| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2684946 = | 213 (1.050) | 6 (0.030) | 4/142 | NT | 3.3% | intergenic (‑14/‑395) | ogt/clpL | Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase/ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpL |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2684983 = | 162 (0.900) | intergenic (‑51/‑358) | ogt/clpL | Methylated‑DNA‑‑protein‑cysteine methyltransferase/ATP‑dependent Clp protease ATP‑binding subunit ClpL | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
ATCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAGT > USA300TCH1516_ALE/2684893‑2685073 | aTCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAat < 1:1338586/91‑1 (MQ=255)aTCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAat > 2:1648481/1‑91 (MQ=255)aTCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAat > 1:3084474/1‑91 (MQ=255)aTCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAat > 2:2900371/1‑91 (MQ=255) tCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAata < 2:218995/91‑1 (MQ=255) tCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAAACCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTACTTGTTAAATTAGAAAata < 1:3891309/91‑1 (MQ=255) gTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATAtt < 2:2996695/91‑1 (MQ=255) gTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATAtt < 1:394882/91‑1 (MQ=255) atatacgtaattgacgacttatttatttttaaaaaatgtgaacatgaataTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATAtt > 2:570537‑M1/51‑91 (MQ=255) cTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCAt > 2:2288570/1‑91 (MQ=255) tACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGCAAATATTCATg > 2:3589293/1‑91 (MQ=255) tACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATg > 1:1149855/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGt > 2:1298950/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGt < 1:663560/91‑1 (MQ=255) aCAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGt > 1:614424/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGt > 1:2780417/1‑91 (MQ=255) aCAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGt > 2:3394496/1‑91 (MQ=255) cAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAGATTAGAAAATATTCATGtt < 2:1742928/91‑1 (MQ=255) cAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGtt < 1:2905559/91‑1 (MQ=255) gCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTcac < 1:3230076/91‑1 (MQ=255) gCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTcac < 2:3954983/91‑1 (MQ=255) cGAATCATAGTAACTCTTATACTCCGTAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAAGATTCATGTTcaca < 2:379930/91‑1 (MQ=255) aTCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAttt < 2:2780172/91‑1 (MQ=255) aTCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAttt > 1:1869205/1‑91 (MQ=255) aTCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAttt < 1:1248163/91‑1 (MQ=255) tCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTTTTATCTTTCGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAtttt > 2:1337831/1‑91 (MQ=255) tCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAtttt > 1:1835262/1‑91 (MQ=255) aTAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACAtttttt < 2:1823667/91‑1 (MQ=255) tAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTTTTTATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTa > 2:3706897/1‑91 (MQ=255) tAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTa > 1:3853175/1‑91 (MQ=255) aGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTaa > 2:1478947/1‑91 (MQ=255) aGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTaa > 2:884720/1‑91 (MQ=255) gTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTaaa > 2:144818/1‑91 (MQ=255) aaCTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTTTTCATATGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTaaaaa > 2:2679893/1‑91 (MQ=255) aaCTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTaaaaa > 2:1404933/1‑91 (MQ=255) ctctTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTGTTAAaaata > 1:3789953/1‑91 (MQ=255) tctTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAGTTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataa > 1:3287724/1‑91 (MQ=255) tctTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataa > 1:897930/1‑91 (MQ=255) ctTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataaa > 1:2999043/1‑91 (MQ=255) ttATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGGAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataaat > 2:1957029/1‑91 (MQ=255) ttATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataaat > 2:2666/1‑91 (MQ=255) ttATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAaaataaat > 2:2107533/1‑91 (MQ=255) ttATACGCCATAAAAATCCCCCCTTATTCTAACCATATGCCTTAATATTCAAATGAGCAAGTATTAATCGTCACATTTCTTAAaaataaat > 2:3120/1‑91 (MQ=255) taCTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAg > 1:1096966/1‑91 (MQ=255) aCTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAgt > 1:3405045/1‑91 (MQ=255) ccATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTATAAATAAATAAgtcgt > 2:2319163/1‑91 (MQ=255) ccATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAgtcgt < 2:2280536/91‑1 (MQ=255) cATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAgtcgtc > 2:1864021/1‑91 (MQ=255) aTAAAAATCCCCCCTTTTTCTTTTCTTTCGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACCTTTTTTAAAAATAAATACGTCGTCa > 2:3519739/1‑91 (MQ=255) aaTCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTATTTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTAc < 2:2102532/91‑1 (MQ=255) aaTCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTAc < 1:1475758/91‑1 (MQ=255) aTCCCCCCTTTTTCTTTTTATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACg > 2:1384925/1‑91 (MQ=255) aTCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACg < 1:669659/91‑1 (MQ=255) tCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGt < 1:507416/91‑1 (MQ=255) cccgccTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTGCGta < 1:3122471/91‑1 (MQ=255) ccccccTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGta < 1:1490918/91‑1 (MQ=255) tgaatattttctaatttaacaattaaggcgtatgattagaaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGtat > 1:2084615‑M2/44‑91 (MQ=255) cccccTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGtat < 2:1596148/91‑1 (MQ=255) cccccTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTAATGTTCACATTTTTTAAAAATAACTAAGTCGTCAATTAAGtat > 2:602649/1‑91 (MQ=255) cccccTTCGTCTAATCATAAGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTGATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGtat < 2:3414047/91‑1 (MQ=255) cccTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGtatat < 1:1998104/91‑1 (MQ=255) cTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATaa < 2:2527682/91‑1 (MQ=255) tttttCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAAGTACGTATATaaa < 1:3039935/91‑1 (MQ=255) TTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAac > 2:105842‑M1/1‑91 (MQ=255) ttctaatttaacaattaaggcgtatgattagaaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAacac > 1:3484321‑M2/36‑91 (MQ=255) TCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACg < 2:3187980‑M1/91‑1 (MQ=255) TCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACg > 1:2208361‑M1/1‑91 (MQ=255) CTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGt < 2:2010398‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGt < 2:3152550‑M1/91‑1 (MQ=255) CTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGt < 2:2940665‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAAt < 2:2164964‑M1/91‑1 (MQ=255) TCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATa < 1:1978822‑M1/91‑1 (MQ=255) gCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCt > 1:775014/1‑91 (MQ=255) gCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCt < 1:3396645/91‑1 (MQ=255) gCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCt < 2:1147545/91‑1 (MQ=255) ccTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTa < 1:1000090/91‑1 (MQ=255) ccTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTa < 1:2958365/91‑1 (MQ=255) cTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTAt < 1:42508/91‑1 (MQ=255) ttAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCCCATGTTTTAAAAATAAATCAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATc < 2:739625/91‑1 (MQ=255) ttAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATc < 1:1533201/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCAc > 2:637756/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACtt < 2:2425974/91‑1 (MQ=255) gTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACCTtg > 1:3549825/1‑91 (MQ=255) tAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTtgct > 2:469919/1‑91 (MQ=255) aaaTTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTtgctg > 1:2745254/1‑91 (MQ=255) aaTTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTtgctgc < 1:2336939/91‑1 (MQ=255) aaTTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTtgctgc > 2:2761127/1‑91 (MQ=255) tagaaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAat < 2:5478‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAatat > 2:1861046‑M2/6‑91 (MQ=255) aaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAAtata < 2:2953674‑M2/87‑1 (MQ=255) aaaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAAtata > 1:978634‑M2/5‑91 (MQ=255) aaaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATAc > 2:3926124‑M2/4‑91 (MQ=255) aaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACa > 2:3874478‑M2/3‑91 (MQ=255) aaTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACa > 1:3622714‑M2/3‑91 (MQ=255) aTATTCATGTTCACATTTTTTTAAATTAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAg > 2:3663513‑M2/2‑91 (MQ=255) aTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAg > 1:2391144‑M2/2‑91 (MQ=255) aTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAg > 1:357175‑M2/2‑91 (MQ=255) aTATTCATGTTCACATTTTTTAAAAACAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAg > 2:2245125‑M2/2‑91 (MQ=255) tatTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAGt > 1:1669036/1‑91 (MQ=255) tatTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAGt > 2:3821777/1‑91 (MQ=255) | ATCGTCCTACAGGCGAATCATAGTAACTCTTATACTCCATAAAAATCCCCCCTTTTTCTAATCATACGCCTTAATTGTTAAATTAGAAAATATTCATGTTCACATTTTTTAAAAATAAATAAGTCGTCAATTACGTATATAAACACGTAATACCAGCTATCACTTTGCTGCAATATACAGT > USA300TCH1516_ALE/2684893‑2685073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |