New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 436 total aligned reads displayed.
TGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTT > CP000731/2142‑2434 | tatTCATGTATTAGAAATTCAAATAAACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTACTGATCTTTAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATg < 1:605587/148‑1 (MQ=255) aTGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAGGAATGTCGGc > 1:250673/1‑148 (MQ=255) aTGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGc > 1:110098/1‑148 (MQ=255) aTGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGc > 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cGAATGTCGGCATAGCCTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCtt < 1:738995/148‑1 (MQ=255) | TGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAATCAACCTACAGAGCATCCAGCTGCAAATGCAGTTCCGCAAACTGCTT > CP000731/2142‑2434 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |