Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | A→G | 21.7% | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920 ← / ← dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | 0 | A | G | 21.7% | 565.0 / 167.0 | 294 | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920/dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (103/126); new base G (25/38); total (128/166) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.30e-01 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
CTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803450‑803629 | ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:392210/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCAATTTAAATGACtt > 2:1161551/1‑91 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:2872211/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:1644669/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:402803/91‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTAc < 2:189766/91‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTAc < 2:2085000/91‑1 (MQ=255) aaTCAGCATGTTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTAc < 1:3554370/91‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 2:1066623/1‑91 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:3037088/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:3661600/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg < 2:1829350/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg < 1:931319/91‑1 (MQ=255) gtgCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 2:1294314/89‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATGTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 2:660598/91‑1 (MQ=38) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAATCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt > 2:1550186/1‑91 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 1:1680374/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 1:2335184/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 1:1070818/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt > 1:1454280/1‑91 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATGTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAACAAAACAGTAAGCCATTTAAAGGACTTACTGt > 2:778855/1‑91 (MQ=255) ggCATATTAAGTTTTTATTTATACTGAGAGCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 2:2232846/90‑1 (MQ=37) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 2:827016/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 1:3813417/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 2:3561213/91‑1 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGttt < 1:1250485/91‑1 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttt < 2:40161/91‑1 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttt < 2:1201385/91‑1 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttt > 1:2270531/1‑91 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttttt > 1:3178100/1‑91 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttttt < 2:3051523/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAACAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttttt < 2:3081625/91‑1 (MQ=255) atTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttttttc > 2:1107534/1‑90 (MQ=255) atTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTg < 1:2547031/91‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGaa < 1:3476075/91‑1 (MQ=255) aGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAAtt < 1:3858438/91‑1 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAgg > 2:1957055/1‑91 (MQ=255) tttatttaTACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGc < 1:3432400/91‑1 (MQ=255) ttatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTAT‑AACAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGCTTTTTGAATTAGGCca > 2:3769102/1‑91 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCca > 1:2936157/1‑91 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCca > 2:3793367/1‑91 (MQ=255) atttatACTGATATCTTGGATTTAATGAATAGATACTTCTAAAAAAACATTGAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaa < 2:3907622/91‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:3867327/91‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaac < 2:1247781/91‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGCAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:3421040/91‑1 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAat > 2:2522716/1‑91 (MQ=255) cTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 2:3042412/91‑1 (MQ=255) atatCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAGAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAc < 2:201279/91‑1 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 2:1766549/1‑91 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:644343/1‑91 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACATATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 2:3355594/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt < 1:3629444/91‑1 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt > 2:565969/1‑91 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt < 2:146688/91‑1 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 1:1497307/1‑91 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 2:649186/1‑91 (MQ=255) atAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCtt > 1:559475/1‑91 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCttt > 1:2159259/1‑91 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCTATTTATATGACTCACTGGATTTTGAATTAGGCAAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg > 2:3170121/1‑91 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:3842573/91‑1 (MQ=255) aaaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgat < 1:129369/91‑1 (MQ=255) aaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg > 1:2587734/1‑91 (MQ=255) cTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGAtt > 2:167967/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 1:2237034/1‑91 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaa > 1:2683385/1‑91 (MQ=255) taAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaaa > 1:1712414/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaCAGTAAGTCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 1:3902186/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 2:2965472/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 1:2475155/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 2:3130535/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:711122/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 2:2179306/1‑91 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt < 1:3774425/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 2:102754/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTg > 2:3185999/1‑91 (MQ=255) cAGTCAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGCTGATTACAGGTGAGAt > 2:3170923/1‑91 (MQ=255) cAGTAAGCCATTTAGATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAt < 2:332948/91‑1 (MQ=255) aGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTGTTGACTTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAGGGTGAGAtt > 2:2803862/1‑91 (MQ=38) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg > 1:3215602/1‑91 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg < 1:1152508/91‑1 (MQ=255) gTAACCCATTGAAGTGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTGCATCGCTTTGATGTTTAAAGGTGAGATTg < 2:2513803/91‑1 (MQ=255) tAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 1:2083603/1‑91 (MQ=255) aagtcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt > 1:1925422/5‑91 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt < 2:3853750/91‑1 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTAGACCTTTCATCGCTTTGATGATTATAGGTGAGATTGCt > 2:3229973/1‑91 (MQ=255) agtcATTTAAATGGCTTACTGTATTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTa > 1:1616679/4‑91 (MQ=255) aGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTa > 2:1441631/1‑91 (MQ=255) gCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCCCTTTGCTGATTAAACGTGAGATTGCTac > 2:1420800/1‑90 (MQ=255) ccATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 2:2128803/91‑1 (MQ=255) ccATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 1:1795574/91‑1 (MQ=255) cATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATa < 2:1809158/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc > 1:1550178/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc > 1:728975/1‑91 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:2356803/1‑91 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:313543/1‑91 (MQ=255) tttAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa < 2:523343/91‑1 (MQ=255) ttAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa < 1:3350789/91‑1 (MQ=255) tAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 1:1635787/1‑91 (MQ=255) tAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 1:2733680/1‑91 (MQ=255) aCTTACTGTTTTTTGTATTATTCCAACAATATTAACCTCTACCTTTCATCACTTTGCTGATTAAAGGTGAGCTTGCTCATACAATtgttgt > 2:2487224/1‑91 (MQ=255) | CTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803450‑803629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |