New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2207748 = | 59 (1.280) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 5.6% | intergenic (+109/+155) | rodA/USA300HOU_RS11255 | Peptidoglycan glycosyltransferase RodA/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2207798 = | 47 (1.110) | intergenic (+159/+105) | rodA/USA300HOU_RS11255 | Peptidoglycan glycosyltransferase RodA/hypothetical protein |
ATGTCGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGATTC > USA300TCH1516_ALE/2207608‑2207888 | cagcatctaataaagtaagtcacgaattaaaataattgactgtgattgtgaatcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggatttactaaaatgaaagcaagtactatataacaaa < 1:183663‑M1/1‑1 (MQ=255) agcatctaataaagtaagtcacgaattaaaataattgactgtgattgtgaatcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggatttactaaaatgaaagcaagtactatataacaaaa > 1:712698‑M1/140‑141 (MQ=255) gTCGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAAt > 1:512281/1‑141 (MQ=255) gTCGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAAt > 1:137140/1‑141 (MQ=255) tCGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATc < 1:706306/141‑1 (MQ=255) cGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATcc < 2:141031/141‑1 (MQ=255) cGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATcc < 1:33136/141‑1 (MQ=255) gATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATccc > 1:88296/1‑141 (MQ=255) gATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATccc < 1:199660/141‑1 (MQ=255) aataaagtaagtcacgaattaaaataattgactgtgattgtgaatcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggattaactaaaatgaaagcaagtactatataacaaAATCCctct < 1:605959‑M1/9‑1 (MQ=255) tataCCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCtt < 1:368422/141‑1 (MQ=255) taCCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGAAAATAACAATCCCTCTTTg > 2:147560/1‑141 (MQ=255) aCCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGa < 1:643040/141‑1 (MQ=255) aTCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGt < 1:121116/141‑1 (MQ=255) aaGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACAtt > 1:63649/1‑141 (MQ=255) aaGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACAtt > 1:692010/1‑141 (MQ=255) aGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATACCTCTTTGAAGTACACATTg > 1:552735/1‑141 (MQ=255) gTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGt > 1:368109/1‑141 (MQ=255) attTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGt > 1:629770/1‑141 (MQ=255) tAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTaca < 1:731360/141‑1 (MQ=255) aaaCTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTacac < 1:267895/141‑1 (MQ=255) aCTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACActc > 1:112339/1‑141 (MQ=255) gattgtgaatcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggatttactaaaatgaaagcaagtactatataacaaAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAaga > 1:72093‑M1/98‑141 (MQ=255) attgtgaatcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggatttactaaaatgaaagcaagtactatataacaaAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAagag > 1:125560‑M1/97‑141 (MQ=255) gAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAgg > 1:167608/1‑141 (MQ=255) gAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAgg > 1:464763/1‑141 (MQ=255) tttCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGAt < 2:122582/141‑1 (MQ=255) ttCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGAtt < 1:90710/141‑1 (MQ=255) tCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGAttt > 1:716124/1‑141 (MQ=255) cAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGAtttt < 2:262437/141‑1 (MQ=255) tcacacaccgttaaagctatcgtcggactattcgatgatagcttttttgactggatttactaaaatgaaagcaagtactatataacaa‑‑TCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGtt > 2:268478‑M1/89‑141 (MQ=255) aaTATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGt < 2:291824/141‑1 (MQ=255) tCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTtata > 1:395501/1‑141 (MQ=255) cATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATAGAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTtatat < 1:50641/141‑1 (MQ=255) aCTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTa < 2:163661/141‑1 (MQ=255) ttttCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACt < 1:521265/141‑1 (MQ=255) ttttCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACt < 1:457423/141‑1 (MQ=255) ttttCAAGATGACGTTATATAGTCTAGTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACt < 2:201987/141‑1 (MQ=255) ttCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTg < 1:100946/141‑1 (MQ=255) cAAGATGACGTTATATNGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCt > 1:635430/1‑141 (MQ=255) cAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCt > 1:349764/1‑141 (MQ=255) cAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCt < 2:173482/141‑1 (MQ=255) cAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCt > 2:46145/1‑141 (MQ=255) tGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCAt > 2:266222/1‑141 (MQ=255) cGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCAtttt < 1:37919/141‑1 (MQ=255) ttATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAg > 2:87603/1‑141 (MQ=255) ataGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTaaa < 1:687769/141‑1 (MQ=255) cTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAg > 1:61010/1‑141 (MQ=255) cTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAg < 1:349012/141‑1 (MQ=255) cTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAg < 1:87921/141‑1 (MQ=255) aTTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTc > 1:716423/1‑141 (MQ=255) gtcgtcGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCaaaaaa > 1:419320/1‑141 (MQ=255) cgtcgATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAGACCAGTCAAAAAAGc > 1:242157/1‑141 (MQ=255) tcgATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTa > 1:46384/1‑141 (MQ=255) gATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTatc > 2:3859/1‑141 (MQ=255) tttAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTatcat < 2:10026/141‑1 (MQ=255) aTGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATa > 2:251590/1‑141 (MQ=255) tGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAg < 2:15353/141‑1 (MQ=255) tCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTc > 1:165545/1‑141 (MQ=255) tCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTc < 1:649322/141‑1 (MQ=255) atatatAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCcg < 1:239154/141‑1 (MQ=255) atataGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCcgac > 1:637012/1‑141 (MQ=255) tataGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCcgacg > 1:514326/1‑141 (MQ=255) ataGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCcgacga < 1:192535/141‑1 (MQ=255) atTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCtt < 2:14619/141‑1 (MQ=255) atTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCtt < 1:138922/141‑1 (MQ=255) cGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACgg > 1:391370/1‑141 (MQ=255) ataataACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGgtg > 2:39161/1‑141 (MQ=255) taataaCAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGgtgt < 1:726175/141‑1 (MQ=255) taataaCAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGgtgt > 1:286789/1‑141 (MQ=255) aCAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGAt > 2:186732/1‑141 (MQ=255) aCAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGAt > 2:165547/1‑141 (MQ=255) aCAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGAt > 1:477880/1‑141 (MQ=255) AATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGATTc < 1:670527‑M1/141‑1 (MQ=255) | ATGTCGATTTATACCATCCAAAAAGTAATTAATTTAAACTATTTTGAGTTTCAAATATCATAACTTTTCAAGATGACGTTATATAGTCTATTTACGTCGTCGATTTAAAATGTCATATATAGATATTACTCGATAATAACAATCCCTCTTTGAAGTACACATTGTAAAATGTACACTCTAAAGAGGGATTTTGTTATATAGTACTTGCTTTCATTTTAGTAAATCCAGTCAAAAAAGCTATCATCGAATAGTCCGACGATAGCTTTAACGGTGTGTGATTC > USA300TCH1516_ALE/2207608‑2207888 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |