| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 937,158 | T→A | 16.1% | intergenic (+65/‑66) | USA300HOU_RS04665 → / → pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 937,158 | 0 | T | A | 16.1% | 677.0 / 109.0 | 261 | intergenic (+65/‑66) | USA300HOU_RS04665/pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (109/109); new base A (22/20); total (132/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
TAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACAC > USA300TCH1516_ALE/937068‑937248 | tAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAgtgt > 1:1263901/1‑91 (MQ=255)tAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTAATTTATAAAGTCCTTCAgtgt > 2:473133/1‑91 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATGAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTc > 2:3902961/1‑91 (MQ=255) aGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTc < 2:3459499/91‑1 (MQ=255) cATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGacac < 2:2429805/91‑1 (MQ=255) cATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGacac < 1:2416374/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACt < 2:2658237/91‑1 (MQ=255) aTTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACt < 2:1467843/91‑1 (MQ=255) tCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGa > 1:271272/1‑91 (MQ=255) cagaaaaGGTAAATTCTATGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAGAATTAAATTATGCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGaa < 2:1814933/88‑1 (MQ=38) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGaa > 2:2464383/1‑91 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGaa < 1:1670324/91‑1 (MQ=255) cAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGaa < 1:3652043/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAg > 2:1918051/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAgg < 1:1508803/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAgg < 1:2242570/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAggg < 1:2579496/91‑1 (MQ=255) aaaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAgga < 1:3291582/91‑2 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 2:3033680/91‑1 (MQ=255) aGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACtt < 1:155035/91‑1 (MQ=38) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt > 1:2119079/1‑91 (MQ=255) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt > 2:1743678/1‑91 (MQ=255) gTAAAGTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAGAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTa < 2:2643814/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAtt < 1:3592571/91‑1 (MQ=255) aTTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgt < 1:380271/91‑1 (MQ=255) tCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgttg < 2:313532/91‑1 (MQ=255) tCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgttg < 2:1034111/91‑1 (MQ=255) tAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAGCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCGCTGAAGGGCTTTATTGTTGTa < 2:1044917/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc > 2:1501427/1‑91 (MQ=255) gCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACaa > 1:1723948/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt > 1:1736900/1‑91 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCCTTTCTAAAGTCCTTCAGTGTCACTGACGGGCTCTATTGTTGTACAATTTGa > 1:1229529/1‑91 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGa < 2:335382/91‑1 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGa > 1:1871164/1‑91 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGa < 1:3545268/91‑1 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:2097395/1‑91 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:2555464/1‑91 (MQ=255) taaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGt < 2:3571774/91‑1 (MQ=255) taaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGt < 1:2296246/91‑1 (MQ=255) aaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTg > 2:2365833/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg < 1:1091313/91‑1 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATACATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTAATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAg > 2:3024799/1‑91 (MQ=255) aGTTTAAGATAAATACATAAAATTAAATTATTAATTTATAAAGTCCTTCAGTGTTAATGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg > 2:364832/1‑91 (MQ=255) tttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTa > 2:1867945/1‑91 (MQ=255) ttCAGCTAAACCCATAAAATTAAATGATGCATTTATAGAGTCCGTCAGTGTCACTGAAGGGCGTTATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAGTaa < 2:179115/91‑1 (MQ=255) tCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAAc < 2:2161350/91‑1 (MQ=255) cAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACa > 1:3473312/1‑91 (MQ=255) gCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACata < 1:2473669/91‑1 (MQ=255) tAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATc < 2:2784800/91‑1 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTGACATATCaa > 1:3788939/1‑91 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaa > 1:1199489/1‑91 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 2:297277/91‑1 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 1:2263980/91‑1 (MQ=255) cacaTAAAATTGAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGCTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAAt < 2:3024343/91‑1 (MQ=255) cacaTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAAt > 1:838738/1‑91 (MQ=255) cacaTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGGAACATATCAAAt < 1:3056224/91‑1 (MQ=255) caTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCt < 1:1139211/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTa > 1:412395/1‑91 (MQ=255) tAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTaa > 2:245861/1‑91 (MQ=255) aaattaaattATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAagg > 1:3864574/1‑91 (MQ=255) aattaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGAGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACACTTGGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAagga > 2:675429/1‑91 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3927034/91‑1 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATAGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3419759/91‑1 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt < 1:2662812/91‑1 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt > 1:1802090/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa > 1:1326830/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa < 1:3041173/91‑1 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc > 2:810161/1‑91 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc > 1:505831/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTCCAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTCAGGAGGTACATTa > 1:3961720/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACACTTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTCCATTa > 2:1679005/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa > 1:2172369/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa < 2:525529/91‑1 (MQ=255) aacaataAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa > 2:1213507/5‑91 (MQ=25) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTCATGTTGTACAATCTGAAGTGAGTAACATATAAAATCTAAGGCGGTACAGTATGaa > 2:1143619/1‑91 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAATTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 1:3343707/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 2:1195055/91‑1 (MQ=255) taAAGTCCTTCCGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTAGTAATTtta > 2:3500625/1‑91 (MQ=255) taAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTtta > 1:142448/1‑91 (MQ=38) taAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTtta > 1:1370591/1‑91 (MQ=38) aaaGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaa > 1:1899729/1‑91 (MQ=255) aGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaat < 1:2398576/91‑1 (MQ=255) gcccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTCAGGAGGTACATTATGAATTttaaatt > 2:1283986/3‑91 (MQ=38) gcccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatt > 1:886565/3‑91 (MQ=38) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 2:1955424/1‑91 (MQ=255) ccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAATGAGGTACATTATGAATTttaaattaa > 2:3419624/1‑91 (MQ=255) cTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaattaaa < 2:471323/91‑1 (MQ=255) ttCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTtaaattaaat > 1:1178714/1‑91 (MQ=255) ttCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTtaaattaaat > 2:1603411/1‑91 (MQ=255) cAGTGTCGCTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATAGCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATaa < 2:1345151/91‑1 (MQ=255) cAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATat > 2:3932044/1‑90 (MQ=255) cAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATaa > 1:276750/1‑91 (MQ=255) aGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:264808/1‑91 (MQ=255) aGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac < 2:2713986/91‑1 (MQ=255) aGTGACACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:621578/1‑91 (MQ=255) aGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:1133678/1‑91 (MQ=255) gtgtCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAaca > 1:2880423/1‑91 (MQ=255) gtgtCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAaca > 1:2941015/1‑91 (MQ=255) gtCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAacaca < 2:2849664/91‑1 (MQ=255) tCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAacacac > 2:2230113/1‑91 (MQ=255) | TAGCATTCAAAAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACAC > USA300TCH1516_ALE/937068‑937248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |