| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,274,208 | C→T | S204L (TCA→TTA) | codY → | GTP‑sensing transcriptional pleiotropic repressor CodY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,274,208 | 0 | C | T | 82.3% | 162.7 / 25.0 | 68 | S204L (TCA→TTA) | codY | GTP‑sensing transcriptional pleiotropic repressor CodY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/5); new base T (22/34); total (29/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGCATAGTGAAGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGAAAAATTC > USA300TCH1516_ALE/1274069‑1274344 | aaGCATAGTGAAGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCa > 1:926445/1‑141 (MQ=255) aTAGTGAAGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAg < 2:274661/141‑1 (MQ=255) gAAGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCa < 1:471219/141‑1 (MQ=255) aaGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAg < 1:324489/141‑1 (MQ=255) gTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAGAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTAAAAAAGAAGCGATTGAACATAGCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGAt < 1:647522/141‑1 (MQ=255) aaaaGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGt < 1:421937/141‑1 (MQ=255) aagaagCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCTATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTg < 1:883699/141‑1 (MQ=255) aagaagCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTg > 1:626852/1‑141 (MQ=255) gaagCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGt > 2:324969/1‑141 (MQ=255) aagCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTa > 1:803092/1‑141 (MQ=255) gcgcgcGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTGGCAGATAGAGTTGGTAtt < 1:258430/141‑1 (MQ=255) cgcgcgATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTa > 1:842907/1‑141 (MQ=255) gATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGa < 2:152687/141‑1 (MQ=255) aGCTGCGATTACAATGGCAATTAATTCATTATGTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGt < 1:207948/141‑1 (MQ=255) ctgctATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTaa > 2:97906/1‑141 (MQ=255) tATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGt < 1:54366/141‑1 (MQ=255) ccAATGGCAATTAATTCATCATCTTATTCCGATAAAGAGGGGATTGAACGTGGTGGTGATATACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAAt < 1:831333/140‑1 (MQ=255) aCAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAAt > 1:538202/1‑141 (MQ=255) aTGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCa > 1:837532/1‑141 (MQ=255) tGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCAc < 2:273526/141‑1 (MQ=255) attaattCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGt > 1:280080/1‑141 (MQ=255) ttaattCATTATCTTATTCTGACAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTa < 2:351465/141‑1 (MQ=255) attCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAAt > 1:264687/1‑141 (MQ=255) tCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTa > 2:105978/1‑141 (MQ=255) aTTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGa > 2:115563/1‑141 (MQ=255) aTTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGa < 1:862114/141‑1 (MQ=255) aTTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGa > 1:305623/1‑141 (MQ=255) aTCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAg < 1:870872/141‑1 (MQ=255) ttCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTgg > 1:873433/1‑141 (MQ=255) aaaaGAAGCGATTGAACATATCGTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAAt < 2:162784/141‑1 (MQ=255) aaaGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAAtt > 1:529860/1‑141 (MQ=255) gaagCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAGATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGaa > 2:319219/1‑141 (MQ=255) agCGATTGAACATGTCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTATTTGaagc > 2:191807/1‑139 (MQ=255) agCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATc > 1:53911/1‑141 (MQ=255) gCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCa < 1:292830/141‑1 (MQ=255) gCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCa > 2:313425/1‑141 (MQ=255) cGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCAc < 2:151340/141‑1 (MQ=255) cGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCAc < 2:144347/141‑1 (MQ=255) gATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACg < 1:293887/141‑1 (MQ=255) gATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACg < 2:404986/141‑1 (MQ=255) gATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACg < 2:284452/141‑1 (MQ=255) atCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGa > 2:32732/1‑141 (MQ=255) tGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGaa < 1:625051/141‑1 (MQ=255) tGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGCTTCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGaa < 1:751231/141‑1 (MQ=255) gaaCTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGt < 1:177659/141‑1 (MQ=255) aCTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAgtacc < 1:676676/141‑5 (MQ=255) aCTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTAc < 2:8968/141‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt < 1:90943/141‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt > 1:811359/1‑141 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt < 1:329817/141‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt < 1:575100/141‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt > 2:7699/1‑141 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACt > 1:501237/1‑141 (MQ=255) gCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCa < 1:163049/141‑1 (MQ=255) gCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCa > 1:74908/1‑141 (MQ=255) gTACGGAAGGGCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTAGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTa < 1:386932/141‑1 (MQ=255) aCGGAAGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTaaa > 1:633991/1‑141 (MQ=255) aCGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTaaa < 1:68897/141‑1 (MQ=255) ggAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGt < 1:818872/141‑1 (MQ=255) aGGCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTaa > 1:375955/1‑141 (MQ=255) ggCCTATTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTaaa > 1:916232/1‑141 (MQ=255) aTTAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGa < 2:28467/141‑1 (MQ=255) ttAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGaa < 1:68489/141‑1 (MQ=255) ttAATCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGaa < 1:767618/141‑1 (MQ=255) aaTCGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGaaaa < 2:268691/141‑1 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGAAAAAtt < 1:54740/141‑1 (MQ=255) cGCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGAAAAAtt > 1:326535/1‑141 (MQ=255) gCATTAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGAAAAATTc > 1:82389/1‑141 (MQ=255) | AAGCATAGTGAAGTAGAAAAAGAAGCGCGCGATAAAGCTGCTATTACAATGGCAATTAATTCATTATCTTATTCTGAAAAAGAAGCGATTGAACATATCTTTGAAGAACTTGGCGGTACGGAAGGCCTATTAATCGCATCAAAAGTTGCAGATAGAGTTGGTATTACTAGATCTGTAATTGTAAATGCACTACGTAAATTAGAAAGTGCTGGTGTAATTGAATCACGTTCTTTAGGAATGAAAGGTACTTTCATTAAAGTTAAAAAAGAAAAATTC > USA300TCH1516_ALE/1274069‑1274344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |