| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 1975 = | NA (NA) | 186 (0.100) | 20/138 | NT | 24.8% | intergenic (+208/+118) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2042 = | 654 (0.310) | intergenic (+275/+51) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 2047 total aligned reads displayed.
TGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1952‑2132 | cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatgttcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:3183207‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:1213576‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:3604030‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag < 1:3458982‑M2/1‑1 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:1684408‑M2/91‑91 (MQ=255)cgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttag > 1:1613822‑M2/91‑91 (MQ=255) gttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGt < 2:3136071‑M2/2‑1 (MQ=255) ttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGtt < 2:3215169‑M2/3‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 2:1158648‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 2:3364115‑M2/4‑1 (MQ=255) tgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTa < 1:153674‑M2/4‑1 (MQ=255) gagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTaa < 1:781549‑M2/5‑1 (MQ=255) agcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAg < 2:2122225‑M2/6‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:352077‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 2:557501‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:3887652‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAgg < 1:846711‑M2/7‑1 (MQ=255) gcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGGTAAgg > 2:3659589‑M2/85‑91 (MQ=255) cctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAggg < 1:3281516‑M2/8‑1 (MQ=255) ctcggaacccttcacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt > 1:3025081‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaagcttgtcgaatgggcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 2:269562‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcacgtttaGTTAAGGGt > 2:2055912‑M2/83‑91 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 2:2641285‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagcgcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 2:2291738‑M2/9‑1 (MQ=255) agaagaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGt < 1:475523‑M2/9‑1 (MQ=255) tcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGtt < 2:2580323‑M2/10‑1 (MQ=255) cggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTc < 1:2023091‑M2/11‑1 (MQ=255) cccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAgg > 2:930547‑M2/76‑91 (MQ=255) ccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGc > 2:2912657‑M2/75‑91 (MQ=255) ttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTc > 1:2669638‑M2/73‑91 (MQ=255) ttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTc > 1:1001415‑M2/73‑91 (MQ=255) ttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTc > 1:631217‑M2/73‑91 (MQ=255) acaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAc > 1:3119556‑M2/70‑91 (MQ=255) caatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACg > 2:3054438‑M2/69‑91 (MQ=255) caatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACg > 2:876445‑M2/69‑91 (MQ=255) atcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTc > 1:576971‑M2/67‑91 (MQ=255) acttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttaGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc > 2:2978197‑M2/59‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:1750088‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 2:464407‑M2/6‑91 (MQ=255) tcggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat < 1:113670‑M2/86‑1 (MQ=255) gtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGCGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 2:1690854‑M2/29‑91 (MQ=255) gtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 1:729039‑M2/29‑91 (MQ=255) gtcggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCCCAACGTCAATAAAGCAATTGGaat > 2:1287506‑M2/29‑91 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata < 1:2738631‑M2/87‑1 (MQ=255) cggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaata < 1:917138‑M2/87‑1 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:1059699‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:1796998‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 2:806578‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2287342‑M2/4‑91 (MQ=255) ggcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCAGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:3380829‑M2/4‑91 (MQ=255) cggcttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataa > 1:2336884‑M2/27‑91 (MQ=255) gcATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaa < 1:287392‑M2/89‑1 (MQ=255) cttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata > 1:2163384‑M2/24‑91 (MQ=255) cttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata > 1:3825102‑M2/24‑91 (MQ=255) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 1:2552422/91‑1 (MQ=32) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATAGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGaataaata < 2:3754752/91‑1 (MQ=17) ttaatagctcacgctatgccgaCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGATTAAATAg > 1:1956409‑M2/23‑91 (MQ=255) aGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGt > 2:2437806/1‑91 (MQ=34) gCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTa < 1:2234124/91‑1 (MQ=35) tagctcacgctatgccgacCATGCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTAt > 2:185858‑M2/20‑91 (MQ=255) gTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc < 1:2405885/91‑1 (MQ=38) tGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt < 1:2472794/91‑1 (MQ=39) gAGCTATTAAGCCGACCATTCGACGAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa > 2:3833157/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 2:410911/1‑91 (MQ=255) ttAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGATCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTaa > 1:3943699/1‑91 (MQ=255) aaGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAcc > 2:3264351/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 1:2798487/91‑1 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc > 1:991842/1‑91 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAccc < 2:2233260/91‑1 (MQ=255) cGACCATTGGGCAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCGGGGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTa < 1:1438477/91‑1 (MQ=18) aCCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAtt > 2:1356512/1‑91 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt > 1:2918477/1‑91 (MQ=255) ccATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTAttt < 1:419797/91‑1 (MQ=255) ATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa < 2:1771454‑M2/91‑1 (MQ=255) ATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTCGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTaa > 1:3239540‑M2/1‑91 (MQ=255) TTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAg < 1:2616086‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 2:2380361‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 2:3594997‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 2:2837693‑M2/91‑1 (MQ=255) TCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGa < 2:1589083‑M2/91‑1 (MQ=255) CGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGCCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAt < 1:1488827‑M2/91‑1 (MQ=255) GACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGAtt > 2:1512059‑M2/1‑91 (MQ=255) cAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTAc > 1:3763161/1‑91 (MQ=255) cAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTAc > 1:2077910/1‑91 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg < 2:3440793/91‑1 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg > 2:3531759/1‑91 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg < 2:143094/91‑1 (MQ=255) ttttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTg < 1:2962402/91‑1 (MQ=255) tttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGt < 1:1849790/91‑1 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc > 2:675705/1‑91 (MQ=255) tGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTAc < 1:672398/91‑1 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa > 2:1975317/1‑91 (MQ=255) gggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACa < 1:1359267/91‑1 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt > 1:1270386/1‑91 (MQ=255) ggATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACAt < 2:1224941/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 2:1089598/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGACAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCt < 1:3668734/91‑1 (MQ=255) ttGTTAAGGGTTCCGACGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGTGTACATTGTACATCCt < 2:27750/91‑1 (MQ=255) tGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTCAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCtt > 2:3908059/1‑91 (MQ=255) GTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTc > 2:2511982‑M2/1‑91 (MQ=255) | TGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGATTACATTGTACATCCTTC > NC_012417/1952‑2132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |