| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 937,148 | T→C | 11.7% | intergenic (+55/‑76) | USA300HOU_RS04665 → / → pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 937,148 | 0 | T | C | 11.7% | 681.1 / 70.3 | 256 | intergenic (+55/‑76) | USA300HOU_RS04665/pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (109/117); new base C (4/26); total (113/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GGTATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTA > USA300TCH1516_ALE/937058‑937238 | ggtATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTACATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGt > 1:24686/1‑91 (MQ=255)ggtATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGt > 1:2059328/1‑91 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt < 1:910828/91‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCtt > 1:688289/1‑91 (MQ=255) tttAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgt < 1:3789447/91‑1 (MQ=255) tttAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgt < 2:160170/91‑1 (MQ=255) tAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtgt > 1:1263901/1‑91 (MQ=255) tAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtgt < 2:57843/91‑1 (MQ=255) ggCAGTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTGTAAATAAAGTTTCAGCTAAGCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAgtgac < 2:2471826/90‑3 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATGAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTc > 2:3902961/1‑91 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtgac < 1:2474405/91‑3 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTc < 1:3619686/91‑1 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTc < 2:3459499/91‑1 (MQ=255) gCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGTCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCa < 2:1762865/91‑1 (MQ=255) gCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAgtgaca < 1:456432/91‑4 (MQ=255) cATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGacac < 2:2430015/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACt < 2:2658237/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACt < 2:1467843/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACt < 2:472449/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTg < 1:1949292/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGa > 1:2403669/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGa < 1:2671698/91‑1 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 1:2717264/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGaa < 1:3927584/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAg > 2:1918051/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAgg < 2:1196304/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAgg < 1:1508815/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAgg < 2:308214/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAggg < 1:2579496/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 1:2106721/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 2:1858865/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc > 1:2186674/1‑91 (MQ=255) aaaGGTAAATTCAAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc > 1:3049281/1‑91 (MQ=255) aGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACtt < 1:155035/91‑1 (MQ=38) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAATTTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt > 2:3475606/1‑91 (MQ=255) gTAAAGTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAGAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTa < 2:2643814/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:3890396/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:2985756/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt > 1:1206838/1‑91 (MQ=255) aaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttg < 2:3232409/91‑1 (MQ=255) ttCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgtt < 1:1677493/91‑1 (MQ=255) tCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgttg < 2:1034111/91‑1 (MQ=255) tAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAGCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCGCTGAAGGGCTTTATTGTTGTa < 2:1044917/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATATAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc < 2:3632641/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc > 2:1501414/1‑91 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc < 2:1638898/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc > 2:1871941/1‑91 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa < 1:1730255/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt > 1:1737014/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt > 1:1154746/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAtt > 1:2901081/1‑91 (MQ=255) ttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAttt < 1:3828666/91‑1 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:3510991/1‑91 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:2555464/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg > 2:3921189/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg < 1:1091313/91‑1 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATACATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAg > 2:3024800/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATACATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTAATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAg > 2:3024596/1‑91 (MQ=255) gTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGt > 1:1121745/1‑91 (MQ=255) gTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGt < 1:2133068/91‑1 (MQ=255) tttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTa < 1:2651219/91‑1 (MQ=255) ttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTTTTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTaa > 2:1722832/1‑91 (MQ=255) tCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAAc < 2:2161350/91‑1 (MQ=255) aGCTAAACACATAACATTAAATTATTCATTTCTAAAGTCCTTCAGTGTCACTCAACGGCTTTATTGTTGTACAATTTGCAGTGAGTAACat > 2:3355668/1‑91 (MQ=255) aGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACat < 1:2354701/91‑1 (MQ=255) tAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATc < 2:2784920/91‑1 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTCACATATCaa > 1:3788938/1‑91 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 1:2263980/91‑1 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 2:297277/91‑1 (MQ=255) caTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCt < 1:1139211/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTa > 1:412395/1‑91 (MQ=255) tAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTaa > 1:563877/1‑91 (MQ=255) tAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTaa > 2:245861/1‑91 (MQ=255) aaaaTTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGATGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAag > 1:3571491/1‑91 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAAACTAaggag < 1:329081/91‑1 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATAGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3419759/91‑1 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt > 2:3764023/1‑91 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt > 1:1802090/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa < 1:1856815/91‑1 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa > 1:1326830/1‑91 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc > 2:810161/1‑91 (MQ=255) attattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACa > 1:840827/1‑91 (MQ=255) attattCATTTATAAAGTCCTAAAGTGCCACTGAAGGGTTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATGAAATCTAGGGAGGAAcg > 2:3524273/1‑90 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa < 2:525529/91‑1 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa > 1:2823086/1‑91 (MQ=255) tCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATg > 2:1792846/1‑91 (MQ=255) tCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATg > 1:1471733/1‑91 (MQ=255) cATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGa < 2:238878/91‑1 (MQ=255) cATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGa < 1:1258590/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTCATGTTGTACAATCTGAAGTGAGTAACATATAAAATCTAAGGCGGTACAGTATGaa > 2:1143619/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAATTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 1:3343707/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 2:1195055/91‑1 (MQ=255) tttATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAt > 2:1289431/1‑91 (MQ=255) ataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAtttt < 1:2265345/91‑1 (MQ=255) taAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTtta > 2:2047581/1‑91 (MQ=255) taAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTtta > 1:1370591/1‑91 (MQ=38) aaaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa < 1:2260043/91‑1 (MQ=255) aaaGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa > 1:3742382/1‑91 (MQ=38) gTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatt < 1:403989/91‑1 (MQ=255) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta < 2:2778323/91‑1 (MQ=255) | GGTATCGGTTTAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTA > USA300TCH1516_ALE/937058‑937238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |