Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,977,348 | G→C | L368V (CTA→GTA) | yhaO ← | putative metallophosphoesterase YhaO |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,977,348 | 0 | G | C | 100.0% | 45.3 / NA | 13 | L368V (CTA→GTA) | yhaO | putative metallophosphoesterase YhaO |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (6/7); total (6/7) |
TCAATTTTACGTTGAACAAATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTAGGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACTAATAATTCCGCTGAAAATTCATTAACTAAAGGTGACTCATCATTTTGTGCATATTGT > USA300TCH1516_ALE/1977205‑1977472 | tCAATTTTACGTTGAACATATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAAc < 1:234159/148‑1 (MQ=255) tCAATTTTACGTTGAACAAATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAAc < 1:172407/148‑1 (MQ=255) tCAATTTTACGTTGAACAAATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAAc < 1:204990/148‑1 (MQ=255) cGTTGAACAAATTGACCGTAACCATACATTTCAAGTGATTTCATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGcc < 1:124240/148‑1 (MQ=255) aaCAAATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTgg < 1:218561/148‑1 (MQ=255) aTTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCaa > 1:141074/1‑148 (MQ=255) tCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGttt > 1:214194/1‑148 (MQ=255) tCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGttt > 1:214214/1‑148 (MQ=255) tCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGttt > 1:217825/1‑148 (MQ=255) tCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACta > 1:10238/1‑148 (MQ=255) tCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACta > 1:194010/1‑148 (MQ=255) cTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACTAATAATTCCGCTGAAAATTCATTAACTAAAGGTGACTCATCAtt < 1:102748/148‑1 (MQ=255) gTCGAATGTTCCATAATCGTCTACGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACTAATAATTCCGCTGAAAATTCATTAACTAAAGGTGACTCATCATTTTGTGCATATTGt < 1:109665/148‑1 (MQ=255) | TCAATTTTACGTTGAACAAATTGACCGTAACCATAAATTTCAAGTGATTTAATTATCATTTTGTTCACCTCTCATTTCAGCTTTTAATATTTCTTCAGCACGATTAACTAATGCTGTATGGTCGAATGTTCCATAATCGTCTAGGAACTTAGATGCCCTTGGATTTAAATATAAATCTGACATCGCTTTATCAAAAACAGTTTGATCGACTAATAATTCCGCTGAAAATTCATTAACTAAAGGTGACTCATCATTTTGTGCATATTGT > USA300TCH1516_ALE/1977205‑1977472 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |