| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 690,101 | A→T | 15.8% | intergenic (‑30/+5) | USA300HOU_RS03320 ← / ← USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 690,101 | 0 | A | T | 15.8% | 329.0 / 51.9 | 120 | intergenic (‑30/+5) | USA300HOU_RS03320/USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/53); new base T (5/14); total (53/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACAA > USA300TCH1516_ALE/690011‑690191 | cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 1:4066488/1‑91 (MQ=255)cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 1:4065887/1‑91 (MQ=255) gCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAg > 1:4004640/1‑91 (MQ=255) cAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAggg < 1:1523916/91‑1 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggt < 1:2225884/91‑2 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggt < 1:2226215/91‑2 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggt < 1:3713049/91‑2 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggt < 1:860001/91‑2 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:800152/91‑3 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:800368/91‑3 (MQ=255) tttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtta < 1:731506/91‑4 (MQ=255) tttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtta < 1:423671/91‑4 (MQ=255) tttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtta < 1:2340500/91‑4 (MQ=255) tttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGTGCCTa > 1:1814818/1‑91 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAACATAACCCCAATAGGGGCTAt < 1:3334394/91‑1 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTGGGGTTAt < 1:1189600/91‑1 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTGGGGTTAt < 1:1102125/91‑1 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTGGGGTTAt < 1:3438701/91‑1 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAt < 1:2341015/91‑1 (MQ=255) tCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAtt < 1:2313393/91‑1 (MQ=255) tCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAtt < 1:3651481/91‑1 (MQ=255) gTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGCCTATTTa > 1:2085402/1‑91 (MQ=255) aataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAAt > 1:3496904/1‑91 (MQ=255) aataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAAt < 1:2098044/91‑1 (MQ=255) aaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGtt > 1:679291/1‑91 (MQ=255) cAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAt < 1:3429254/91‑1 (MQ=255) aaaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtt < 1:2426814/91‑1 (MQ=255) aaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttt < 1:2095022/91‑1 (MQ=255) ttATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttttt < 1:2339649/91‑1 (MQ=255) tATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtttttt > 1:432966/1‑91 (MQ=255) aTCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttttttt > 1:2635182/1‑91 (MQ=255) aTCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttttttt > 1:2635155/1‑91 (MQ=255) aTCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttttttt > 1:1368435/1‑91 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt > 1:4011673/1‑91 (MQ=255) aaaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGa < 1:560177/91‑1 (MQ=255) aaaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGa < 1:1463278/91‑1 (MQ=255) aaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGat < 1:267220/91‑1 (MQ=255) aaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGat < 1:267071/91‑1 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat > 1:4135983/1‑91 (MQ=255) cTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATAtt > 1:537640/1‑91 (MQ=255) cTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATAtt > 1:537625/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:878465/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:197550/1‑91 (MQ=255) cATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTa < 1:3768329/91‑1 (MQ=255) tACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTAct > 1:363728/1‑91 (MQ=255) tACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTAct > 1:362317/1‑91 (MQ=255) cGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTActtc > 1:211427/1‑91 (MQ=255) ttttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTAATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtcatc > 1:3528615/1‑91 (MQ=255) tAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATa > 1:2973441/1‑91 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 1:3897859/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc > 1:2770504/1‑91 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 1:3637444/91‑1 (MQ=255) aTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACt > 1:2482337/1‑91 (MQ=255) aTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACt > 1:3740872/1‑91 (MQ=255) aTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACt < 1:2343374/91‑1 (MQ=255) tCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTa > 1:518776/1‑91 (MQ=255) cATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTaa > 1:1424503/1‑91 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAt < 1:2407799/91‑1 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAt < 1:778392/91‑1 (MQ=255) tGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAtt > 1:1368084/1‑91 (MQ=255) tCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTa > 1:1674958/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc < 1:946273/91‑1 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc > 1:2811094/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc < 1:3265505/91‑1 (MQ=255) tCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACt > 1:1875606/1‑91 (MQ=255) tCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACt > 1:1826875/1‑91 (MQ=255) cTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtttt < 1:2944272/91‑1 (MQ=255) tCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTc < 1:1348628/91‑1 (MQ=255) ccAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCt < 1:1638754/91‑1 (MQ=255) ccAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCt < 1:239018/91‑1 (MQ=255) ccAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCt < 1:239131/91‑1 (MQ=255) ccAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCt < 1:239098/91‑1 (MQ=255) cAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCtt < 1:2119100/91‑1 (MQ=255) atttaaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTaa > 1:1245771/5‑91 (MQ=37) atttaaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTaa > 1:1245626/5‑91 (MQ=37) aTACAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTCTCTTaa < 1:3220580/91‑1 (MQ=255) tAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATGATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAAc < 1:3287492/91‑1 (MQ=255) tAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAAc < 1:3559417/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACt < 1:2595097/91‑1 (MQ=255) aaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGc > 1:2260855/1‑91 (MQ=255) aaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGca > 1:3110697/1‑91 (MQ=255) aTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTGATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGcac > 1:3404598/1‑91 (MQ=255) aTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGcac > 1:3404578/1‑91 (MQ=255) agccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAt > 1:933621/3‑91 (MQ=255) gccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:1675409/2‑91 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:356908/1‑91 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:1287514/91‑1 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:2465576/91‑1 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:1289164/91‑1 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:1287547/91‑1 (MQ=255) ccccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa > 1:1078421/1‑91 (MQ=255) ccccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa < 1:2599744/91‑1 (MQ=255) ccccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa > 1:3781043/1‑91 (MQ=255) cccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaa > 1:3208031/1‑91 (MQ=255) cccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaa > 1:3207891/1‑91 (MQ=255) ccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaa < 1:82643/91‑1 (MQ=255) ccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaa > 1:2825228/1‑91 (MQ=255) cAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaa > 1:1695619/1‑91 (MQ=255) cAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAGCATGATATTCTAGTTCTTCATTATAGCTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaa < 1:3311904/91‑1 (MQ=255) aGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACaa > 1:3943371/1‑91 (MQ=255) | CGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACAA > USA300TCH1516_ALE/690011‑690191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |