| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 4367 | 2 (0.610) | 42 (0.040) | 13/268 | 0.1 | 4.0% | intergenic (+332/‑133) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein |
| ? | NC_012417 | = 1991 | 2020 (0.900) | intergenic (+224/+102) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
TGTAATCACTCCATAATTCTGAAGTGTCTCCATGTCTACGCATAGACACGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCA > CP000731/4227‑4507 | cgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaAAACTTGT‑‑‑CGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑c > 1:808464‑M1/100‑141 (MQ=255) gatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCa > 1:826254‑M1/95‑141 (MQ=255) gtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGttt > 1:489703‑M1/54‑141 (MQ=255) gtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGttt > 2:281302‑M1/54‑141 (MQ=255) taatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGa > 1:942359‑M1/46‑141 (MQ=255) taaatacgggttactttagatactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGa > 2:187382‑M1/78‑141 (MQ=255) tcttaaatccgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTg > 1:746027‑M1/43‑141 (MQ=255) tcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTg > 2:4480‑M1/43‑141 (MQ=255) tcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTg > 1:714843‑M1/43‑141 (MQ=255) cttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGt > 2:240593‑M1/42‑141 (MQ=255) gggttactttagatactatttattccaattgctttattgacgtggagcctcggaacccttaacaatcccaAAACTTGT‑‑‑CGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAggg > 1:294514‑M1/71‑141 (MQ=255) gttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAgg > 1:266619‑M1/31‑141 (MQ=255) ttagatactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAc > 1:843036‑M1/25‑141 (MQ=255) agatactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGt > 1:975553‑M1/23‑141 (MQ=255) tactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCaa > 1:857293‑M1/20‑141 (MQ=255) cGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAACCTTGAAGACGAACGTCGGAATAGCTTTAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAA < 1:93081‑M1/141‑1 (MQ=255) tttATGCCGATAAAATTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑CAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAA < 1:254764‑M1/141‑1 (MQ=255) atttattccaattgcTTTATTGACGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAt > 1:524915‑M1/16‑141 (MQ=255) ccaattgcTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTg > 2:9510‑M1/9‑141 (MQ=255) aaaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT < 2:206217‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT < 1:795849‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCCA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAAT < 1:223216‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGGATA < 2:78616‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATA < 2:258935‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATA < 1:412743‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATA < 1:898505‑M1/141‑1 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATA > 1:592766‑M1/1‑141 (MQ=255) aaaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATA > 1:54682‑M1/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGATAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA < 1:759986‑M1/141‑1 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > 2:325447‑M1/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > 1:127500‑M1/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA < 2:52127‑M1/141‑1 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > 1:45971‑M1/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCAATCAATAATTTCTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > 1:310418‑M1/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGAGGGAGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAA > 1:965682‑M1/1‑141 (MQ=255) aTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAA > 1:278128‑M1/1‑141 (MQ=255) aTTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATCTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAA < 1:166619‑M1/141‑1 (MQ=255) tttATTGCTGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAt > 1:781457‑M1/1‑140 (MQ=255) tttATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAt > 1:863727‑M1/1‑140 (MQ=255) tttATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAt > 1:602323‑M1/1‑140 (MQ=255) tttATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAt > 2:242297‑M1/1‑140 (MQ=255) ttATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAttttctcggcataaat > 2:61084‑M1/1‑125 (MQ=255) tATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTGTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAttttctcggcataaatg > 2:293493‑M1/1‑124 (MQ=255) gagaA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttat > 1:303642‑M1/1‑62 (MQ=255) agaa‑‑‑gaACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTCAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAttttctcggcataaatgcgtcgtctatt > 1:499234‑M1/1‑113 (MQ=255) cccTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGCGTGTAAAGGGTTC‑‑‑TTCGCAACATCAATAAAttttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatc > 1:92227‑M1/1‑103 (MQ=255) tAACTAAACTTGCAGACGAATGTAGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCAGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAttttctcggcataaatgagtagtcagttttttattatcttca > 1:503726‑M1/1‑99 (MQ=255) cTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAttttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatga > 2:117802‑M1/1‑96 (MQ=255) cTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAATTTTGGGATTGTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAttttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatga > 2:164191‑M1/1‑96 (MQ=255) tAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAtgcgtcgtctattttttattatcttcatg > 1:561397‑M1/1‑112 (MQ=255) aaCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAgcaattggaataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgat > 1:939816‑M1/1‑96 (MQ=255) gaagaCGAATGTCGGAATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑Ccattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttc > 2:97588‑M1/3‑39 (MQ=255) aCGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttcc > 2:113157‑M1/1‑36 (MQ=255) tCGGCATAGCTTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACTTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAata < 2:314373/141‑1 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgtctgcaagtttcgttaagggttcttctcaacaccactaaacgttctcggcagagaggcggcgtctatttgttattatcttcatgataatcatatttttcttccatct > 1:441802‑M1/1‑29 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatct > 2:124010‑M1/1‑29 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaatttacgcgacacaaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttacatct > 2:400988‑M1/1‑29 (MQ=255) tCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgacaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgt > 2:376220‑M1/1‑29 (MQ=255) ggCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcg > 1:819996‑M1/1‑27 (MQ=255) cATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtc > 2:209803‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGTGAGCTATTAAGCNGACCattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctatttttttattatcttcatgataatcatttttttattcaatctcgtcaaa > 1:983695‑M1/1‑21 (MQ=255) gCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTC‑‑‑TTCTCAACATCAATAAAttttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagca < 2:368586‑M1/141‑79 (MQ=255) cTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAgcaattggaataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagc < 1:72833‑M1/141‑77 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:239074‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag > 1:352732‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag > 1:510427‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 2:101996‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:211031‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:404606‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:659978‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:685936‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatccttatag > 1:610380‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaacaaattttctcggcataactgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag < 1:587519‑M1/141‑136 (MQ=255) gCCGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggatcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatag > 1:569675‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttataga < 1:877699‑M1/141‑137 (MQ=255) ccGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttataga > 1:47058‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttataga < 2:227794‑M1/141‑137 (MQ=255) ccGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttataga < 1:70218‑M1/141‑137 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcacgtttagttacgggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcctcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:412186‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttctatctcgttaaaagcataatctttatagaa > 1:461549‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:86066‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:136512‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 1:178916‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:221469‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 1:117177‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:395749‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:113504‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:79882‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:35013‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:338565‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:319485‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 1:370024‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:201472‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 2:150391‑M1/141‑138 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa > 1:581980‑M1/1‑4 (MQ=255) cGA‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaa < 1:636885‑M1/141‑138 (MQ=255) a‑Cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaaaa > 1:384823‑M1/1‑2 (MQ=255) cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaaaaa > 1:231543‑M1/1‑1 (MQ=255) cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaaaaa < 1:346114‑M1/141‑141 (MQ=255) cattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacatcaataaattttctcggcataaatgcgtcgtctattttttattatcttcatgataatcatatttttcttccatctcgtcaaaagcatcatctttatagaaaaa > 2:174916‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGTAATCACTCCATAATTCTGAAGTGTCTCCATGTCTACGCATAGACACGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAA‑‑‑GAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGA‑CCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCA > CP000731/4227‑4507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |