| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2721747 | 182 (0.890) | 7 (0.040) | 6/146 | NT | 3.9% | intergenic (+28/+119) | USA300HOU_RS14000/yciC_3 | putative hydrolase/Putative metal chaperone YciC |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2721776 | 176 (0.950) | intergenic (+57/+90) | USA300HOU_RS14000/yciC_3 | putative hydrolase/Putative metal chaperone YciC | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CACTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAGGCA > USA300TCH1516_ALE/2721657‑2721837 | aCTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGa > 2:1717703/1‑91 (MQ=255) cTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGAc > 2:2438921/1‑91 (MQ=255) cTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGAc > 2:352896/1‑91 (MQ=255) cTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGAc > 1:105020/1‑91 (MQ=255) cTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGAc < 1:1474159/91‑1 (MQ=255) tAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAg > 1:1275097/1‑91 (MQ=255) ttATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGtttt < 1:2674038/91‑1 (MQ=255) ttATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGtttt > 2:844756/1‑91 (MQ=255) atatTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTTTTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCa > 2:3025815/1‑91 (MQ=255) atatTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCa < 2:2287886/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAAt > 2:2531701/1‑91 (MQ=255) cAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATta > 1:1917250/1‑91 (MQ=255) aaaaaCCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATtat > 1:2903050/1‑91 (MQ=255) aaaaaCCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATtat > 2:1045327/1‑91 (MQ=255) aaCCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATAtt > 1:3393467/1‑91 (MQ=255) aCCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATAttt < 2:2358921/91‑1 (MQ=255) ccTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAACAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTg > 1:3503034/1‑91 (MQ=255) cTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGa > 1:645836/1‑91 (MQ=255) tGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGAt > 2:3813598/1‑91 (MQ=255) tGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGAt > 2:3031192/1‑91 (MQ=255) gAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATg < 1:1183436/91‑1 (MQ=255) aaGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATgg > 2:3478114/1‑91 (MQ=255) aGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGc < 1:1415973/91‑1 (MQ=255) tcTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTg < 2:3922935/90‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTg > 2:961574/1‑91 (MQ=255) cTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGa > 1:673436/1‑91 (MQ=255) ttGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAcc < 1:2862988‑M2/91‑3 (MQ=255) ttGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAcc < 1:662327‑M2/91‑3 (MQ=255) ttGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAcc < 1:1610007‑M2/91‑3 (MQ=255) tGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAcca < 1:2949162‑M2/91‑4 (MQ=255) tGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAcca < 2:2065574‑M2/91‑4 (MQ=255) gCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaa < 2:40509‑M2/91‑5 (MQ=255) gCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaa > 1:78226‑M2/1‑87 (MQ=255) gCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaa < 2:435098‑M2/91‑5 (MQ=255) gCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaa > 1:2379132‑M2/1‑87 (MQ=255) cTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaag < 2:580719‑M2/91‑6 (MQ=255) tGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagc > 2:1605828‑M2/1‑85 (MQ=255) tGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagc < 1:403954‑M2/91‑7 (MQ=255) tGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagc > 1:3079684‑M2/1‑85 (MQ=255) gATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagct > 2:3826919‑M2/1‑84 (MQ=255) aTGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCtt < 2:2945245/91‑1 (MQ=255) aTGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCtt < 2:1538444/91‑1 (MQ=255) tGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCtta < 2:2986811/91‑1 (MQ=255) tGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCtta > 1:1836637/1‑91 (MQ=255) gTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttat > 1:2731545/1‑91 (MQ=255) attattAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttattt < 2:2330846/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttatttt > 1:2190842/1‑91 (MQ=255) tattaAATATGTAGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttattttt < 2:3285274/91‑1 (MQ=255) attaAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttattttta < 2:2084988/91‑1 (MQ=255) ttaAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttatttttat < 2:3372347/91‑1 (MQ=255) ttaAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCttatttttat < 2:138053/91‑1 (MQ=255) atatGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTAc > 2:3339670/1‑91 (MQ=255) tatGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACg < 1:1859790/91‑1 (MQ=255) atGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGc < 1:1665648/91‑1 (MQ=255) tgtgGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCt < 2:758120/91‑1 (MQ=255) gtgGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCtt < 2:1126079/91‑1 (MQ=255) gtgGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCtt > 1:420431/1‑91 (MQ=255) tgGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTa > 1:763654/1‑91 (MQ=255) tgGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTa > 2:2982946/1‑91 (MQ=255) ggggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTaa < 2:1229512/91‑1 (MQ=255) ggggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTaa < 1:2993420/91‑1 (MQ=255) ggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACTGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAAc < 2:3123807/91‑1 (MQ=255) ggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAAc > 2:1509436/1‑91 (MQ=255) ggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAAc < 1:1340095/91‑1 (MQ=255) ggTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAAc > 2:3622065/1‑91 (MQ=255) tAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGtt > 1:2514290/1‑91 (MQ=255) tAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGAGGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGtt < 1:3320242/91‑1 (MQ=255) tgattgTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTCCaaa > 2:70858/1‑91 (MQ=255) gattgTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAAt > 2:2876413/1‑91 (MQ=255) tgTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCaa < 1:3251823/91‑1 (MQ=255) tgTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCaa < 1:3812015/91‑1 (MQ=255) tgTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCaa < 2:787389/91‑1 (MQ=255) gTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAAc < 1:3611799/91‑1 (MQ=255) ttCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACt > 1:3728830/1‑91 (MQ=255) ttCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACt < 1:2764280/91‑1 (MQ=255) tctcTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTc > 2:1000611/1‑91 (MQ=255) ctAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGtt > 1:1059688/1‑91 (MQ=255) ctAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGtt < 1:3423120/91‑1 (MQ=255) aataaAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGttat < 2:1789226/91‑1 (MQ=255) atagAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGttatt < 1:3063473/91‑1 (MQ=255) aaaCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataata < 2:2006174‑M2/91‑52 (MQ=255) aaaCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATtata < 1:525911/91‑1 (MQ=255) aaaCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATtata < 1:2289119/91‑1 (MQ=255) aCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACa > 1:2325659/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACa < 1:1732733/91‑1 (MQ=255) aCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACa > 2:2787121/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGC‑‑‑‑‑‑TTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAgg < 2:399100/91‑1 (MQ=255) aGCTTGGtcagccatcaaatataatttgaaaactgtccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatc > 1:2238081‑M1/1‑7 (MQ=255) aGCTTGGtcagccatcaaatataatttgaaaactgtccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatc > 2:3825975‑M1/1‑7 (MQ=255) aGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATg < 2:389327/91‑1 (MQ=255) gCTTGGtcagccatcaaatataatttgaaaactgtccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatca > 1:2851210‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGa < 2:1108245/91‑1 (MQ=255) cTTGGtcagccatcaaatataattttaaaactgtccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatcag < 2:1922390‑M1/91‑87 (MQ=255) cTTGGtcagccatcaaatataatttgaaaactgtccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatcag < 2:1986799‑M1/91‑87 (MQ=255) ttGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGAccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatcagc < 1:3084726‑M2/91‑59 (MQ=255) ttGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAg > 1:1534416/1‑91 (MQ=255) tGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAgg > 2:174620/1‑91 (MQ=255) tGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATAACTGTccaagctgttttattagagaacaatcaattaaccccacatatttaataatacatcagca < 1:3905339‑M2/91‑60 (MQ=255) ggACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAGGc > 2:993344/1‑91 (MQ=255) gACAGTTATCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCATATATTTATTCACGCTTAAACGTTCAAATACACTCGTTAATATACATGAAGGCa > 2:3672961/1‑91 (MQ=255) | CACTTAGGTTATATTCAAAAACCTGAAGGCTTTGCTGATGTATTATTAAATATGTGGGGTTAATTGATTGTTCTCTAATAAAACAGCTTGGACAGTTTTCAAATTATATTTGATGGCTGACCAAGCTTATTTTTATTTACGCTTAAACGTTCAAATCAACTCGTTATTATACATGAAGGCA > USA300TCH1516_ALE/2721657‑2721837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |