| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 837,540:1 | +T | 7.7% | intergenic (+34/‑235) | USA300HOU_RS04100 → / → uvrB | hypothetical protein/UvrABC system protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 837,540 | 1 | . | T | 7.7% | 963.3 / 71.0 | 246 | intergenic (+34/‑235) | USA300HOU_RS04100/uvrB | hypothetical protein/UvrABC system protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (110/117); new base T (9/9); total (120/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GGTTATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGCAC > USA300TCH1516_ALE/837450‑837630 | ggTTATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg < 2:417373/91‑1 (MQ=255)ggTTATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg > 1:664022/1‑91 (MQ=255) gTTATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg‑t > 1:1981832/1‑91 (MQ=255) tATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg‑ttg < 2:2439750/91‑1 (MQ=255) tATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg‑ttg < 1:2083542/91‑1 (MQ=255) tATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATttg‑ttg > 2:2180834/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGa < 1:2785101/91‑1 (MQ=255) aTTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTC‑AACAAATttg‑tttga < 1:1342065/91‑4 (MQ=255) ttAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGaaa < 2:3404032/91‑1 (MQ=255) ttAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGaaa > 2:3949594/1‑91 (MQ=255) tAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAAc < 1:2368950/91‑1 (MQ=255) aaTTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACa > 2:3241390/1‑91 (MQ=255) aaTTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTC‑AACAAATTTGTTTGAAACa < 1:1172317/91‑1 (MQ=39) aTTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTC‑AACAAATTTGTTTGAAACat < 1:479752/91‑2 (MQ=38) ttATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACaaa > 2:2699559/1‑91 (MQ=255) ataGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAat > 2:2156461/1‑91 (MQ=255) tCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAAtgatga > 1:118973/1‑91 (MQ=255) tCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAAtgatga > 2:1029270/1‑91 (MQ=255) cAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATgatgat < 1:1025065/91‑1 (MQ=255) cAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATgatgat < 1:1811567/91‑1 (MQ=255) aCTCGAATTTCGTAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTa < 1:3579889/91‑1 (MQ=255) cTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTaa > 1:221254/1‑91 (MQ=255) cTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTaa > 2:2524726/1‑91 (MQ=255) tCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAat < 1:1107263/91‑1 (MQ=255) cGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAata < 2:3263841/91‑1 (MQ=255) cGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAata < 2:3137876/91‑1 (MQ=255) aTTTCATAAACATCACGAGGAAGATCGCTCAGATTAACTTTAAACGAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTCAAACAAAACGTTGATTAGCATaa > 2:3725976/1‑91 (MQ=255) aTTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATaa < 1:1760439/91‑1 (MQ=255) aTTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATaa > 1:3528030/1‑91 (MQ=255) tttCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAAt < 1:3885391/91‑1 (MQ=255) cATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAAtgtg < 1:804629/91‑1 (MQ=255) aTAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATgtgt > 2:2369279/1‑91 (MQ=255) aTAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATgtgt < 1:3793455/91‑1 (MQ=255) aTAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATgtgt > 2:3380441/1‑91 (MQ=255) aaCATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTAtt < 2:2789452/91‑1 (MQ=255) aCATCAAGATGAGCATCGCTAAGATTAACTTGAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAATAGTATGATTAATATAATGTGTAttt < 2:1892229/91‑1 (MQ=255) aCATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTAttt < 2:3696794/91‑1 (MQ=255) aTCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTAc < 1:1011730/91‑1 (MQ=255) tCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACa < 2:2492527/91‑1 (MQ=255) cAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACAt > 1:1476771/1‑91 (MQ=255) aGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATAc > 1:3615344/1‑91 (MQ=255) gATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACt < 1:3502182/91‑1 (MQ=255) gATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACt > 2:327766/1‑91 (MQ=255) tGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaa > 2:3008073/1‑91 (MQ=255) tGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaa < 1:1418048/91‑1 (MQ=255) tGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAAAGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaa < 2:211463/91‑1 (MQ=255) gAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaa < 1:3340890/91‑1 (MQ=255) gAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaa < 2:3607851/91‑1 (MQ=255) gAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaa > 1:1519850/1‑91 (MQ=255) aaGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaaa > 1:890361/1‑91 (MQ=255) aGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAATCAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaaaa > 2:3472285/1‑91 (MQ=255) aGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTaaaaa < 2:2013758/91‑1 (MQ=255) gATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAAAATAATGTGTATTTACATACTAAAAAt < 2:2237066/91‑1 (MQ=255) tCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATaa < 1:2623491/91‑1 (MQ=255) tCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATaa < 1:66943/91‑1 (MQ=255) tCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATaa < 2:2077159/91‑1 (MQ=255) cGCTAAGATTAACTTTCAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAAc > 1:3923994/1‑91 (MQ=255) cGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TGGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAAc < 2:1301693/91‑1 (MQ=255) cTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑CTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACaa > 2:1280705/1‑91 (MQ=255) tAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAg < 2:1219944/91‑1 (MQ=255) aaGATTATCTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGa < 2:3506382/91‑1 (MQ=255) aaGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGa < 2:3662286/91‑1 (MQ=255) aaGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGa > 1:2145440/1‑91 (MQ=255) gATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATa < 1:2637523/91‑1 (MQ=255) tAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAAc < 1:2681988/91‑1 (MQ=255) tAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAAc < 2:2971253/91‑1 (MQ=255) tAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAAc < 1:700108/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACg < 2:1941566/91‑1 (MQ=255) cTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgat > 2:2277583/1‑91 (MQ=255) ttAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgattt > 1:1549655/1‑91 (MQ=255) aaaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttga < 2:1463164/91‑1 (MQ=255) aaaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttga > 2:46753/1‑91 (MQ=255) aaaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttga > 1:3212658/1‑91 (MQ=255) aaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttgat > 2:2329257/1‑91 (MQ=255) aaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttgat < 2:316674/91‑1 (MQ=255) aaaTAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttgat > 2:1595338/1‑91 (MQ=255) aataatGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACgatttgatt < 1:1277618/91‑1 (MQ=255) taatGTTTCGTACAAATTTG‑TTGAAACAAGATGATGATTAATGTAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTa < 1:3190944/91‑1 (MQ=255) ttGTTTC‑AACAAATTTGCTTGAAACAAAATGATGATTAATACAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAg > 2:2667151/2‑91 (MQ=255) atGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAg > 1:1366201/1‑91 (MQ=255) gTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGc < 1:74276/91‑1 (MQ=255) gTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACACACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGc > 2:3900792/1‑91 (MQ=255) gTTTC‑AACAAATTTGTTTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGc > 1:405456/1‑91 (MQ=39) tttCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCa > 2:3105237/1‑91 (MQ=255) ttCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCaa < 1:595369/91‑1 (MQ=255) tcaacaaaTTTGTTTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAg > 2:2938384/3‑91 (MQ=255) aaacaaaTTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCa < 2:1554255/91‑1 (MQ=255) aacaaaTTTGTTTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCa > 2:1777615/1‑91 (MQ=255) aacaaaTTTGTTTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCa > 1:3015019/1‑91 (MQ=255) aacaaaTTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCAt < 2:1702439/91‑1 (MQ=255) caaaTTTGTTTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATa > 2:564746/1‑91 (MQ=255) aaTTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGtt > 1:2887364/1‑91 (MQ=255) aaTTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGtt > 2:905337/1‑91 (MQ=255) tttG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAg < 2:1638927/91‑1 (MQ=255) tg‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGCTAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGca > 2:1084602/1‑91 (MQ=255) tg‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGca > 1:2823461/1‑91 (MQ=255) tg‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGca > 2:2065011/1‑91 (MQ=255) g‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGcac < 1:2444175/91‑1 (MQ=255) g‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGcac > 1:3813718/1‑91 (MQ=255) g‑ttgAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGACTTAAGGCAAGCATAGTGAGcac > 2:3197093/1‑91 (MQ=255) | GGTTATTTAATTATAGATCAACTCGAATTTCATAAACATCAAGATGAAGATCGCTAAGATTAACTTTAAAATAATGTTTCAAACAAATTTG‑TTGAAACAAAATGATGATTAATATAATGTGTATTTACATACTAAAAATAACAAGATAAACGATTTGATTTAAGGCAAGCATAGTTAGCAC > USA300TCH1516_ALE/837450‑837630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |