=255) taataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAgtg > 1:1457953/1‑91 (MQ=255) aataGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAgtgt > 1:1418271/1‑91 (MQ=255) taGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtgg < 1:2445302/91‑1 (MQ=255) taGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtgg < 1:2444233/91‑1 (MQ=255) taGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtgg < 1:448252/91‑1 (MQ=255) taGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCGTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtgg < 1:3597318/91‑1 (MQ=255) gTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtggtg < 1:4016752/91‑1 (MQ=255) gTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtggtg > 1:975514/1‑91 (MQ=255) gTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTCGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTgtggtg > 1:1505954/1‑91 (MQ=255) aGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGttt > 1:682490/1‑91 (MQ=255) aTTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTta < 1:1058639/91‑1 (MQ=255) aTTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTta > 1:3281726/1‑91 (MQ=255) ttATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAAATAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTtata > 1:1690518/1‑91 (MQ=255) aTCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAgg < 1:184374/91‑1 (MQ=255) aTCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAgg < 1:428693/91‑1 (MQ=255) aTCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAgg < 1:894780/91‑1 (MQ=255) aTCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAgg < 1:894553/91‑1 (MQ=255) aTCTCATTAACTAAATTTCACGGACTGGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAgg < 1:3660474/91‑1 (MQ=255) tcATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCa > 1:70470/1‑91 (MQ=255) tcATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCa < 1:2131574/91‑1 (MQ=255) tcATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCa < 1:2131884/91‑1 (MQ=255) tcATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCa > 1:1280126/1‑91 (MQ=255) cATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCAt < 1:697418/91‑1 (MQ=255) atctAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCAt < 1:273384/88‑1 (MQ=255) aTTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCAtt < 1:3914121/91‑1 (MQ=255) aTTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCAtt < 1:1277282/91‑1 (MQ=255) tAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCt < 1:419068/91‑1 (MQ=255) aaCTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCtt < 1:3407461/91‑1 (MQ=255) cTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTa > 1:1434087/1‑91 (MQ=255) tAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTaa < 1:82893/91‑1 (MQ=255) aaaTTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTaaa < 1:2094044/91‑1 (MQ=255) cGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATcac < 1:1417778/91‑1 (MQ=255) cGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATcac > 1:2661977/1‑91 (MQ=255) cGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATcac > 1:1375671/1‑91 (MQ=255) cGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATcac > 1:35722/1‑91 (MQ=255) ggACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATcaca > 1:2427276/1‑91 (MQ=255) gACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAg > 1:1318260/1‑91 (MQ=255) gACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAg > 1:1220245/1‑91 (MQ=255) gACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAg < 1:3870159/91‑1 (MQ=255) gACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAg > 1:1219119/1‑91 (MQ=255) aCTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCGCAGa > 1:2828102/1‑91 (MQ=255) aCTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGa > 1:1619797/1‑91 (MQ=255) aCTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGa > 1:3622692/1‑91 (MQ=255) aCTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGa > 1:3622671/1‑91 (MQ=255) aCTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGa > 1:1368010/1‑91 (MQ=255) ttGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGaaa > 1:2048487/1‑91 (MQ=255) gTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAat > 1:2819140/1‑91 (MQ=255) aaTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAatat < 1:3840664/91‑1 (MQ=255) aaTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAatat < 1:2810671/91‑1 (MQ=255) aTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATatt < 1:2015612/91‑1 (MQ=255) aTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATatt < 1:1290608/91‑1 (MQ=255) aTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATatt < 1:1435471/91‑1 (MQ=255) aTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATatt > 1:3051512/1‑91 (MQ=255) aTCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATatt > 1:158501/1‑91 (MQ=255) cACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcg < 1:3039792/91‑1 (MQ=255) aCTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcga > 1:708903/1‑91 (MQ=255) cttcttTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTATTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaa < 1:3602661/91‑1 (MQ=255) ttcttTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaat > 1:4093519/1‑91 (MQ=255) ttcttTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaat > 1:4090310/1‑91 (MQ=255) tcttCATGTTAGATTTAATTGACTAGGGTATAACAGTAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAGATACATCACAGAAAATattcgaatt < 1:1730105/91‑1 (MQ=255) cttTATGTTTGACTTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaattc > 1:3179382/1‑91 (MQ=255) cttTATGTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaattc < 1:3638858/91‑1 (MQ=255) tttATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaattcg < 1:2787511/91‑1 (MQ=255) tttATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaattcg < 1:2787539/91‑1 (MQ=255) tttATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATattcgaattcg < 1:2787389/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGaaa > 1:334490/1‑91 (MQ=255) tGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAAt < 1:192845/91‑1 (MQ=255) gTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATCGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATa > 1:674517/1‑91 (MQ=255) gTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATa > 1:3566278/1‑91 (MQ=255) gTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATa < 1:1585074/91‑1 (MQ=255) gTTTGAATTAATTCACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATa > 1:2504554/1‑91 (MQ=255) gAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAAt < 1:878608/91‑1 (MQ=255) gAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAAt > 1:394573/1‑91 (MQ=255) ttaattGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCt < 1:2488480/91‑1 (MQ=255) ttaattGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCt < 1:2732400/91‑1 (MQ=255) aattGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTg > 1:2365122/1‑91 (MQ=255) attGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGc > 1:1215910/1‑91 (MQ=255) ttGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCa < 1:3061104/91‑1 (MQ=255) ttGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCa < 1:1331509/91‑1 (MQ=255) ttGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCa > 1:125591/1‑91 (MQ=255) gACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCATc < 1:2684007/91‑1 (MQ=255) gACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCATc < 1:1304616/91‑1 (MQ=255) | GTGACTATAAAAATGATAATAATAGTCAGATTTATCTCATTAACTAAATTTCACGGACTTGTAATCACTTCTTTATGTTTGAATTAATTGACTAGGGTATAACAATAGTGTGGTGTTTTATAGGTCATTCTTTAAATACATCACAGAAAATATTCGAATTCGAAATAAAATGCTTGCATC > USA300TCH1516_ALE/2846917‑2847096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |